181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1305 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1305  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 		 127 aa  251  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1467  camphor resistance protein CrcB  99.21 
 
 		 127 aa  249  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5116  camphor resistance protein CrcB  77.95 
 
 		 127 aa  202  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1088  camphor resistance protein CrcB  37.6 
 
 		 134 aa  103  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.97219  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3565  camphor resistance protein CrcB  37.6 
 
 		 134 aa  103  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00692175  normal  0.464407 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1142  camphor resistance protein CrcB  37.6 
 
 		 134 aa  103  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.747152  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1325  camphor resistance protein CrcB  45.38 
 
 		 270 aa  97.8  4e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1369  crcB family protein  42.59 
 
 		 254 aa  80.9  0.000000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3466  CrcB protein  34.4 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5442  CrcB protein  38.33 
 
 		 125 aa  62  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258176  normal  0.897038 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4410  camphor resistance protein CrcB  35.54 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.811005 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0457  Camphor resistance CrcB protein  38.79 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.973479  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2546  crcB protein  36.07 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.926417  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1160  camphor resistance protein CrcB  44.16 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2708  hypothetical protein  37.5 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.288842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0731  camphor resistance protein CrcB  34.4 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0685  camphor resistance protein CrcB  34.4 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0789  camphor resistance protein CrcB  34.4 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.136709  normal  0.909292 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0745  camphor resistance protein CrcB  34.4 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0671  camphor resistance protein CrcB  34.4 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00156465  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3001  CrcB protein  35.45 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0511618  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0539  camphor resistance protein CrcB  35.45 
 
 		 127 aa  57  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3020  camphor resistance protein CrcB  35.45 
 
 		 127 aa  57  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00755665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2957  camphor resistance protein CrcB  38.16 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00612605  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3030  camphor resistance protein CrcB  38.16 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0482718  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00594  camphor resistance protein CrcB  34.55 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243224  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0713  camphor resistance protein CrcB  34.55 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000937309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0805  camphor resistance protein CrcB  34.38 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00583  hypothetical protein  34.55 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0676  camphor resistance protein CrcB  34.55 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462452  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0649  camphor resistance protein CrcB  34.55 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00715235  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0645  camphor resistance protein CrcB  34.55 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0119753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4407  camphor resistance protein CrcB  34.17 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0816  camphor resistance protein CrcB  35.42 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2349  CrcB protein  36 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  32.23 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  39.74 
 
 		 124 aa  53.5  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1857  camphor resistance protein CrcB  36.84 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0249161  normal  0.58099 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  31.45 
 
 		 125 aa  53.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  32.23 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1600  camphor resistance protein CrcB  37.08 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.41093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4047  camphor resistance protein CrcB  35.79 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  30.89 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1762  camphor resistance protein CrcB  39.33 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  36.25 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2451  camphor resistance protein CrcB  36.84 
 
 		 147 aa  52  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0795887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  33.06 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2870  camphor resistance protein CrcB  37.36 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5461  camphor resistance protein CrcB  34.21 
 
 		 124 aa  50.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.0525168 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  35.9 
 
 		 124 aa  50.8  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  37.18 
 
 		 124 aa  50.8  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2040  camphor resistance protein CrcB  32.76 
 
 		 129 aa  50.4  0.000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.385836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1192  CrcB protein  36.84 
 
 		 127 aa  50.8  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1949  camphor resistance protein CrcB  36.36 
 
 		 131 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787488  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  32.76 
 
 		 133 aa  50.4  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0815  CrcB protein  30.77 
 
 		 116 aa  50.4  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  35.8 
 
 		 124 aa  50.4  0.000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0477  CrcB protein  33.93 
 
 		 125 aa  50.1  0.000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.355934  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  35.9 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1891  camphor resistance protein CrcB  36.97 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  32.2 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A24  camphor resistance protein CrcB  37.19 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1326  crcB protein  36.56 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  34.62 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0954  camphor resistance protein CrcB  33.04 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0467  camphor resistance protein CrcB  32.29 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0946  camphor resistance protein CrcB  32.29 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.329935  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2559  camphor resistance protein CrcB  34.82 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0524  camphor resistance protein CrcB  41.33 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0908  camphor resistance protein CrcB  32.29 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2836  camphor resistance protein CrcB  32.76 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0289291  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0200  camphor resistance protein CrcB  32.74 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.299206  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  30.89 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  41.25 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3560  CrcB protein  34.19 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511649  normal  0.0272637 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2160  camphor resistance protein CrcB  33 
 
 		 128 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.105328  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  28.95 
 
 		 124 aa  47.8  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0749  camphor resistance protein CrcB  33 
 
 		 128 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2583  camphor resistance protein CrcB  33 
 
 		 128 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  34.62 
 
 		 124 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2030  camphor resistance protein CrcB  33 
 
 		 128 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2802  camphor resistance protein CrcB  31.58 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.963327  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  34.62 
 
 		 124 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1084  CrcB protein  35.37 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1370  camphor resistance protein CrcB  35.87 
 
 		 129 aa  47.4  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0395  CrcB protein  33.94 
 
 		 124 aa  47.4  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  36.64 
 
 		 125 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  34.62 
 
 		 124 aa  47  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  34.62 
 
 		 124 aa  47  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  34.62 
 
 		 124 aa  47  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  30.43 
 
 		 124 aa  47  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2973  CrcB protein  37.8 
 
 		 127 aa  47  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0130018  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  31.3 
 
 		 124 aa  46.2  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1520  camphor resistance protein CrcB  32 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000607454  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  32.43 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1125  CrcB protein  39.19 
 
 		 129 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  34.62 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0314  integral membrane protein  36.67 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.390105 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>