55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1120 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1120  hypothetical protein  100 
 
 		 217 aa  441  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1270  hypothetical protein  96.31 
 
 		 217 aa  426  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6034  hypothetical protein  69.95 
 
 		 211 aa  301  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.335724  normal  0.0737922 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2718  hypothetical protein  60.29 
 
 		 217 aa  259  2e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0525784  normal  0.0841779 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1822  Methyltransferase type 11  48.26 
 
 		 213 aa  191  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00574627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1330  hypothetical protein  53.3 
 
 		 218 aa  186  2e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3179  hypothetical protein  51.38 
 
 		 216 aa  178  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2938  Methyltransferase type 11  51.38 
 
 		 216 aa  178  7e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1926  Methyltransferase type 11  51.09 
 
 		 213 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1031  hypothetical protein  46.73 
 
 		 217 aa  173  1.9999999999999998e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0256527  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1476  hypothetical protein  48.74 
 
 		 218 aa  171  6.999999999999999e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.470823 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37443  predicted protein  48.82 
 
 		 279 aa  171  1e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0385962  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27591  predicted protein  46.6 
 
 		 241 aa  170  2e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.861459  normal  0.248845 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1977  hypothetical protein  52.44 
 
 		 217 aa  170  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.183577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3170  methyltransferase type 11  48.04 
 
 		 219 aa  169  3e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0295556  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1009  Methyltransferase type 11  48.1 
 
 		 215 aa  167  9e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00599159  normal  0.0418085 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14201  hypothetical protein  46.55 
 
 		 217 aa  166  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432496 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2053  methyltransferase type 11  40.74 
 
 		 221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.617016 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13313  predicted protein  41.97 
 
 		 229 aa  162  3e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10751  hypothetical protein  46.67 
 
 		 215 aa  162  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14191  predicted protein  43.54 
 
 		 225 aa  160  9e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1722  hypothetical protein  40.93 
 
 		 350 aa  158  7e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0372  SAM-dependent methyltransferase  48.73 
 
 		 216 aa  157  9e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.118814  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10541  hypothetical protein  48.1 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.864146  hitchhiker  0.00665566 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1828  Methyltransferase type 12  46.29 
 
 		 412 aa  153  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.358298  hitchhiker  0.0000267475 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13391  hypothetical protein  41.3 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.417782  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1540  methyltransferase type 11  40.95 
 
 		 402 aa  149  3e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000274527  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0525  Methyltransferase type 11  43.5 
 
 		 237 aa  144  8.000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13458  predicted protein  42.94 
 
 		 207 aa  143  2e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1320  Methyltransferase type 11  45.83 
 
 		 315 aa  142  5e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.065684 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_4604  predicted protein  44.44 
 
 		 209 aa  141  6e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0142714  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2330  hypothetical protein  44.13 
 
 		 403 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0440768  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0445  Methyltransferase type 11  41.82 
 
 		 399 aa  136  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.832039  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13691  hypothetical protein  38.82 
 
 		 212 aa  135  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0487979  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13601  hypothetical protein  37.65 
 
 		 212 aa  135  6.0000000000000005e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1268  hypothetical protein  37.87 
 
 		 212 aa  132  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.391733  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0224  hypothetical protein  35.78 
 
 		 214 aa  119  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0587288  normal  0.156271 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0365  biotin biosynthesis protein BioC  40.3 
 
 		 272 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0395  biotin biosynthesis protein BioC  38.81 
 
 		 272 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0883344  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0636  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 275 aa  46.6  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24189  normal  0.300979 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0391  biotin biosynthesis protein BioC  38.81 
 
 		 276 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_51541  methionine-dependent methyltransferase  24.69 
 
 		 214 aa  46.2  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4035  ArsR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 312 aa  45.8  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1427  Methyltransferase type 11  35.19 
 
 		 220 aa  43.9  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00176149  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1633  Methyltransferase type 11  40 
 
 		 264 aa  43.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0213004 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0463  methyltransferase type 11  39.39 
 
 		 197 aa  43.1  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.115014  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  43.75 
 
 		 248 aa  42.7  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4837  biotin biosynthesis protein BioC  38.81 
 
 		 272 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.672386 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0883  Methyltransferase type 11  40.43 
 
 		 282 aa  42.7  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.049134 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3889  methyltransferase type 11  42.55 
 
 		 281 aa  42.7  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  32.04 
 
 		 196 aa  42.4  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3485  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  33.66 
 
 		 197 aa  42.4  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.171708 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0559  methyltransferase type 11  35.79 
 
 		 216 aa  42  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  29.03 
 
 		 258 aa  42.4  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  38.46 
 
 		 283 aa  42.4  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>