More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0200 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0284  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  86.99 
 
 		 688 aa  1135    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.533678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0143  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  98.1 
 
 		 684 aa  1340    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.279801  normal  0.574504 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0200  HAD family hydrolase  100 
 
 		 684 aa  1367    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.70537 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2267  sucrose-phosphate phosphatase  43.04 
 
 		 721 aa  503  1e-141  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0311712  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2312  sucrose-phosphate synthase  42.59 
 
 		 723 aa  492  1e-137  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.407263 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3516  sucrose-phosphate synthase  39.86 
 
 		 716 aa  480  1e-134  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0708  sucrose-phosphate synthase  40.46 
 
 		 722 aa  473  1e-132  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3069  HAD family hydrolase  38.49 
 
 		 720 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2912  sucrose-phosphate synthase  38.23 
 
 		 718 aa  464  1e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2610  sucrose-phosphate synthase, glycosyltransferase region  37.68 
 
 		 725 aa  462  9.999999999999999e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1794  sucrose-phosphate synthase  38.26 
 
 		 724 aa  449  1e-125  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.399032  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0808  HAD family hydrolase  36.97 
 
 		 709 aa  448  1.0000000000000001e-124  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1551  sucrose phosphate synthase  39.04 
 
 		 714 aa  437  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1267  sucrose-phosphate synthase  39.04 
 
 		 714 aa  437  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.327347 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0650  sucrose-phosphate synthase  36.23 
 
 		 735 aa  410  1e-113  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.238518  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3967  sucrose-phosphate phosphatase subfamily protein  33.33 
 
 		 729 aa  404  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.205238  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3683  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  34.8 
 
 		 762 aa  394  1e-108  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1322  sucrose-phosphate synthase  33.99 
 
 		 708 aa  385  1e-105  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.435001  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21951  sucrose phosphate synthase  34.22 
 
 		 702 aa  381  1e-104  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.269726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2689  sucrose-phosphate synthase  36.46 
 
 		 707 aa  378  1e-103  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.288748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2315  sucrose-phosphate synthase  36.53 
 
 		 709 aa  373  1e-102  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30171  sucrose phosphate synthase  36.42 
 
 		 707 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.169301 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0227  sucrose-phosphate synthase  35.38 
 
 		 784 aa  365  2e-99  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0132674  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19201  sucrose phosphate synthase  37.24 
 
 		 469 aa  313  1e-83  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.8791  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_19011  sucrose phosphate synthase  36.78 
 
 		 469 aa  308  3e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.799465  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1803  sucrose-phosphate synthase  36.32 
 
 		 469 aa  302  1e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_19021  sucrose phosphate synthase  37.21 
 
 		 470 aa  300  7e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.756574  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18491  sucrose phosphate synthase  37.93 
 
 		 466 aa  292  1e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.179299 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18210  Sucrose-phosphate synthase  27.67 
 
 		 496 aa  172  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.338675  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0446  sucrose-phosphate synthase  28.31 
 
 		 479 aa  150  7e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1867  sucrose-phosphate synthase  27.8 
 
 		 472 aa  145  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1752  Sucrose synthase  26.04 
 
 		 806 aa  143  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4592  sucrose phosphatase  33.87 
 
 		 252 aa  137  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.418746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1552  sucrose synthase, putative  29.03 
 
 		 814 aa  136  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1268  Sucrose synthase  29.03 
 
 		 793 aa  136  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.209481  normal  0.340227 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2283  sucrose synthase, glycosyl transferase, group 1  26.11 
 
 		 806 aa  133  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.356959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4476  sucrose phosphatase  33.88 
 
 		 249 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2266  sucrose synthase  27.2 
 
 		 794 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.856509  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3776  Sucrose synthase  26.67 
 
 		 805 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1623  putative sucrose-6F-phosphate phosphohydrolase  30.17 
 
 		 247 aa  121  4.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0026077  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0177  Sucrose synthase  27.53 
 
 		 792 aa  118  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  29.55 
 
 		 482 aa  115  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0398  glycosyl transferase group 1  28.44 
 
 		 448 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348364  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.05 
 
 		 443 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.05 
 
 		 443 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.05 
 
 		 498 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3068  sucrose synthase  26.13 
 
 		 795 aa  112  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.43 
 
 		 443 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.43 
 
 		 443 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.43 
 
 		 499 aa  111  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.43 
 
 		 495 aa  111  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0533  sucrose synthase  23.84 
 
 		 423 aa  109  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3753  sucrose synthase, glycosyl transferase, group 1  24.3 
 
 		 805 aa  106  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.115007 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2641  group 1 glycosyl transferase  35.02 
 
 		 397 aa  104  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.102674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  29.56 
 
 		 439 aa  104  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2087  UDP-N-acetylglucosamine  28.91 
 
 		 424 aa  104  6e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  29.56 
 
 		 439 aa  103  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  29.56 
 
 		 439 aa  103  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  27.46 
 
 		 424 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  25.61 
 
 		 435 aa  102  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  30.22 
 
 		 438 aa  101  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3916  Sucrose synthase  24.54 
 
 		 803 aa  100  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.067328 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2821  sucrose-phosphate phosphatase  30.77 
 
 		 249 aa  99.8  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.498458 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  30.28 
 
 		 406 aa  99.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  31.6 
 
 		 421 aa  99.4  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  27.46 
 
 		 425 aa  98.6  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  30.54 
 
 		 438 aa  98.2  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  31 
 
 		 420 aa  98.2  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  26.91 
 
 		 650 aa  98.2  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5953  UDP-N-acetylglucosamine  32.81 
 
 		 443 aa  97.8  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4050  glycosyl transferase, group 1  28.94 
 
 		 458 aa  98.2  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3275  glycosyl transferase group 1  25.87 
 
 		 448 aa  97.1  9e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37662  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  30.54 
 
 		 438 aa  97.1  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  28.89 
 
 		 448 aa  96.3  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  30.03 
 
 		 453 aa  95.9  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  25.69 
 
 		 419 aa  95.1  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  27.55 
 
 		 426 aa  93.6  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  29.76 
 
 		 426 aa  93.6  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  31.09 
 
 		 407 aa  92.8  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  26.96 
 
 		 423 aa  93.2  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4609  UDP-N-acetylglucosamine  31.75 
 
 		 450 aa  93.2  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  31.46 
 
 		 405 aa  92.8  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4935  UDP-N-acetylglucosamine  30.12 
 
 		 466 aa  93.2  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  25.78 
 
 		 422 aa  92.4  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  32.81 
 
 		 422 aa  91.7  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2209  glycosyl transferase group 1  31.01 
 
 		 421 aa  91.3  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0688071 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6757  UDP-N-acetylglucosamine  27.92 
 
 		 417 aa  90.5  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2470  sucrose phosphatase  30 
 
 		 252 aa  90.9  8e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0653  UDP-N-acetylglucosamine  30.98 
 
 		 443 aa  89.7  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2913  putative glycosyltransferase  26.42 
 
 		 434 aa  89.4  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2973  UDP-N-acetylglucosamine  28.3 
 
 		 417 aa  89.7  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  24.72 
 
 		 434 aa  89.7  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1762  glycosyl transferase, group 1  31.23 
 
 		 406 aa  89.7  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.379632 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2609  UDP-N-acetylglucosamine  29.3 
 
 		 420 aa  89  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070619 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  32.59 
 
 		 403 aa  87.4  7e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3515  HAD family hydrolase  31.46 
 
 		 277 aa  87.4  8e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  29.52 
 
 		 428 aa  87  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1310  group 1 glycosyl transferase  28.44 
 
 		 426 aa  87  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 402 aa  86.7  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  27.42 
 
 		 419 aa  85.9  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>