108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0569 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0569  50S ribosomal protein L22P  100 
 
 		 153 aa  308  2e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0413889  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0537  50S ribosomal protein L22P  72.08 
 
 		 154 aa  224  2e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.34854  normal  0.63908 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0447  50S ribosomal protein L22P  71.52 
 
 		 156 aa  224  4e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0102501  normal  0.42812 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2248  50S ribosomal protein L22P  60.93 
 
 		 154 aa  190  5e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000896212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0086  50S ribosomal protein L22P  57.05 
 
 		 157 aa  186  1e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.438509 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1723  ribosomal protein L22  55.26 
 
 		 152 aa  167  4e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00000443469  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0105  50S ribosomal protein L22P  48.03 
 
 		 151 aa  143  9e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.379943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0006  50S ribosomal protein L22P  46.71 
 
 		 151 aa  142  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000000018702  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0556  50S ribosomal protein L22P  50 
 
 		 168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1388  50S ribosomal protein L22P  42.38 
 
 		 153 aa  136  1e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1732  50S ribosomal protein L22P  45.27 
 
 		 198 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0714  50S ribosomal protein L22P  41.06 
 
 		 153 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00766872  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0748  50S ribosomal protein L22P  43.24 
 
 		 185 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1930  50S ribosomal protein L22P  39.87 
 
 		 185 aa  124  5e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.70908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0770  50S ribosomal protein L22P  45.27 
 
 		 185 aa  124  7e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0175  50S ribosomal protein L22P  39.07 
 
 		 153 aa  122  1e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000281865  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0648  50S ribosomal protein L22P  39.07 
 
 		 153 aa  122  1e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00000866939  hitchhiker  0.000275224 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1270  50S ribosomal protein L22P  39.07 
 
 		 153 aa  122  1e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000000000869512  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2297  50S ribosomal protein L22P  43.54 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1833  ribosomal protein L22  42.18 
 
 		 153 aa  120  8e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.271117 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1516  ribosomal protein L22  43.15 
 
 		 151 aa  117  4.9999999999999996e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  9.68145e-17  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1773  ribosomal protein L22  41.84 
 
 		 157 aa  107  5e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0215  ribosomal protein L22  42.75 
 
 		 165 aa  105  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0805  50S ribosomal protein L22  37.25 
 
 		 152 aa  104  4e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.589501 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0489  ribosomal protein L22  45.74 
 
 		 127 aa  102  3e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2223  ribosomal protein L22  38.93 
 
 		 159 aa  97.8  5e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0096  50S ribosomal protein L22P  37.41 
 
 		 156 aa  96.7  1e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000729368  unclonable  0.000000429528 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2444  50S ribosomal protein L22P  31.51 
 
 		 154 aa  85.5  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32234  Ribosomal protein L17, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  35.17 
 
 		 183 aa  84.3  5e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.333156 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29177  predicted protein  37.06 
 
 		 185 aa  83.6  9e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.669765  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00776  60S ribosomal protein L17 (AFU_orthologue; AFUA_1G14410)  34.78 
 
 		 184 aa  74.7  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.844288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89240  ribosomal protein L17B  32.62 
 
 		 186 aa  65.9  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01720  60s ribosomal protein l17, putative  32.86 
 
 		 182 aa  63.9  0.0000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1345  ribosomal protein L22  44.93 
 
 		 212 aa  51.6  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2227  50S ribosomal protein L22  42.65 
 
 		 117 aa  50.1  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.793555  normal  0.494658 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1297  50S ribosomal protein L22  38.89 
 
 		 119 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00515674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0112  50S ribosomal protein L22  43.84 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0706  50S ribosomal protein L22  41.43 
 
 		 110 aa  47  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000543227  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1179  ribosomal protein L22  40 
 
 		 110 aa  47.4  0.00008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000146322  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1351  50S ribosomal protein L22  35.21 
 
 		 113 aa  47.4  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.622659  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0696  50S ribosomal protein L22  37.17 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00931457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1072  50S ribosomal protein L22  40 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000186157  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0286  50S ribosomal protein L22  37.68 
 
 		 116 aa  47  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0125661  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2564  50S ribosomal protein L22  41.18 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0685  50S ribosomal protein L22  35.71 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.735331  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2455  50S ribosomal protein L22P  37.14 
 
 		 112 aa  45.1  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.082512 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17601  50S ribosomal protein L22  35.29 
 
 		 128 aa  45.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17441  50S ribosomal protein L22  35.29 
 
 		 128 aa  45.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0220  50S ribosomal protein L22  38.36 
 
 		 113 aa  45.1  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000894126  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0872  50S ribosomal protein L22  40 
 
 		 111 aa  45.1  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000233531  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0247  50S ribosomal protein L22  38.24 
 
 		 120 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0084  50S ribosomal protein L22  35.71 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100288 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0116  50S ribosomal protein L22  42.47 
 
 		 113 aa  45.1  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000205775  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0244  50S ribosomal protein L22  38.24 
 
 		 120 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0459  50S ribosomal protein L22  38.24 
 
 		 110 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.292472  unclonable  0.00000017309 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0631  ribosomal protein L22  38.24 
 
 		 110 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000531978  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4543  50S ribosomal protein L22  38.24 
 
 		 110 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0620392 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1124  50S ribosomal protein L22  36.23 
 
 		 126 aa  44.7  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5074  50S ribosomal protein L22  38.24 
 
 		 110 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000267076  normal  0.274237 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0371  50S ribosomal protein L22  35.29 
 
 		 121 aa  44.7  0.0005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.300281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08900  50S ribosomal protein L22  38.24 
 
 		 110 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0235931 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19981  50S ribosomal protein L22  36.23 
 
 		 126 aa  44.7  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.508737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3904  50S ribosomal protein L22  38.24 
 
 		 110 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.321312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0492  50S ribosomal protein L22  38.24 
 
 		 110 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000379964  normal  0.101974 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0842  50S ribosomal protein L22  38.24 
 
 		 110 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271548  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0489  50S ribosomal protein L22  38.24 
 
 		 110 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.144624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4744  50S ribosomal protein L22  38.24 
 
 		 110 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00307262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06300  50S ribosomal protein L22  38.24 
 
 		 92 aa  44.7  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.504619  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0291  ribosomal protein L22  40 
 
 		 113 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00562751  normal  0.0409902 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0063  50S ribosomal protein L22  35.63 
 
 		 114 aa  44.3  0.0006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.279384  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0938  50S ribosomal protein L22  38.57 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000140309  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3708  50S ribosomal protein L22  41.18 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3323  50S ribosomal protein L22  38.57 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000376786 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2852  50S ribosomal protein L22  37.14 
 
 		 111 aa  44.3  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.314759  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1478  50S ribosomal protein L22  33.62 
 
 		 115 aa  43.9  0.0007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000148826  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1902  50S ribosomal protein L22  35.63 
 
 		 114 aa  43.9  0.0008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.40685  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0270  ribosomal protein L22  41.18 
 
 		 121 aa  43.9  0.0009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000922526  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0201  50S ribosomal protein L22  40 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0571206  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17351  50S ribosomal protein L22  33.82 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23071  50S ribosomal protein L22  35.29 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0109  50S ribosomal protein L22  37.14 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000370436  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0115  50S ribosomal protein L22  35.71 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000818335  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1645  50S ribosomal protein L22  35.29 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0110  50S ribosomal protein L22  35.71 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000193561  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0146  50S ribosomal protein L22  35.71 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000364158  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0136  50S ribosomal protein L22  35.71 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5190  50S ribosomal protein L22  35.71 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000302093  unclonable  1.1617299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0403  ribosomal protein L22  43.28 
 
 		 218 aa  42.4  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1960  50S ribosomal protein L22  35.29 
 
 		 121 aa  42  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0631  50S ribosomal protein L22  35.71 
 
 		 110 aa  42.4  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000316767  hitchhiker  0.0000000013248 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2908  50S ribosomal protein L22  41.1 
 
 		 125 aa  42  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0763  50S ribosomal protein L22  41.43 
 
 		 158 aa  42  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000122399  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1128  ribosomal protein L22  40.28 
 
 		 139 aa  42.4  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2252  50S ribosomal protein L22  31.43 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000407093  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0199  LSU ribosomal protein L22P  34.29 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019088  normal  0.0505621 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1760  50S ribosomal protein L22  32.86 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0923883  normal  0.388424 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2397  50S ribosomal protein L22  38.57 
 
 		 115 aa  40.8  0.006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0178523  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2060  ribosomal protein L22  33.8 
 
 		 110 aa  40.8  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000300396  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_002978  WD0676  50S ribosomal protein L22  35.62 
 
 		 115 aa  40.8  0.007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0432957  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0109  50S ribosomal protein L22  34.29 
 
 		 113 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108329  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>