More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4226 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_4226  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
370 aa  756    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.333329  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  29.6 
 
 
382 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  31.02 
 
 
408 aa  97.1  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  30.65 
 
 
400 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 
419 aa  93.2  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  30.62 
 
 
397 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  23.1 
 
 
373 aa  90.5  4e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1471  glycosyl transferase group 1  24.94 
 
 
383 aa  90.5  4e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.630233  normal  0.0889822 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2159  glycosyl transferase group 1  25.19 
 
 
420 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0901  hypothetical protein  25.1 
 
 
372 aa  87.8  3e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  24.58 
 
 
370 aa  85.9  9e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  26.18 
 
 
410 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  24.49 
 
 
369 aa  85.1  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  26.27 
 
 
417 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  24.81 
 
 
424 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 
396 aa  84  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  24.35 
 
 
348 aa  84  0.000000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  26.27 
 
 
435 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  22.83 
 
 
434 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  26.01 
 
 
421 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  26.39 
 
 
426 aa  82  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  26.01 
 
 
420 aa  81.6  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  26.94 
 
 
370 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2688  glycosyl transferase group 1  32.35 
 
 
387 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.504834  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  25.35 
 
 
395 aa  80.9  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0116  glycosyl transferase group 1  22.87 
 
 
341 aa  81.3  0.00000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000347461 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  31.71 
 
 
422 aa  80.5  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  25.32 
 
 
397 aa  80.9  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  23.81 
 
 
423 aa  80.9  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  28.52 
 
 
385 aa  80.1  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  30.36 
 
 
370 aa  79.7  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  27.4 
 
 
413 aa  79.7  0.00000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2502  glycosyl transferase, group 1  32.35 
 
 
387 aa  79.3  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.417702 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  23.11 
 
 
381 aa  79  0.0000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
366 aa  79  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2209  glycosyl transferase group 1  26.4 
 
 
421 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0688071 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  25.35 
 
 
419 aa  78.2  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2081  glycosyl transferase group 1  29.11 
 
 
381 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.212135  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0742  glycosyl transferase group 1  33.54 
 
 
367 aa  78.2  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0263167  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1400  glycosyl transferase, group 1  36.11 
 
 
571 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  27.19 
 
 
394 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1913  glycosyl transferase group 1  30.34 
 
 
378 aa  77.4  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  22.44 
 
 
366 aa  77.8  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  22.18 
 
 
388 aa  77.8  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1961  glycosyl transferase group 1  26.52 
 
 
350 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1385  glycosyl transferase group 1  23.77 
 
 
398 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106503  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0537  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.05 
 
 
364 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  23.65 
 
 
355 aa  77.4  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0890  a-glycosyltransferase  24.52 
 
 
420 aa  77  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0247924  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 
370 aa  77  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  23.18 
 
 
408 aa  77  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0235  glycosyl transferase group 1  24.58 
 
 
373 aa  76.6  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.118803 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2873  group 1 glycosyl transferase  31.07 
 
 
421 aa  76.3  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0042  glycosyl transferase, group 1  27.49 
 
 
344 aa  76.3  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  31.01 
 
 
748 aa  76.3  0.0000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  25.21 
 
 
384 aa  76.3  0.0000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  25.86 
 
 
360 aa  76.3  0.0000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1374  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase protein  27.09 
 
 
344 aa  75.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.95954  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  26.89 
 
 
433 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0249  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
387 aa  75.9  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000132776  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
371 aa  75.5  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0084  glycosyl transferase group 1  29.05 
 
 
346 aa  74.7  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1670  glycosyl transferase  26.09 
 
 
376 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0081  mannosyltransferase  29.05 
 
 
346 aa  74.7  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.54497  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2407  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.27 
 
 
385 aa  74.7  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0928502 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2028  glycosyltransferase  29.29 
 
 
353 aa  75.1  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.949426  normal  0.904409 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  25.63 
 
 
378 aa  74.7  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  35.09 
 
 
1152 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2594  glycosyl transferase group 1  27.13 
 
 
421 aa  74.3  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  22.65 
 
 
396 aa  74.3  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5879  glycosyl transferase group 1  27.6 
 
 
395 aa  74.3  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0552  glycosyl transferase  25.26 
 
 
383 aa  74.3  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.219482 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  29.32 
 
 
360 aa  74.3  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  23.27 
 
 
390 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  38.95 
 
 
1152 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  25.42 
 
 
482 aa  74.3  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3800  glycosyl transferase group 1  28.52 
 
 
402 aa  73.9  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17673  normal  0.211423 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  23.61 
 
 
360 aa  73.9  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
399 aa  73.9  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  25.14 
 
 
351 aa  73.9  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  25.82 
 
 
417 aa  73.6  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  24.72 
 
 
375 aa  73.6  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  27.87 
 
 
392 aa  73.6  0.000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  23.41 
 
 
384 aa  73.6  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  23.61 
 
 
381 aa  73.2  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0413  glycosyl transferase, group 1  26.61 
 
 
386 aa  73.2  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.818994  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2865  glycosyl transferase group 1  26.64 
 
 
347 aa  73.2  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  24.77 
 
 
387 aa  73.2  0.000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0032  glycosyl transferase, group 1  27.09 
 
 
344 aa  73.2  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0470  glycosyl transferase group 1  24.7 
 
 
456 aa  72.8  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  23.08 
 
 
394 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0377  glycosyl transferase group 1  25.71 
 
 
378 aa  72  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0289897  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1962  mannosyltransferase  27.76 
 
 
859 aa  72.4  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000841107  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  28.17 
 
 
422 aa  72.4  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1896  glycosyl transferase group 1  27.76 
 
 
860 aa  72.4  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00121907  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1963  glycosyl transferase group 1  37.04 
 
 
409 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2494  glycosyl transferase group 1  25.6 
 
 
452 aa  72.8  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.044708  normal  0.0808495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5074  UDP-N-acetylglucosamine  23.53 
 
 
418 aa  72  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838773  normal  0.526532 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3184  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  24.49 
 
 
404 aa  72.4  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3263  glycosyl transferase group 1  28.73 
 
 
425 aa  72.8  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>