More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2066 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_2066  hydrolase  100 
 
 
280 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0256  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  60.89 
 
 
274 aa  357  9.999999999999999e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.327339  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2433  hydrolase  58.96 
 
 
268 aa  330  2e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2312  haloacid dehalogenase-like hydrolase  54.85 
 
 
271 aa  302  5.000000000000001e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0556  hypothetical protein  46.69 
 
 
274 aa  249  5e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0176824 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0708  potassium/copper-transporting ATPase  36.61 
 
 
266 aa  170  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.281693  normal  0.585181 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1901  haloacid dehalogenase-like hydrolase  35.52 
 
 
266 aa  166  4e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.12414  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0375  hydrolase  36.26 
 
 
265 aa  137  2e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0946  hydrolase  31.99 
 
 
276 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.696714  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1030  hydrolase  30.4 
 
 
263 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0914  hydrolase  29.35 
 
 
263 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.562334  normal  0.776426 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1767  adenosinetriphosphatase  29.67 
 
 
263 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  42.35 
 
 
798 aa  66.6  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  37.4 
 
 
796 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0357  nitrogen fixation protein FixI, putative  29.77 
 
 
752 aa  61.6  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_13063  P-ATPase family transporter: copper ion; heavy metal transporting P-type ATPase-like protein  37.35 
 
 
763 aa  61.2  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0100919 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  39.13 
 
 
797 aa  59.3  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  39.08 
 
 
798 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  39.08 
 
 
798 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0576  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  32.63 
 
 
817 aa  58.2  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.176053  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2631  ATPase, E1-E2 type:heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  37.65 
 
 
739 aa  58.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.873232 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  35.63 
 
 
885 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1407  heavy metal translocating P-type ATPase  31.93 
 
 
758 aa  58.2  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.688507  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5313  copper-translocating P-type ATPase  38.04 
 
 
795 aa  57  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.620833 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0564  heavy metal translocating P-type ATPase  38.55 
 
 
789 aa  57.4  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5696  copper-translocating P-type ATPase  36.96 
 
 
795 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.698051  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3678  copper-translocating P-type ATPase  36.96 
 
 
796 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0521178  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18520  heavy metal translocating P-type ATPase  43.56 
 
 
712 aa  56.2  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1251  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 
806 aa  56.2  0.0000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000992397 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0485  heavy metal translocating P-type ATPase  32.26 
 
 
724 aa  56.6  0.0000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.265664  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2001  heavy metal translocating P-type ATPase  36.63 
 
 
829 aa  56.2  0.0000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.790447  normal  0.138188 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0821  heavy metal translocating P-type ATPase  34.78 
 
 
790 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0451  heavy metal-transporting ATPase family protein  33.72 
 
 
673 aa  55.8  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.390331  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4316  heavy metal translocating P-type ATPase  38.04 
 
 
835 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0473  heavy metal translocating P-type ATPase  34.07 
 
 
699 aa  55.8  0.0000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1581  heavy metal translocating P-type ATPase  36.96 
 
 
755 aa  55.8  0.0000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5319  ATPase, P type cation/copper-transporter  34.44 
 
 
697 aa  55.8  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.757276  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5698  copper-translocating P-type ATPase  34.44 
 
 
697 aa  55.8  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113877  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5408  copper-translocating P-type ATPase  34.44 
 
 
697 aa  55.8  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681364  normal  0.0919458 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0915  copper-translocating P-type ATPase  33.65 
 
 
706 aa  55.5  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0297  heavy metal translocating P-type ATPase  36.05 
 
 
744 aa  55.1  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4394  heavy metal translocating P-type ATPase  35.96 
 
 
715 aa  55.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.880078  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0193  copper-transporting P-type ATPase  32.53 
 
 
709 aa  55.5  0.000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0946171  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1790  heavy metal translocating P-type ATPase  32.61 
 
 
815 aa  55.5  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03624  copper resistance P-type ATPase (Eurofung)  32.73 
 
 
1182 aa  54.7  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.102947 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0463  copper-translocating P-type ATPase  33.68 
 
 
752 aa  54.7  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1856  copper-translocating P-type ATPase  33.7 
 
 
890 aa  54.3  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1110  heavy metal translocating P-type ATPase  35.48 
 
 
938 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0214095  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1499  cation-transporting ATPase; copper-exporting ATPase  34.09 
 
 
804 aa  54.3  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.037718  normal  0.0386539 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0727  heavy metal translocating P-type ATPase  37.35 
 
 
792 aa  54.7  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    unclonable  0.0000000000426608 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0220  heavy metal translocating P-type ATPase  33.72 
 
 
743 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639111 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0705  copper-translocating P-type ATPase  27.62 
 
 
779 aa  53.9  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1377  heavy metal translocating P-type ATPase subfamily protein  33.33 
 
 
691 aa  53.9  0.000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3941  heavy metal translocating P-type ATPase  33.04 
 
 
781 aa  53.9  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2710  heavy metal translocating P-type ATPase  37.5 
 
 
835 aa  53.9  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.3034  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2852  copper-translocating P-type ATPase  32.69 
 
 
707 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.738048 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00260  putative copper transport-related membrane protein  27.45 
 
 
741 aa  53.9  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.348825  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3603  heavy metal translocating P-type ATPase  33.04 
 
 
781 aa  53.9  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.385449 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1506  heavy metal translocating P-type ATPase  31.18 
 
 
723 aa  53.9  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2997  heavy metal translocating P-type ATPase  26.99 
 
 
819 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.988756  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2999  heavy metal translocating P-type ATPase  37.08 
 
 
805 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000764735  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4464  copper-translocating P-type ATPase  32.69 
 
 
710 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.991261  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4547  copper-translocating P-type ATPase  32.69 
 
 
710 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.308218  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1389  tetrapyrrole methylase family protein  35.16 
 
 
691 aa  53.1  0.000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.512552  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2696  copper-translocating P-type ATPase  37.8 
 
 
792 aa  53.1  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.276003  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0460  heavy metal translocating P-type ATPase  32.46 
 
 
748 aa  53.1  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.792118  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0413  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 
723 aa  53.1  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1742  heavy metal translocating P-type ATPase  38.04 
 
 
826 aa  53.1  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1049  hypothetical protein  28.21 
 
 
713 aa  53.1  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01400  copper-exporting ATPase, putative  34.04 
 
 
1055 aa  53.1  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1836  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  36.56 
 
 
808 aa  53.1  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.048394 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0455  heavy metal-transporting ATPase  25.2 
 
 
641 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0938  heavy metal translocating P-type ATPase  34.44 
 
 
730 aa  53.1  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.485974 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1082  heavy metal translocating P-type ATPase  34.44 
 
 
730 aa  53.1  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3691  heavy metal translocating P-type ATPase  36.14 
 
 
793 aa  53.1  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3584  heavy metal translocating P-type ATPase  34.67 
 
 
723 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.278523 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  39.29 
 
 
821 aa  53.1  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  32.77 
 
 
837 aa  52.8  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0267  copper-translocating P-type ATPase  34.44 
 
 
797 aa  52.8  0.000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.594062  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1469  heavy metal translocating P-type ATPase  37.5 
 
 
777 aa  52.8  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1813  copper-translocating P-type ATPase  29.35 
 
 
800 aa  52.4  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1621  copper-translocating P-type ATPase  33.73 
 
 
761 aa  52.8  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.996333  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1347  heavy metal translocating P-type ATPase  32.22 
 
 
730 aa  52.8  0.000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0397  heavy metal-transporting ATPase  25.2 
 
 
641 aa  52.4  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0178655  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0410  heavy metal-transporting ATPase  25.2 
 
 
641 aa  52.4  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1954  heavy metal translocating P-type ATPase  30.49 
 
 
799 aa  52.4  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0019  heavy metal translocating P-type ATPase  36.36 
 
 
782 aa  52.4  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1513  heavy metal translocating P-type ATPase  39.02 
 
 
817 aa  52.4  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2267  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  35.96 
 
 
772 aa  52.4  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.270801  normal  0.567344 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5022  heavy metal translocating P-type ATPase  36.07 
 
 
762 aa  52.4  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29502  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1835  heavy metal translocating P-type ATPase  34.44 
 
 
804 aa  52.4  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0422  heavy metal translocating P-type ATPase  32.26 
 
 
723 aa  52  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0037  heavy metal translocating P-type ATPase  36.36 
 
 
782 aa  52  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.374671  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1548  copper-translocating P-type ATPase  31.87 
 
 
813 aa  51.6  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0486383 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5371  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  28.1 
 
 
769 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  36.96 
 
 
803 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  32.61 
 
 
838 aa  51.6  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  28.63 
 
 
836 aa  52  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0919  copper-translocating P-type ATPase  33.33 
 
 
697 aa  51.6  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0552  ATPase, P-type (transporting), HAD superfamily, subfamily IC  29.82 
 
 
198 aa  51.6  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.327446  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>