39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1156 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1156  hypothetical protein  100 
 
 
194 aa  366  1e-100  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.149709  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0763  hypothetical protein  49.1 
 
 
177 aa  167  1e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0552714  normal  0.074634 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1269  hypothetical protein  48.78 
 
 
185 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.637458  normal  0.552236 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0444  hypothetical protein  38.22 
 
 
184 aa  102  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2413  hypothetical protein  35.82 
 
 
189 aa  90.9  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0389455 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7679  hypothetical protein  32.95 
 
 
185 aa  73.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0749  hypothetical protein  34.48 
 
 
182 aa  72.8  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.204805 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1205  hypothetical protein  34.38 
 
 
208 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.39038  normal  0.418544 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2295  hypothetical protein  33.5 
 
 
207 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.357303  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2302  hypothetical protein  27.5 
 
 
203 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3835  hypothetical protein  27.53 
 
 
190 aa  58.5  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1416  hypothetical protein  32.28 
 
 
219 aa  58.2  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.336817 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0311  hypothetical protein  32.2 
 
 
207 aa  58.2  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.773139  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1255  hypothetical protein  32.28 
 
 
219 aa  58.2  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.390712 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4031  protein of unknown function DUF308 membrane  31.82 
 
 
196 aa  57.8  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3375  protein of unknown function DUF308 membrane  30.68 
 
 
192 aa  57.8  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00523019  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0620  hypothetical protein  26.5 
 
 
203 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.286873 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1163  hypothetical protein  26.13 
 
 
203 aa  56.6  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.242998  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3322  hypothetical protein  27.42 
 
 
208 aa  56.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552455  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0585  protein of unknown function DUF308 membrane  28.26 
 
 
228 aa  55.1  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0213  hypothetical protein  28.65 
 
 
179 aa  53.9  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6196  hypothetical protein  29.61 
 
 
186 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71390  hypothetical protein  30.17 
 
 
186 aa  52  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2831  protein of unknown function DUF308, membrane  29.44 
 
 
197 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5490  hypothetical protein  31.06 
 
 
191 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3612  hypothetical protein  30 
 
 
220 aa  47  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.173241  hitchhiker  0.00194962 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6893  hypothetical protein  37.25 
 
 
191 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.39706  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0940  protein of unknown function DUF308 membrane  26.7 
 
 
192 aa  46.2  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315068  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5913  hypothetical protein  25.43 
 
 
190 aa  45.1  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.897248  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1963  hypothetical protein  28.4 
 
 
212 aa  45.4  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.153133 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7805  hypothetical protein  26.05 
 
 
204 aa  45.1  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0167986  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4468  hypothetical protein  26.95 
 
 
215 aa  44.3  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.075562  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11640  hypothetical protein  30 
 
 
195 aa  44.7  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.233532 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4409  hypothetical protein  26.55 
 
 
283 aa  44.3  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0332  hypothetical protein  26.63 
 
 
177 aa  43.1  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2206  hypothetical protein  33.71 
 
 
175 aa  42.7  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.224771  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5301  hypothetical protein  26.16 
 
 
186 aa  42.7  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0410  hypothetical protein  28.81 
 
 
206 aa  42.7  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.144489  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1436  hypothetical protein  23.63 
 
 
210 aa  41.6  0.008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.341725  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>