More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3390 on replicon NC_014213
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014213  Mesil_3390  hypothetical protein  100 
 
 		 346 aa  703    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.305361  normal  0.967701 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3098  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  47.94 
 
 		 352 aa  292  5e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3452  transcriptional regulator, LacI family  44.97 
 
 		 359 aa  269  5e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2723  transcriptional regulator, LacI family  41.74 
 
 		 347 aa  204  2e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.858464 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1295  transcriptional regulator, LacI family  34.81 
 
 		 345 aa  192  6e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0813478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3382  transcriptional regulator, LacI family  40.18 
 
 		 333 aa  191  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.22035  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4981  transcriptional regulator, LacI family  50.23 
 
 		 253 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00303517  hitchhiker  0.00602163 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2515  transcriptional regulator, LacI family  35.61 
 
 		 357 aa  161  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185479  hitchhiker  0.0043298 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0414  regulatory protein LacI  33.94 
 
 		 333 aa  119  9e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.265718 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.91 
 
 		 330 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 342 aa  115  8.999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6720  transcriptional regulator, LacI family  33.83 
 
 		 374 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.396206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0134  transcriptional regulator, LacI family  31.19 
 
 		 360 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0593  transcriptional regulator, LacI family  30.5 
 
 		 328 aa  114  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4116  alanine racemase  30.48 
 
 		 334 aa  112  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00410  transcriptional regulator, LacI family  28.07 
 
 		 337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0544  LacI family transcription regulator  27.17 
 
 		 335 aa  110  4.0000000000000004e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3179  transcriptional regulator, LacI family  30.6 
 
 		 355 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.588941  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  30.17 
 
 		 353 aa  110  5e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1550  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.45 
 
 		 328 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390905  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3659  transcriptional regulator, LacI family  31.01 
 
 		 343 aa  109  7.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3611  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.25 
 
 		 345 aa  108  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  28.79 
 
 		 339 aa  107  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0292  transcriptional regulator, LacI family  29.77 
 
 		 336 aa  107  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2210  transcriptional regulator, LacI family  28.83 
 
 		 342 aa  106  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1600  LacI family transcription regulator  30.15 
 
 		 328 aa  106  5e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1732  transcriptional regulator, LacI family  29.48 
 
 		 340 aa  106  6e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521835  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  29.39 
 
 		 333 aa  106  7e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8999  transcriptional regulator  32.1 
 
 		 361 aa  105  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4084  HTH-type transcriptional repressor PurR  31.59 
 
 		 346 aa  106  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5609  transcriptional regulator, LacI family  30.41 
 
 		 335 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.918493 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0938  LacI family transcription regulator  30.29 
 
 		 340 aa  104  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0104625  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4670  transcriptional regulator, LacI family  32.65 
 
 		 328 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.659427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  30.77 
 
 		 339 aa  104  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3350  LacI family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 364 aa  104  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0909  LacI family transcription regulator  29.45 
 
 		 338 aa  103  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0699  transcriptional regulator, LacI family  28.7 
 
 		 341 aa  103  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2219  transcriptional regulator, LacI family  28.99 
 
 		 343 aa  103  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000733875  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0794  transcriptional regulator, LacI family  29.72 
 
 		 332 aa  103  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0126496 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2751  transcriptional regulator, LacI family  29.91 
 
 		 335 aa  103  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.360192  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  28.99 
 
 		 326 aa  103  6e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  27.64 
 
 		 335 aa  102  7e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2268  transcriptional regulator, LacI family  30.11 
 
 		 339 aa  102  7e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.580288  hitchhiker  0.000512159 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04250  transcriptional regulator, LacI family  27 
 
 		 337 aa  102  7e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.335349  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0186  transcriptional regulator, LacI family  30.81 
 
 		 330 aa  102  8e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.319705  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4675  transcriptional regulator, LacI family  30.62 
 
 		 335 aa  102  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  31.59 
 
 		 368 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  27.91 
 
 		 338 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0297  LacI family transcription regulator  29.77 
 
 		 340 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1440  maltose operon repressor MalR, putative  26.79 
 
 		 342 aa  101  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0132709  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1093  LacI family transcription regulator  29.73 
 
 		 351 aa  101  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137161  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  28.62 
 
 		 337 aa  101  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  28 
 
 		 342 aa  101  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1296  LacI family transcription regulator  32.43 
 
 		 334 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3140  transcriptional regulator, LacI family  29.65 
 
 		 344 aa  101  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.636128 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4934  transcriptional regulator, LacI family  32.02 
 
 		 336 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.129155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5343  transcriptional regulator, LacI family  30.28 
 
 		 346 aa  100  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.629268  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1846  LacI family transcription regulator  27.11 
 
 		 324 aa  100  4e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0499  LacI family transcription regulator  27.99 
 
 		 330 aa  100  4e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2534  transcriptional regulator, LacI family  29.05 
 
 		 663 aa  100  5e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0777  transcriptional regulator, LacI family  27.38 
 
 		 339 aa  100  5e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000623929 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2711  alanine racemase  26.55 
 
 		 342 aa  99.8  6e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000872573  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3272  LacI family transcription regulator  28.49 
 
 		 352 aa  99.4  7e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1214  transcriptional regulator, LacI family  31.3 
 
 		 333 aa  99.4  7e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000107104  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1559  alanine racemase  27.98 
 
 		 333 aa  99.8  7e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000066632  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0617  transcriptional regulator, LacI family  28.07 
 
 		 334 aa  99.4  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699811  normal  0.372748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2612  transcriptional regulator, LacI family  29.83 
 
 		 342 aa  99.4  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.109106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00429  transcriptional repressor, LacI family protein  29.41 
 
 		 334 aa  99  9e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  31.1 
 
 		 346 aa  98.6  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5756  transcriptional regulator, LacI family  29.61 
 
 		 347 aa  99  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0241  transcriptional regulator, LacI family  31.09 
 
 		 348 aa  98.6  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.268594  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1398  ribose operon repressor RbsR  29.15 
 
 		 334 aa  98.6  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07090  transcriptional regulator  29.84 
 
 		 344 aa  98.2  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.72012 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2858  LacI family transcription regulator  30.34 
 
 		 343 aa  97.8  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.640321  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0352  transcriptional regulator, LacI family  31.98 
 
 		 347 aa  97.8  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00162695  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5012  transcriptional regulator, LacI family  31.5 
 
 		 324 aa  98.2  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3227  LacI family transcription regulator  31.02 
 
 		 362 aa  97.4  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3767  maltose operon transcriptional repressor  26.76 
 
 		 343 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1710  LacI family transcription regulator  29.38 
 
 		 344 aa  97.4  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  29.15 
 
 		 334 aa  97.4  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6278  transcriptional regulator, LacI family  28.29 
 
 		 338 aa  97.4  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4061  maltose operon transcriptional repressor  26.76 
 
 		 343 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0495  LacI family transcription regulator  28.03 
 
 		 354 aa  97.1  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4116  maltose operon transcriptional repressor  26.18 
 
 		 340 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271073  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3838  LacI family transcription regulator  27.06 
 
 		 343 aa  96.7  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11530  transcriptional regulator, LacI family  30.66 
 
 		 331 aa  96.3  6e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00809623 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3751  maltose operon transcriptional repressor  26.76 
 
 		 343 aa  95.9  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0385  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30 
 
 		 354 aa  95.9  9e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29490  transcriptional regulator  30.75 
 
 		 340 aa  95.9  9e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2405  LacI family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 333 aa  95.9  9e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.475476 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4028  maltose operon transcriptional repressor  26.76 
 
 		 343 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3919  maltose operon transcriptional repressor  26.76 
 
 		 343 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4226  maltose operon transcriptional repressor  26.76 
 
 		 343 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4134  maltose operon transcriptional repressor  26.76 
 
 		 340 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0372  transcriptional regulator, LacI family  30.61 
 
 		 325 aa  95.5  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13210  transcriptional regulator, LacI family  24.51 
 
 		 345 aa  95.5  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3995  LacI family transcription regulator  29.92 
 
 		 352 aa  95.5  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.917064 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2594  transcriptional regulator, LacI family  28.28 
 
 		 339 aa  95.9  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1083  transcriptional regulator, LacI family  30.22 
 
 		 335 aa  95.9  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0310257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5637  LacI family transcription regulator  31.14 
 
 		 338 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339737  normal  0.425271 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>