More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0398 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0398  hydantoinase/oxoprolinase  100 
 
 
1277 aa  2600    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2497  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  42.56 
 
 
719 aa  522  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4925  Hydantoin utilization protein A  43.06 
 
 
694 aa  509  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.153977 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4428  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  43.29 
 
 
690 aa  503  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3811  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  41.99 
 
 
693 aa  499  1e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0144893 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00009  hypothetical N-methylhydantoinase (Eurofung)  30.54 
 
 
1362 aa  483  1e-135  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00000169521 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01100  hypothetical 5-oxoprolinase (Eurofung)  30.28 
 
 
1355 aa  486  1e-135  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0381114 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2267  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  42.26 
 
 
697 aa  480  1e-134  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.739176  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1967  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.08 
 
 
683 aa  480  1e-134  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.471219  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1104  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  42.26 
 
 
712 aa  479  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.140171 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1125  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  42.47 
 
 
714 aa  469  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.875999  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5966  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.35 
 
 
694 aa  462  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.858122  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4581  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  40.09 
 
 
690 aa  463  9.999999999999999e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6260  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  40.78 
 
 
691 aa  456  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00292738  normal  0.765217 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5632  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.06 
 
 
698 aa  456  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0796839 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10270  5-oxoprolinase oplA  31.21 
 
 
1209 aa  450  1e-125  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0830899 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9148  hydantoin utilization protein  39.19 
 
 
687 aa  450  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2447  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  35.22 
 
 
683 aa  444  1e-123  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3416  Hydantoinase/oxoprolinase  41.38 
 
 
698 aa  442  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0475  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.79 
 
 
680 aa  439  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3649  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  40.06 
 
 
721 aa  438  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.495656  normal  0.769943 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0004  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.36 
 
 
1218 aa  438  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.521135 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3664  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.79 
 
 
691 aa  435  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00438442 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2083  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.46 
 
 
712 aa  434  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.359641  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8320  hydantoin utilization protein  36.89 
 
 
676 aa  434  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1518  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.03 
 
 
1222 aa  433  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.307655  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2390  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.64 
 
 
1229 aa  432  1e-119  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0152868 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5123  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.89 
 
 
1212 aa  431  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0650369 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2177  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.21 
 
 
1206 aa  431  1e-119  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3601  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.94 
 
 
682 aa  428  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1060  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.03 
 
 
684 aa  429  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1559  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  35.96 
 
 
680 aa  426  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.63787  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3967  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.71 
 
 
1212 aa  426  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0735319 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2907  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.31 
 
 
1242 aa  426  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0182829 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2362  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.89 
 
 
1211 aa  424  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.811931 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3552  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.63 
 
 
1212 aa  425  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4106  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.12 
 
 
1212 aa  425  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.264245  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3345  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.09 
 
 
1258 aa  420  1e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0277673 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0637  hydantoinase/oxoprolinase family protein  30.84 
 
 
1203 aa  420  1e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6536  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.65 
 
 
678 aa  422  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.234426 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3807  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.81 
 
 
1206 aa  422  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1376  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.41 
 
 
1234 aa  419  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0160979  normal  0.0483498 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2407  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.38 
 
 
1205 aa  419  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.743772 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2566  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.71 
 
 
1185 aa  419  9.999999999999999e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5284  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.03 
 
 
1212 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.415558  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0681  hydantoinase/oxoprolinase family protein  30.76 
 
 
1198 aa  414  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1719  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.04 
 
 
688 aa  416  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2299  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.68 
 
 
694 aa  416  1e-114  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375878  normal  0.208319 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4697  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.8 
 
 
692 aa  414  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.599265  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0734  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.31 
 
 
1213 aa  414  1e-114  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5799  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.14 
 
 
1203 aa  416  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0523355 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4343  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.65 
 
 
1206 aa  416  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.808871  normal  0.0662323 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1841  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.15 
 
 
1225 aa  411  1e-113  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.854938  hitchhiker  0.00479666 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2574  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.89 
 
 
1216 aa  411  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.596345 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5220  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.32 
 
 
680 aa  412  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46382  normal  0.858688 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3461  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.03 
 
 
1212 aa  412  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.397296  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2968  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.05 
 
 
1229 aa  411  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0728  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.09 
 
 
649 aa  408  1.0000000000000001e-112  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3957  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  36.1 
 
 
674 aa  408  1.0000000000000001e-112  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3091  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.91 
 
 
681 aa  404  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.435048  normal  0.0725739 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3493  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.84 
 
 
681 aa  404  1e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.875843  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0378  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.71 
 
 
1226 aa  405  1e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1517  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.72 
 
 
1220 aa  405  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.987172 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3765  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  36.72 
 
 
690 aa  404  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.32896  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5834  hydantoin utilization protein  37.07 
 
 
687 aa  405  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302011  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2020  hydantoinase B/oxoprolinase  30.14 
 
 
1218 aa  405  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4353  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.43 
 
 
692 aa  406  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1127  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.68 
 
 
641 aa  401  9.999999999999999e-111  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.814296  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4976  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.57 
 
 
1210 aa  400  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3115  Hydantoinase/oxoprolinase  39.02 
 
 
686 aa  403  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1245  Hydantoinase/oxoprolinase  37.97 
 
 
679 aa  399  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529227  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2860  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.98 
 
 
684 aa  397  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1513  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.95 
 
 
1230 aa  399  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.706946  normal  0.501464 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2529  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.51 
 
 
685 aa  399  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.413249  normal  0.693617 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5474  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  35.21 
 
 
692 aa  395  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0803  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  36.48 
 
 
684 aa  395  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.148951  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9128  hydantoin utilization protein  35.83 
 
 
680 aa  395  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2368  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.78 
 
 
680 aa  395  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.773275  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2410  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.07 
 
 
658 aa  394  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1063  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.6 
 
 
663 aa  396  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.39661  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5648  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.8 
 
 
697 aa  396  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0079  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.2 
 
 
687 aa  394  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3568  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.82 
 
 
701 aa  396  1e-108  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0377  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.59 
 
 
676 aa  396  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0413  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.82 
 
 
648 aa  393  1e-107  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.96856  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1781  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.23 
 
 
1213 aa  393  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0522024  normal  0.0235598 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4193  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.95 
 
 
765 aa  392  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3290  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.89 
 
 
1217 aa  390  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12616  predicted protein  29.09 
 
 
1271 aa  393  1e-107  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.747527  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1392  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.23 
 
 
657 aa  390  1e-107  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.307503  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4028  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  36.6 
 
 
711 aa  393  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1577  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  36.48 
 
 
739 aa  387  1e-106  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3625  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.56 
 
 
1229 aa  389  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218534  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0371  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  35.42 
 
 
707 aa  388  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2093  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.25 
 
 
1190 aa  387  1e-106  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5988  N-methylhydantoinase A (Hydantoin utilization protein A)  36.36 
 
 
685 aa  389  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.553202  normal  0.148202 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1913  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.2 
 
 
684 aa  384  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0388506 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4143  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.95 
 
 
702 aa  384  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3641  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.88 
 
 
676 aa  385  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6263  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  35 
 
 
673 aa  382  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>