291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4074 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_4074  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
263 aa  493  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3780  hypothetical protein  99.24 
 
 
263 aa  490  1e-137  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779876  normal  0.855482 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4036  protein of unknown function DUF81  93.92 
 
 
263 aa  449  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.843514  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4374  hypothetical protein  61.36 
 
 
264 aa  291  1e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.716093 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0883  protein of unknown function DUF81  57.98 
 
 
270 aa  277  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1880  hypothetical protein  52.89 
 
 
272 aa  253  3e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.531146  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1303  hypothetical protein  52.07 
 
 
261 aa  245  4e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1267  hypothetical protein  52.07 
 
 
272 aa  245  6e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2642  hypothetical protein  48.43 
 
 
261 aa  242  5e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2127  protein of unknown function DUF81  51.48 
 
 
261 aa  241  6e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.745241  normal  0.0256004 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1748  hypothetical protein  50.42 
 
 
261 aa  241  7.999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.179176 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2491  protein of unknown function DUF81  54.51 
 
 
249 aa  218  1e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.33045 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3018  hypothetical protein  46.18 
 
 
252 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0542  hypothetical protein  49.22 
 
 
263 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.768311  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1585  permease  43.7 
 
 
259 aa  207  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2846  hypothetical protein  43.65 
 
 
256 aa  207  2e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3065  hypothetical protein  44.14 
 
 
259 aa  207  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.570217  hitchhiker  0.00363187 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1675  hypothetical protein  43.25 
 
 
256 aa  206  3e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.102694  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2638  hypothetical protein  42.46 
 
 
259 aa  206  4e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.293414  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1653  hypothetical protein  43.25 
 
 
256 aa  204  8e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2451  hypothetical protein  43.25 
 
 
269 aa  204  1e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000200533 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2613  hypothetical protein  43.25 
 
 
269 aa  204  1e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000236157 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2705  protein of unknown function DUF81  42.86 
 
 
256 aa  203  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.142618  hitchhiker  0.000000969099 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1638  hypothetical protein  42.86 
 
 
256 aa  203  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0157393  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2875  hypothetical protein  46.03 
 
 
270 aa  203  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0415169  normal  0.12282 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1530  hypothetical protein  42.46 
 
 
257 aa  202  4e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2521  hypothetical protein  42.86 
 
 
256 aa  202  5e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000101647  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2624  hypothetical protein  45.19 
 
 
269 aa  201  9e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.754469  hitchhiker  0.00000102674 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2735  hypothetical protein  45.19 
 
 
269 aa  201  9e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2571  hypothetical protein  45.19 
 
 
269 aa  201  9e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2611  hypothetical protein  45.19 
 
 
269 aa  201  9e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.692878 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2522  hypothetical protein  45.19 
 
 
269 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3372  hypothetical protein  42.64 
 
 
266 aa  201  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.264198  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004476  membrane protein  44.05 
 
 
259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.61152  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1433  permease  42.4 
 
 
268 aa  199  3.9999999999999996e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2507  hypothetical protein  44.22 
 
 
253 aa  199  5e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2502  hypothetical protein  51.32 
 
 
252 aa  199  6e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.656569  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2591  protein of unknown function DUF81  41.83 
 
 
267 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2453  hypothetical protein  41.6 
 
 
267 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1407  hypothetical protein  43.51 
 
 
268 aa  192  5e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0345183  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1516  hypothetical protein  43.51 
 
 
268 aa  192  5e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0375  hypothetical protein  43.51 
 
 
268 aa  192  5e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3956  hypothetical protein  43.1 
 
 
256 aa  191  8e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02252  conserved inner membrane protein  46.44 
 
 
269 aa  191  1e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.563205  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1329  protein of unknown function DUF81  46.44 
 
 
269 aa  191  1e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.95844  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3468  hypothetical protein  46.44 
 
 
269 aa  191  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2479  hypothetical protein  46.44 
 
 
269 aa  191  1e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02212  hypothetical protein  46.44 
 
 
269 aa  191  1e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.53091  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2484  hypothetical protein  46.44 
 
 
269 aa  191  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1325  hypothetical protein  46.44 
 
 
269 aa  191  1e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2622  hypothetical protein  46.44 
 
 
269 aa  191  1e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2705  hypothetical protein  46.44 
 
 
269 aa  191  1e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1266  hypothetical protein  41.2 
 
 
260 aa  189  4e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.612634  hitchhiker  0.000168784 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1837  hypothetical protein  40.41 
 
 
251 aa  187  2e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2122  hypothetical protein  40.82 
 
 
251 aa  186  2e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0770  inner membrane protein YfcA  40 
 
 
257 aa  187  2e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00655401  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1347  protein of unknown function DUF81  41.8 
 
 
266 aa  186  3e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340602  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2809  hypothetical protein  43.44 
 
 
266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1455  hypothetical protein  44.13 
 
 
266 aa  181  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0160  hypothetical protein  38.55 
 
 
253 aa  177  2e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2464  hypothetical protein  44.98 
 
 
254 aa  176  3e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000359609 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0789  inner membrane protein YfcA  37.35 
 
 
253 aa  176  4e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0368  hypothetical protein  40.16 
 
 
254 aa  176  4e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.003766  hitchhiker  0.000586302 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1203  permease  38 
 
 
257 aa  172  6.999999999999999e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1312  hypothetical protein  42.11 
 
 
253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0722  inner membrane protein YfcA  37.99 
 
 
254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00918  hypothetical protein  42.69 
 
 
259 aa  162  7e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2881  inner membrane protein YfcA  37.67 
 
 
223 aa  160  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.752456 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2248  hypothetical protein  42.31 
 
 
256 aa  160  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.71549  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2455  inner membrane protein YfcA  37.67 
 
 
223 aa  160  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1432  hypothetical protein  43.21 
 
 
257 aa  159  4e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341761  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3059  protein of unknown function DUF81  36.55 
 
 
251 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2504  protein of unknown function DUF81  38.78 
 
 
254 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1715  protein of unknown function DUF81  39.08 
 
 
254 aa  150  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000213393 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0289  hypothetical protein  36.63 
 
 
256 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5401  hypothetical protein  41.2 
 
 
252 aa  145  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0907707  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1961  hypothetical protein  43.65 
 
 
261 aa  145  7.0000000000000006e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2721  hypothetical protein  35.34 
 
 
259 aa  143  4e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1372  protein of unknown function DUF81  35.32 
 
 
253 aa  143  4e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000140624  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2880  hypothetical protein  34.94 
 
 
259 aa  142  7e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460718  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2093  protein of unknown function DUF81  39.82 
 
 
256 aa  141  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2454  hypothetical protein  35.34 
 
 
280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.250763  hitchhiker  0.00875229 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2446  hypothetical protein  37.82 
 
 
247 aa  139  4.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.335155  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0014  hypothetical protein  36.4 
 
 
263 aa  139  4.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0337  hypothetical protein  35.51 
 
 
256 aa  138  7e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5469  hypothetical protein  42.29 
 
 
264 aa  138  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.51215  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0278  integral membrane protein  35.1 
 
 
256 aa  137  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0281  integral membrane protein  35.1 
 
 
256 aa  137  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26650  predicted permease  39.83 
 
 
253 aa  137  2e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0286343  normal  0.726382 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4966  hypothetical protein  34.43 
 
 
256 aa  137  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0380  hypothetical protein  35.1 
 
 
256 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0394  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF81 domain protein)  35.98 
 
 
250 aa  137  2e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0294  hypothetical protein  35.39 
 
 
256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0354  hypothetical protein  34.43 
 
 
256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0308  hypothetical protein  35.39 
 
 
256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0339  hypothetical protein  35.39 
 
 
256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0288  hypothetical protein  34.57 
 
 
256 aa  135  5e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0274  hypothetical protein  31.35 
 
 
253 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3337  hypothetical protein  37.4 
 
 
252 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1028  protein of unknown function DUF81  42.4 
 
 
254 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>