More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0874 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0874  guanylate kinase  100 
 
 		 205 aa  411  1e-114  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000405091  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1035  guanylate kinase  50.26 
 
 		 199 aa  180  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0785  guanylate kinase  49.46 
 
 		 201 aa  180  1e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000101008  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0765  Guanylate kinase  47.06 
 
 		 216 aa  180  2e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0958444  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001862  guanylate kinase  46.88 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3155  guanylate kinase  43.39 
 
 		 220 aa  176  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0052  guanylate kinase  46.74 
 
 		 210 aa  175  4e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00408303  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2003  guanylate kinase  44.09 
 
 		 216 aa  175  5e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3630  guanylate kinase  47.57 
 
 		 224 aa  174  6e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.09026  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0048  guanylate kinase  45.5 
 
 		 202 aa  174  9e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3623  guanylate kinase  46.74 
 
 		 207 aa  173  9.999999999999999e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0336  guanylate kinase  47.03 
 
 		 207 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.57704 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00630  guanylate kinase  46.88 
 
 		 207 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4581  guanylate kinase  48.65 
 
 		 207 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.877029  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4384  guanylate kinase  46.49 
 
 		 207 aa  173  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1104  guanylate kinase  42.86 
 
 		 211 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.631702  normal  0.011032 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0360  guanylate kinase  45.95 
 
 		 210 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0355  guanylate kinase  45.95 
 
 		 210 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.398163  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0353  guanylate kinase  45.95 
 
 		 210 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2975  guanylate kinase  43.68 
 
 		 204 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2280  guanylate kinase  47.92 
 
 		 229 aa  172  3.9999999999999995e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0330  guanylate kinase  46.49 
 
 		 224 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0351596  normal  0.331396 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0843  guanylate kinase  42.55 
 
 		 204 aa  172  3.9999999999999995e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2000  guanylate kinase  44.74 
 
 		 223 aa  171  5e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0607745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2277  guanylate kinase  44.74 
 
 		 223 aa  171  5e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.140709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3613  guanylate kinase  45.95 
 
 		 207 aa  171  5e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0210  guanylate kinase  46.35 
 
 		 207 aa  171  5e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3810  guanylate kinase  45.95 
 
 		 207 aa  171  5e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.18291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0363  guanylate kinase  45.41 
 
 		 210 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000053777 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0361  guanylate kinase  46.49 
 
 		 207 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2348  guanylate kinase  42.86 
 
 		 219 aa  171  6.999999999999999e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1535  guanylate kinase  39.68 
 
 		 220 aa  171  9e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0748909  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0407  guanylate kinase  43.62 
 
 		 206 aa  170  1e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.360667  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1780  guanylate kinase  43.62 
 
 		 206 aa  170  1e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0438453  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1683  guanylate kinase  41.8 
 
 		 219 aa  170  1e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3497  guanylate kinase  45.45 
 
 		 207 aa  170  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1212  guanylate kinase  42.33 
 
 		 203 aa  169  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3823  guanylate kinase  42.86 
 
 		 219 aa  169  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.162212 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3845  guanylate kinase  42.93 
 
 		 202 aa  169  3e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1457  guanylate kinase  47.09 
 
 		 212 aa  169  3e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1677  guanylate kinase  48.13 
 
 		 217 aa  168  4e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5344  guanylate kinase  40.91 
 
 		 206 aa  168  4e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0394211 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1062  guanylate kinase  40.21 
 
 		 220 aa  168  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0143004 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2444  guanylate kinase  40.21 
 
 		 203 aa  168  6e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.337517 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5204  guanylate kinase  40.91 
 
 		 206 aa  167  7e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.952406  normal  0.288026 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1285  guanylate kinase  45.21 
 
 		 210 aa  167  7e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000194386  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2138  guanylate kinase  45.11 
 
 		 205 aa  167  7e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.585915  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0756  guanylate kinase  42.02 
 
 		 204 aa  167  7e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5296  guanylate kinase  40.4 
 
 		 206 aa  167  9e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0446222  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1205  guanylate kinase  39.68 
 
 		 220 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.197853  hitchhiker  0.00108752 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0634  guanylate kinase  43.24 
 
 		 210 aa  167  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1953  guanylate kinase  43.68 
 
 		 223 aa  166  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217119  normal  0.0786696 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3433  guanylate kinase  45.11 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21703  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0502  guanylate kinase  43.92 
 
 		 221 aa  165  4e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1700  guanylate kinase  43.98 
 
 		 200 aa  165  4e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1078  guanylate kinase  43.78 
 
 		 212 aa  165  4e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09810  Guanylate kinase  44.92 
 
 		 194 aa  165  5e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2472  guanylate kinase  40.21 
 
 		 220 aa  165  5e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0988  guanylate kinase  43.16 
 
 		 234 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0107524 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1761  guanylate kinase  44.68 
 
 		 207 aa  164  5.9999999999999996e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0365  guanylate kinase  43.78 
 
 		 207 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0266  guanylate kinase  44.32 
 
 		 207 aa  164  9e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5549  guanylate kinase  41.71 
 
 		 206 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00153  guanylate kinase  41.8 
 
 		 213 aa  163  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0558456  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4145  guanylate kinase  43.75 
 
 		 207 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2974  guanylate kinase  39.68 
 
 		 219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0035  guanylate kinase  42.63 
 
 		 209 aa  162  3e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0177  guanylate kinase  41.85 
 
 		 206 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000695034 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2714  guanylate kinase  41.27 
 
 		 213 aa  162  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0347  guanylate kinase  41.24 
 
 		 215 aa  162  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0100  guanylate kinase  44.5 
 
 		 202 aa  162  3e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0912271  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0976  guanylate kinase  44.15 
 
 		 211 aa  162  4.0000000000000004e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.194665  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0091  guanylate kinase  41.87 
 
 		 207 aa  162  4.0000000000000004e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2523  guanylate kinase  40.21 
 
 		 214 aa  161  5.0000000000000005e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0717  guanylate kinase  40.86 
 
 		 212 aa  161  7e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000116826 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0563  guanylate kinase  40.86 
 
 		 212 aa  161  7e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03505  guanylate kinase  42.71 
 
 		 207 aa  161  8.000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0057  Guanylate kinase  42.71 
 
 		 207 aa  161  8.000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0063  guanylate kinase  42.71 
 
 		 207 aa  161  8.000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240109 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3859  guanylate kinase  42.71 
 
 		 207 aa  161  8.000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03457  hypothetical protein  42.71 
 
 		 207 aa  161  8.000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3260  guanylate kinase  38.62 
 
 		 221 aa  161  8.000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4151  guanylate kinase  42.71 
 
 		 207 aa  161  8.000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3983  guanylate kinase  42.71 
 
 		 207 aa  161  8.000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0045  guanylate kinase  43.43 
 
 		 207 aa  160  8.000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4176  guanylate kinase  43.43 
 
 		 207 aa  160  8.000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0297777  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4099  guanylate kinase  42.71 
 
 		 207 aa  161  8.000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0041  guanylate kinase  43.43 
 
 		 207 aa  160  8.000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70440  guanylate kinase  39.57 
 
 		 203 aa  160  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0759  guanylate kinase  40.21 
 
 		 219 aa  160  8.000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.784504  normal  0.122144 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1220  guanylate kinase  44.44 
 
 		 218 aa  160  9e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.289802 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4971  guanylate kinase  44.39 
 
 		 218 aa  160  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4020  guanylate kinase  42.71 
 
 		 207 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3957  guanylate kinase  42.71 
 
 		 207 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3948  guanylate kinase  42.71 
 
 		 207 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531185 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4127  guanylate kinase  42.71 
 
 		 207 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.514606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4066  guanylate kinase  42.71 
 
 		 207 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1329  guanylate kinase  42.05 
 
 		 204 aa  160  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000708025  normal  0.428768 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3630  guanylate kinase  41.4 
 
 		 209 aa  160  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.601224  normal  0.100424 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0837  guanylate kinase  45.11 
 
 		 201 aa  159  2e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0222597 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>