More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2000 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2000  guanylate kinase  100 
 
 		 223 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0607745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2277  guanylate kinase  100 
 
 		 223 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.140709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1953  guanylate kinase  95.07 
 
 		 223 aa  422  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217119  normal  0.0786696 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3720  guanylate kinase  81.65 
 
 		 220 aa  335  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0647286  normal  0.109171 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3193  guanylate kinase  79.23 
 
 		 219 aa  319  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2781  guanylate kinase  77.4 
 
 		 219 aa  314  7e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0988  guanylate kinase  62.62 
 
 		 234 aa  261  6e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0107524 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1535  guanylate kinase  57.94 
 
 		 220 aa  261  6.999999999999999e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0748909  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0759  guanylate kinase  58.88 
 
 		 219 aa  259  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.784504  normal  0.122144 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1763  guanylate kinase  58.45 
 
 		 218 aa  252  3e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.201865  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0464  guanylate kinase  58.45 
 
 		 220 aa  252  4.0000000000000004e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.328382  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0469  guanylate kinase  58.45 
 
 		 220 aa  252  4.0000000000000004e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.149667  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1062  guanylate kinase  57.49 
 
 		 220 aa  250  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0143004 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1205  guanylate kinase  57.49 
 
 		 220 aa  248  7e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.197853  hitchhiker  0.00108752 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1683  guanylate kinase  57.77 
 
 		 219 aa  248  7e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0576  guanylate kinase  57 
 
 		 220 aa  245  4e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.400734  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2348  guanylate kinase  57.77 
 
 		 219 aa  244  6.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3823  guanylate kinase  57.21 
 
 		 219 aa  241  7e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.162212 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1290  guanylate kinase  61.76 
 
 		 205 aa  237  1e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.609971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2305  guanylate kinase  54.85 
 
 		 219 aa  237  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00214709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0502  guanylate kinase  55.12 
 
 		 221 aa  228  5e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2974  guanylate kinase  51.43 
 
 		 219 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3479  guanylate kinase  51.39 
 
 		 220 aa  224  8e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2472  guanylate kinase  50.47 
 
 		 220 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1845  guanylate kinase  52.13 
 
 		 230 aa  219  3.9999999999999997e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0429  guanylate kinase  53.96 
 
 		 218 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3136  guanylate kinase  51.96 
 
 		 231 aa  214  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.328978 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3936  guanylate kinase  51.66 
 
 		 212 aa  211  9e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2714  guanylate kinase  48.33 
 
 		 213 aa  210  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3354  guanylate kinase  53.66 
 
 		 212 aa  209  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1529  guanylate kinase  50.48 
 
 		 217 aa  207  9e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.2579 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1563  guanylate kinase  53.59 
 
 		 211 aa  207  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.106259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2919  guanylate kinase  53.11 
 
 		 211 aa  205  4e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3155  guanylate kinase  48.29 
 
 		 220 aa  202  4e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2523  guanylate kinase  48.04 
 
 		 214 aa  201  6e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1220  guanylate kinase  50.49 
 
 		 218 aa  200  1.9999999999999998e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.289802 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00630  guanylate kinase  46.12 
 
 		 207 aa  196  3e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1104  guanylate kinase  50.49 
 
 		 211 aa  195  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.631702  normal  0.011032 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001862  guanylate kinase  46.12 
 
 		 207 aa  195  4.0000000000000005e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1266  guanylate kinase  47.47 
 
 		 217 aa  193  2e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.979121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2440  guanylate kinase  46.89 
 
 		 218 aa  190  2e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000682251 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5842  guanylate kinase  48.72 
 
 		 259 aa  186  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.509377 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2444  guanylate kinase  49.22 
 
 		 203 aa  185  4e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.337517 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0052  guanylate kinase  45.71 
 
 		 210 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00408303  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1003  guanylate kinase  51.22 
 
 		 221 aa  184  1.0000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0210  guanylate kinase  44.17 
 
 		 207 aa  183  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2280  guanylate kinase  43.2 
 
 		 229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0360  guanylate kinase  46.24 
 
 		 210 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0353  guanylate kinase  46.24 
 
 		 210 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0355  guanylate kinase  46.24 
 
 		 210 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.398163  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3630  guanylate kinase  45.7 
 
 		 224 aa  180  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.09026  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0363  guanylate kinase  45.7 
 
 		 210 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000053777 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0563  guanylate kinase  48.42 
 
 		 212 aa  178  4.999999999999999e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3623  guanylate kinase  42.86 
 
 		 207 aa  178  4.999999999999999e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0717  guanylate kinase  48.42 
 
 		 212 aa  178  4.999999999999999e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000116826 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03505  guanylate kinase  44.27 
 
 		 207 aa  177  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0057  Guanylate kinase  44.27 
 
 		 207 aa  177  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4151  guanylate kinase  44.27 
 
 		 207 aa  177  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3983  guanylate kinase  44.27 
 
 		 207 aa  177  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0063  guanylate kinase  44.27 
 
 		 207 aa  177  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240109 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3859  guanylate kinase  44.27 
 
 		 207 aa  177  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4099  guanylate kinase  44.27 
 
 		 207 aa  177  1e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3433  guanylate kinase  44.44 
 
 		 207 aa  177  1e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21703  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4019  guanylate kinase  48.42 
 
 		 204 aa  177  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.565127  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03457  hypothetical protein  44.27 
 
 		 207 aa  177  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5020  guanylate kinase  44.27 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0347  guanylate kinase  41.62 
 
 		 215 aa  176  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4145  guanylate kinase  45.83 
 
 		 207 aa  176  3e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0361  guanylate kinase  44.62 
 
 		 207 aa  175  4e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3810  guanylate kinase  44.62 
 
 		 207 aa  176  4e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.18291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0856  guanylate kinase  44.44 
 
 		 216 aa  175  5e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0330  guanylate kinase  44.62 
 
 		 224 aa  175  5e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0351596  normal  0.331396 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0100  guanylate kinase  41.8 
 
 		 202 aa  174  8e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0912271  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3613  guanylate kinase  44.09 
 
 		 207 aa  174  9e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0365  guanylate kinase  43.39 
 
 		 207 aa  174  9e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0439  guanylate kinase  45.5 
 
 		 205 aa  173  1.9999999999999998e-42  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.483895  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1700  guanylate kinase  41.58 
 
 		 200 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3877  guanylate kinase  43.14 
 
 		 210 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0099  guanylate kinase  42.86 
 
 		 204 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.261524  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1761  guanylate kinase  40.51 
 
 		 207 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3845  guanylate kinase  45.18 
 
 		 202 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1406  Guanylate kinase  48.99 
 
 		 202 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.77411  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3948  guanylate kinase  43.23 
 
 		 207 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531185 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4127  guanylate kinase  43.23 
 
 		 207 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.514606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4020  guanylate kinase  43.23 
 
 		 207 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4066  guanylate kinase  43.23 
 
 		 207 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00153  guanylate kinase  44.33 
 
 		 213 aa  172  2.9999999999999996e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0558456  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3957  guanylate kinase  43.23 
 
 		 207 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0336  guanylate kinase  44.62 
 
 		 207 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.57704 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3894  guanylate kinase  44.27 
 
 		 200 aa  171  5e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000112061  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0874  guanylate kinase  44.74 
 
 		 205 aa  171  5e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000405091  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0266  guanylate kinase  43.75 
 
 		 207 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3948  guanylate kinase  44.27 
 
 		 207 aa  171  5.999999999999999e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.498976  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1597  guanylate kinase  45.36 
 
 		 197 aa  171  6.999999999999999e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00198885  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2001  guanylate kinase  40 
 
 		 216 aa  171  6.999999999999999e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1719  guanylate kinase  40 
 
 		 216 aa  171  6.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4384  guanylate kinase  45.74 
 
 		 207 aa  171  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0211  guanylate kinase  43.65 
 
 		 214 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0322  guanylate kinase  40 
 
 		 209 aa  170  1e-41  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.254004  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0048  guanylate kinase  44.5 
 
 		 202 aa  170  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>