More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0970 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0970  cold-shock DNA-binding domain protein  100 
 
 
74 aa  149  8.999999999999999e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.251773 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0662  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  84 
 
 
75 aa  129  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000214016  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1006  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.24 
 
 
89 aa  108  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.644816  hitchhiker  0.000419725 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0638  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.42 
 
 
87 aa  107  7.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.557859  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2290  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.12 
 
 
68 aa  103  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.388252  hitchhiker  0.00970612 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1072  cold-shock DNA-binding domain protein  72.31 
 
 
68 aa  99.8  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000000253624  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3598  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 
66 aa  90.1  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.851035  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3647  cold shock protein CspB  68.18 
 
 
66 aa  89  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000702498  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3553  cold shock protein CspB  68.18 
 
 
66 aa  89  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000960966  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0028  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  62.69 
 
 
66 aa  88.6  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000000670362  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3333  cold shock protein CspB  68.18 
 
 
66 aa  89  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000000736097  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3297  cold shock protein  68.18 
 
 
66 aa  89  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.0310600000000001e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3248  cold shock protein  68.18 
 
 
66 aa  89  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000222014  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3548  cold shock protein CspB  68.18 
 
 
66 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.8624399999999996e-45 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3594  cold shock protein CspB  68.18 
 
 
66 aa  89  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000632893  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3557  cold shock protein CspB  68.18 
 
 
66 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000616269  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1670  cold shock protein CspB  68.18 
 
 
66 aa  89  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000143673  decreased coverage  2.4479999999999998e-23 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34450  cold-shock DNA-binding protein family  66.15 
 
 
68 aa  88.2  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1853  cold-shock DNA-binding protein family protein  68.18 
 
 
66 aa  88.2  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000550442  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3242  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.18 
 
 
66 aa  87.8  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000134861  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1449  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 
66 aa  87.8  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000494956  unclonable  0.00000584596 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2221  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.23 
 
 
66 aa  87.8  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000348612  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3973  cold-shock DNA-binding domain protein  70.97 
 
 
65 aa  87.4  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000342931  unclonable  0.0000000000681945 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2064  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.18 
 
 
67 aa  87.4  5e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000424325  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1817  cold-shock DNA-binding domain protein  66.15 
 
 
66 aa  87.8  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002542  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0567  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  62.32 
 
 
67 aa  87.8  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000164882  normal  0.415354 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2178  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.25 
 
 
65 aa  87.4  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3065  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.18 
 
 
66 aa  87.4  6e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000279167  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4169  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.18 
 
 
67 aa  87.4  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.206868  normal  0.740799 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1369  hypothetical protein  65.15 
 
 
66 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.309276 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2901  cold-shock DNA-binding domain protein  68.18 
 
 
66 aa  87.4  6e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000000581473  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3497  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 
66 aa  87.4  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000616798  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6113  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  60.29 
 
 
66 aa  87  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0557  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.69 
 
 
67 aa  86.7  9e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0146749  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5298  cold shock protein CspC  66.67 
 
 
67 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5040  cold shock protein CspC  66.67 
 
 
67 aa  86.3  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5356  cold shock protein CspC  66.67 
 
 
67 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4870  cold shock protein  66.67 
 
 
67 aa  86.3  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1896  cold-shock DNA-binding domain protein  62.32 
 
 
67 aa  86.3  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.385975  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4885  cold shock protein  66.67 
 
 
67 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4985  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 
67 aa  86.3  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C47  cold-shock DNA-binding protein family protein  63.64 
 
 
66 aa  86.3  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5280  cold shock protein CspC  66.67 
 
 
67 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000584465 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5310  cold shock protein CspC  66.67 
 
 
65 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.156889  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5424  cold shock protein CspC  66.67 
 
 
65 aa  85.9  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491326  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5647  cold shock protein CspC  66.67 
 
 
65 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000135799 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3080  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.25 
 
 
65 aa  85.9  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356634  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0972  CSD family cold shock protein  64.62 
 
 
77 aa  85.1  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3728  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.08 
 
 
65 aa  85.1  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.484525  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2223  cold-shock DNA-binding protein family  65.08 
 
 
65 aa  85.1  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000339527  decreased coverage  1.60158e-22 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1266  cold-shock DNA-binding protein family protein  69.23 
 
 
66 aa  85.1  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.7573e-18  decreased coverage  0.00000000000100442 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0226  cold-shock DNA-binding protein family protein  68.25 
 
 
65 aa  85.1  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000017804  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1732  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  62.69 
 
 
66 aa  85.1  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000101176  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1492  cold-shock protein DNA-binding  64.62 
 
 
66 aa  84.7  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000192979  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1463  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.62 
 
 
66 aa  84.7  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.302037  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1517  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 
65 aa  85.1  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3214  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  62.32 
 
 
67 aa  84.7  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0979697  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1151  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  61.19 
 
 
66 aa  85.1  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000468526  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0979  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  61.19 
 
 
66 aa  85.1  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000188175  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5019  cold shock protein CspD  65.15 
 
 
66 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0351296  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8123  cold-shock DNA-binding domain protein  60.29 
 
 
67 aa  84.7  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4754  cold shock protein CspD  65.15 
 
 
66 aa  84.7  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000181  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4592  cold shock protein  65.15 
 
 
66 aa  84.7  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000232551  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4614  cold shock protein  65.15 
 
 
66 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000169422  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4972  cold shock protein CspD  65.15 
 
 
66 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5115  cold shock protein CspD  65.15 
 
 
66 aa  84.7  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00303936  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2146  cold-shock DNA-binding domain protein  63.08 
 
 
66 aa  84.3  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5001  cold shock protein CspD  65.15 
 
 
66 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.219986  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4269  cold-shock DNA-binding protein family protein  63.77 
 
 
67 aa  84.3  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0191  cold-shock DNA-binding domain protein  66.18 
 
 
66 aa  84.7  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  8.97537e-36 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4990  cold shock protein CspD  65.15 
 
 
66 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00510931  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0248  cold shock protein CspD  65.15 
 
 
66 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000599312  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2963  cold-shock DNA-binding domain protein  63.64 
 
 
65 aa  84.3  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2100  CSD family cold shock protein  56.52 
 
 
67 aa  84.3  5e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3186  cold-shock DNA-binding domain protein  64.62 
 
 
67 aa  84.3  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000014796  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1587  cold-shock DNA-binding protein family  63.08 
 
 
66 aa  84.3  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000012511  unclonable  7.72165e-24 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4701  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.15 
 
 
66 aa  84  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000295831  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0440  cold-shock DNA-binding domain protein  61.54 
 
 
68 aa  84.3  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.270892  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0208  cold-shock DNA-binding domain protein  66.18 
 
 
66 aa  84.3  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000807689  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2532  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.69 
 
 
65 aa  83.6  8e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.19716  normal  0.287944 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1264  cold-shock DNA-binding domain protein  63.08 
 
 
66 aa  83.6  9e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000176373  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2197  cold-shock DNA-binding domain protein  64.62 
 
 
66 aa  83.6  9e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000106738  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1512  cold shock protein CspB  65.08 
 
 
65 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0532666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1484  cold shock protein  65.08 
 
 
65 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00463121  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0372  cold shock protein  64.62 
 
 
66 aa  83.2  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.69681e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1629  cold shock protein CspB  65.08 
 
 
65 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3141  cold-shock DNA-binding domain protein  64.18 
 
 
67 aa  83.2  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0244532  hitchhiker  0.00153434 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02480  cold-shock DNA-binding protein family  65.15 
 
 
67 aa  82.8  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181166  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2627  cold-shock DNA-binding domain protein  61.76 
 
 
66 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368791  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0174  cold-shock DNA-binding protein family protein  62.12 
 
 
65 aa  83.2  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000215085  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1376  cold-shock DNA-binding protein family protein  60.61 
 
 
67 aa  83.2  0.000000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.128629  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2017  cold-shock DNA-binding protein family protein  62.12 
 
 
65 aa  82.8  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.679038  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2806  cold shock proteins  66.15 
 
 
85 aa  82.4  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.72104e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0658  cold-shock DNA-binding domain protein  64.62 
 
 
66 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.18008e-25 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1580  cold-shock DNA-binding domain protein  62.12 
 
 
67 aa  82  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.507056  normal  0.495998 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3679  cold shock protein CspB  65.08 
 
 
65 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.844549  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0278  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.49 
 
 
65 aa  82.8  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000141015  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1666  cold shock protein CspB  65.08 
 
 
65 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1771  cold shock protein CspB  65.08 
 
 
65 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.674817  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1474  cold shock protein  65.08 
 
 
65 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259968  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>