More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0638 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0638  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  100 
 
 
87 aa  178  2e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.557859  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1006  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  75.68 
 
 
89 aa  119  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.644816  hitchhiker  0.000419725 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0970  cold-shock DNA-binding domain protein  70.42 
 
 
74 aa  107  7.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.251773 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2290  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.85 
 
 
68 aa  102  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.388252  hitchhiker  0.00970612 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0662  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.06 
 
 
75 aa  98.6  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000214016  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2221  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.21 
 
 
66 aa  94  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000348612  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3548  cold shock protein CspB  69.23 
 
 
66 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.8624399999999996e-45 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3553  cold shock protein CspB  69.23 
 
 
66 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000960966  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3333  cold shock protein CspB  69.23 
 
 
66 aa  91.7  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000000736097  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3297  cold shock protein  69.23 
 
 
66 aa  91.7  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.0310600000000001e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3248  cold shock protein  69.23 
 
 
66 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000222014  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3594  cold shock protein CspB  69.23 
 
 
66 aa  91.7  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000632893  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3242  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.77 
 
 
66 aa  92  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000134861  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1670  cold shock protein CspB  69.23 
 
 
66 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000143673  decreased coverage  2.4479999999999998e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3647  cold shock protein CspB  69.23 
 
 
66 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000702498  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3557  cold shock protein CspB  69.23 
 
 
66 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000616269  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3598  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.23 
 
 
66 aa  90.9  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.851035  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2454  cold shock protein CspA  67.19 
 
 
67 aa  90.5  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020427  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2257  cold shock protein CspA  67.19 
 
 
67 aa  90.5  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000681816  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2216  cold shock protein  67.19 
 
 
67 aa  90.5  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.62754e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2177  cold shock protein  67.19 
 
 
67 aa  90.5  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000147175  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2440  cold shock protein CspA  67.19 
 
 
67 aa  90.5  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.11145 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2422  cold shock protein CspA  67.19 
 
 
67 aa  90.5  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000271714  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2521  cold shock protein CspA  67.19 
 
 
67 aa  90.5  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000175758  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3497  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 
66 aa  90.5  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000616798  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4701  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.18 
 
 
66 aa  89.7  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000295831  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0248  cold shock protein CspD  68.18 
 
 
66 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000599312  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4972  cold shock protein CspD  66.67 
 
 
66 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5019  cold shock protein CspD  66.67 
 
 
66 aa  89  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0351296  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4754  cold shock protein CspD  66.67 
 
 
66 aa  89  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000181  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4592  cold shock protein  66.67 
 
 
66 aa  89  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000232551  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4614  cold shock protein  66.67 
 
 
66 aa  89  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000169422  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4990  cold shock protein CspD  66.67 
 
 
66 aa  89  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00510931  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5001  cold shock protein CspD  66.67 
 
 
66 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.219986  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5115  cold shock protein CspD  66.67 
 
 
66 aa  89  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00303936  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2146  cold-shock DNA-binding domain protein  68.18 
 
 
66 aa  89  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C47  cold-shock DNA-binding protein family protein  65.15 
 
 
66 aa  89  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1264  cold-shock DNA-binding domain protein  68.18 
 
 
66 aa  89  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000176373  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1072  cold-shock DNA-binding domain protein  61.54 
 
 
68 aa  88.2  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000000253624  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1369  hypothetical protein  67.69 
 
 
66 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.309276 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6113  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  61.76 
 
 
66 aa  87.8  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1777  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.62 
 
 
67 aa  88.2  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000555984  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05400  putative cold-shock DNA-binding domain protein  69.84 
 
 
67 aa  87.4  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  4.33246e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0028  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.64 
 
 
66 aa  87.4  5e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000000670362  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1517  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.35 
 
 
65 aa  87.4  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34450  cold-shock DNA-binding protein family  66.13 
 
 
68 aa  87  8e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4169  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 
67 aa  86.7  9e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.206868  normal  0.740799 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0557  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 
67 aa  86.7  9e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0146749  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1720  cold shock protein CspB  66.67 
 
 
65 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.146917  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1512  cold shock protein CspB  66.67 
 
 
65 aa  86.3  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0532666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1484  cold shock protein  66.67 
 
 
65 aa  86.3  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00463121  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1474  cold shock protein  66.67 
 
 
65 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259968  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2236  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.08 
 
 
67 aa  86.3  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000182228  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1629  cold shock protein CspB  66.67 
 
 
65 aa  86.3  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0880  cold shock protein  62.12 
 
 
66 aa  86.3  1e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000035682  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1771  cold shock protein CspB  66.67 
 
 
65 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.674817  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1666  cold shock protein CspB  66.67 
 
 
65 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3679  cold shock protein CspB  66.67 
 
 
65 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.844549  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1587  cold-shock DNA-binding protein family  62.12 
 
 
66 aa  85.5  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000012511  unclonable  7.72165e-24 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2944  cold shock protein CspA  64.06 
 
 
67 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000190383  hitchhiker  0.00000000328218 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2387  cold shock protein CspA  64.06 
 
 
67 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000343372  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3186  cold-shock DNA-binding domain protein  66.67 
 
 
67 aa  85.9  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000014796  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1232  cold shock protein CspA  64.18 
 
 
67 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000325579  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3973  cold-shock DNA-binding domain protein  67.19 
 
 
65 aa  85.1  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000342931  unclonable  0.0000000000681945 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0855  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.08 
 
 
67 aa  85.1  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000708983  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1327  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.08 
 
 
65 aa  85.1  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00843058  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1376  cold-shock DNA-binding protein family protein  63.08 
 
 
67 aa  85.1  3e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.128629  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1697  cold shock protein CspB  65.08 
 
 
65 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0268  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  61.76 
 
 
67 aa  84.7  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110044 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1732  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  62.12 
 
 
66 aa  84.3  4e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000101176  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0310  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  61.76 
 
 
67 aa  84.7  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3080  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.75 
 
 
65 aa  84.3  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356634  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0174  cold-shock DNA-binding protein family protein  66.15 
 
 
65 aa  84.7  4e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000215085  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1817  cold-shock DNA-binding domain protein  64.62 
 
 
66 aa  84.3  5e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002542  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1289  cold shock protein CspA  64.18 
 
 
67 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110281  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0972  CSD family cold shock protein  63.64 
 
 
77 aa  84.3  5e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1054  cold shock protein CspA  64.18 
 
 
67 aa  84.3  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000920965  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1029  cold shock protein  64.18 
 
 
67 aa  84.3  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.00447e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1032  cold shock protein  64.18 
 
 
67 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000608124  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1135  cold shock protein CspA  64.18 
 
 
67 aa  84.3  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000287991  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1185  cold shock protein CspA  64.18 
 
 
67 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2223  cold-shock DNA-binding protein family  65.08 
 
 
65 aa  84.3  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000339527  decreased coverage  1.60158e-22 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3245  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 
65 aa  84.3  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.370321  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4154  cold shock protein CspA  64.18 
 
 
67 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857883  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1035  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  61.54 
 
 
67 aa  83.6  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000461706  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2100  CSD family cold shock protein  59.42 
 
 
67 aa  84  7e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0567  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  61.54 
 
 
67 aa  84  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000164882  normal  0.415354 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1853  cold-shock DNA-binding protein family protein  65.71 
 
 
66 aa  83.6  9e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000550442  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0226  cold-shock DNA-binding protein family protein  68.25 
 
 
65 aa  83.6  9e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000017804  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0756  cold-shock DNA-binding protein family protein  61.54 
 
 
66 aa  83.6  9e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000688666  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5647  cold shock protein CspC  65.08 
 
 
65 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000135799 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4985  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.08 
 
 
67 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1492  cold-shock protein DNA-binding  63.64 
 
 
66 aa  83.2  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000192979  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5298  cold shock protein CspC  65.08 
 
 
67 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5040  cold shock protein CspC  65.08 
 
 
67 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4885  cold shock protein  65.08 
 
 
67 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5424  cold shock protein CspC  65.08 
 
 
65 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491326  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5356  cold shock protein CspC  65.08 
 
 
67 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05490  putative cold-shock DNA-binding domain protein  63.08 
 
 
68 aa  83.2  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.94484e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0440  cold-shock DNA-binding domain protein  60 
 
 
68 aa  83.2  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.270892  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>