52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3442 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3751  hypothetical protein  99.8 
 
 		 499 aa  971    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0972722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3442  hypothetical protein  100 
 
 		 499 aa  972    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.41425  normal  0.022696 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5552  hypothetical protein  80.58 
 
 		 498 aa  733    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.508667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3638  hypothetical protein  97.79 
 
 		 500 aa  950    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.689622  normal  0.0322237 
 
 
-
 
NC_004310  BR1534  hypothetical protein  63.81 
 
 		 513 aa  588  1e-167  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.74675  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1483  hypothetical protein  64.02 
 
 		 511 aa  590  1e-167  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16085  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1632  hypothetical protein  63.24 
 
 		 514 aa  587  1e-166  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2283  AAA ATPase  65.3 
 
 		 511 aa  578  1e-164  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.635866 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1920  hypothetical protein  60.36 
 
 		 526 aa  578  1e-164  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1948  AAA ATPase  59.92 
 
 		 503 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.315114  normal  0.618024 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7061  AAA ATPase  66.6 
 
 		 500 aa  570  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0332905  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2157  AAA ATPase  60.53 
 
 		 504 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.969754  normal  0.641302 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1515  AAA ATPase  58.86 
 
 		 504 aa  546  1e-154  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1579  ATPase-like protein  61.84 
 
 		 498 aa  535  1e-151  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0994986  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6246  AAA ATPase  65.64 
 
 		 520 aa  534  1e-150  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0844208 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6263  hypothetical protein  60.08 
 
 		 504 aa  523  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.311693 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2732  hypothetical protein  59.68 
 
 		 510 aa  520  1e-146  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.393853  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2167  AAA ATPase  59.55 
 
 		 507 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.283139  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3413  ATPase  58.82 
 
 		 516 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.747505 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0592  hypothetical protein  60.58 
 
 		 498 aa  511  1e-143  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000492944 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2035  ATPase  60.08 
 
 		 506 aa  510  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.322219 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4482  ATPase  58.86 
 
 		 502 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.197027 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3657  ATPase-like protein  56.57 
 
 		 490 aa  498  1e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.16812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1720  ATPase  55.58 
 
 		 504 aa  468  9.999999999999999e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0461  ATPase  54.53 
 
 		 492 aa  464  1e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0252  ATPase-like protein  27.76 
 
 		 537 aa  103  6e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2778  hypothetical protein  27.2 
 
 		 580 aa  61.6  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145513  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1865  hypothetical protein  25.65 
 
 		 655 aa  60.8  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0131162 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3041  protein of unknown function DUF87  29.18 
 
 		 744 aa  60.5  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2369  hypothetical protein  27.2 
 
 		 659 aa  57  0.0000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.70292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5115  hypothetical protein  27.9 
 
 		 595 aa  56.2  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0355  ATPase-like protein  23.38 
 
 		 250 aa  52.8  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8838  hypothetical protein  39.84 
 
 		 572 aa  52  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.139707 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1112  hypothetical protein  33.33 
 
 		 524 aa  52  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  28.21 
 
 		 523 aa  48.9  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3486  ATPase-like protein  31.15 
 
 		 574 aa  48.9  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.123894  normal  0.207133 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1610  hypothetical protein  27.35 
 
 		 628 aa  48.5  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.891235 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0756  hypothetical protein  32.81 
 
 		 645 aa  48.5  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00608077 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2164  hypothetical protein  37.14 
 
 		 582 aa  47.4  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000710411 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5935  hypothetical protein  27.05 
 
 		 608 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0918921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5533  hypothetical protein  27.05 
 
 		 608 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.423742  normal  0.336707 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0443  protein of unknown function DUF87  28.24 
 
 		 360 aa  47.4  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0177789  normal  0.220913 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5073  ATPase-like  30.06 
 
 		 567 aa  47.4  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3925  protein of unknown function DUF87  27.33 
 
 		 581 aa  47.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1359  hypothetical protein  34.57 
 
 		 570 aa  45.8  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997931 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1723  hypothetical protein  26.5 
 
 		 524 aa  45.8  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  28.03 
 
 		 531 aa  44.7  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4576  ATPase-like protein  34.25 
 
 		 664 aa  44.7  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26835  normal  0.0312719 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1877  protein of unknown function DUF87  20.21 
 
 		 560 aa  44.7  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5114  AAA ATPase  32.35 
 
 		 1076 aa  44.3  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078899 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4980  hypothetical protein  30.83 
 
 		 570 aa  43.9  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0753  protein of unknown function DUF87  32.29 
 
 		 506 aa  43.5  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0799035  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>