More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0386 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0386  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 
159 aa  319  9.999999999999999e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26449  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1262  transcriptional regulator, HxlR family  88.36 
 
 
148 aa  261  3e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1480  transcriptional regulator, HxlR family  51.33 
 
 
152 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  53.4 
 
 
121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0946  HxlR family transcriptional regulator  56.12 
 
 
117 aa  111  3e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26449  normal  0.613112 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1617  transcriptional regulator, HxlR family  52.48 
 
 
117 aa  110  8.000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.19292 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  53.76 
 
 
126 aa  108  3e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  53.26 
 
 
120 aa  106  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  47.06 
 
 
134 aa  104  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  48.39 
 
 
120 aa  103  8e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  51.55 
 
 
122 aa  103  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  57.14 
 
 
114 aa  102  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2245  transcriptional regulator, HxlR family  54.44 
 
 
128 aa  101  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  37.86 
 
 
151 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  51.61 
 
 
119 aa  101  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  47.57 
 
 
110 aa  101  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  51.61 
 
 
114 aa  101  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  54.26 
 
 
113 aa  100  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  48.08 
 
 
155 aa  100  7e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  51.61 
 
 
114 aa  100  9e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  52.27 
 
 
127 aa  100  9e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  50.54 
 
 
114 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  46.53 
 
 
111 aa  99.8  1e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0015  transcriptional regulator, HxlR family  50.56 
 
 
107 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  50.54 
 
 
114 aa  99  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  50.54 
 
 
114 aa  99  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  55.06 
 
 
126 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  51.06 
 
 
159 aa  99  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  51.61 
 
 
114 aa  98.2  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  46.94 
 
 
160 aa  97.8  5e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  51.61 
 
 
115 aa  97.8  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  53.93 
 
 
126 aa  97.8  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  51.61 
 
 
114 aa  97.8  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  53.93 
 
 
126 aa  97.8  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  51.61 
 
 
114 aa  97.8  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  53.93 
 
 
126 aa  97.8  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  51.61 
 
 
114 aa  97.8  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  51.61 
 
 
114 aa  97.8  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5072  transcriptional regulator, HxlR family  50.52 
 
 
117 aa  97.4  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  53.93 
 
 
126 aa  97.8  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  51.61 
 
 
114 aa  97.8  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  53.93 
 
 
126 aa  97.4  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  51.61 
 
 
114 aa  97.8  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  53.93 
 
 
129 aa  97.8  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  53.93 
 
 
126 aa  97.4  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  51.61 
 
 
114 aa  97.4  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  50 
 
 
125 aa  97.4  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  51.61 
 
 
114 aa  97.4  8e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2255  transcriptional regulator, HxlR family  47.96 
 
 
159 aa  97.1  8e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3427  hypothetical protein  54.55 
 
 
108 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3439  hypothetical protein  53.41 
 
 
108 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  45.19 
 
 
113 aa  96.3  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  52.94 
 
 
129 aa  97.1  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3442  transcriptional regulator, HxlR family  51.06 
 
 
119 aa  95.9  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000021737  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1317  HxlR family transcriptional regulator  49.48 
 
 
122 aa  96.3  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000449926  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3114  MarR family transcriptional regulator  53.41 
 
 
108 aa  95.5  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448387  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 
130 aa  95.5  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  50.59 
 
 
133 aa  95.1  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1684  transcriptional regulator, HxlR family  49.44 
 
 
119 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  51.69 
 
 
124 aa  94.7  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2973  transcriptional regulator, HxlR family  49.48 
 
 
116 aa  95.1  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1702  transcriptional regulator, HxlR family  46.39 
 
 
115 aa  94.7  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.371682  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5177  HxlR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
118 aa  94.4  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  47.73 
 
 
129 aa  94.4  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3564  HxlR family transcriptional regulator  49.44 
 
 
140 aa  94  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  45.95 
 
 
124 aa  94  8e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  45.95 
 
 
124 aa  94  8e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2474  transcriptional regulator, HxlR family  44.68 
 
 
115 aa  94  8e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3208  hypothetical protein  52.27 
 
 
108 aa  93.6  9e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3186  MarR family transcriptional regulator  52.27 
 
 
108 aa  93.6  9e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3461  hypothetical protein  52.27 
 
 
108 aa  93.6  9e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.692347  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3490  HxlR family transcriptional regulator  47.78 
 
 
124 aa  93.6  9e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.462296 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4104  transcriptional regulator, HxlR family  49.44 
 
 
119 aa  93.6  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9284  transcriptional regulator (MarR family protein)  46.24 
 
 
122 aa  93.2  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0456  transcriptional regulator, HxlR family  46.43 
 
 
149 aa  92.8  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.208849  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1471  transcriptional regulator, HxlR family  46.81 
 
 
108 aa  92.4  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1971  HxlR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
134 aa  92.8  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  48.28 
 
 
108 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0348  HxlR family transcriptional regulator  48.89 
 
 
107 aa  92.4  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0280  HxlR family transcriptional regulator  48.89 
 
 
116 aa  92.4  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0168  helix-turn-helix HxlR type  48.45 
 
 
118 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1109  HxlR family transcriptional regulator  43.01 
 
 
116 aa  92  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116925  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3816  HxlR family transcriptional regulator  51.76 
 
 
120 aa  92  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0240  helix-turn-helix HxlR type  48.45 
 
 
118 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.566878  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6402  HxlR family transcriptional regulator  46.67 
 
 
121 aa  91.3  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.299726 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0952  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 
117 aa  91.3  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3585  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 
108 aa  90.9  6e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000738633  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1081  HxlR family transcriptional regulator  48.91 
 
 
125 aa  90.9  6e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124143  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  46.07 
 
 
132 aa  91.3  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  43.27 
 
 
119 aa  90.9  7e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4332  transcriptional regulator, HxlR family  43.69 
 
 
121 aa  90.5  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.101336 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5174  HxlR family transcriptional regulator  47.78 
 
 
119 aa  90.5  8e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.187988  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3209  hypothetical protein  48.86 
 
 
113 aa  90.5  9e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3115  MarR family transcriptional regulator  48.86 
 
 
114 aa  90.5  9e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.451528  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3462  hypothetical protein  48.86 
 
 
113 aa  90.5  9e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457433  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3440  hypothetical protein  48.86 
 
 
113 aa  90.5  9e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3527  HxlR family transcriptional regulator  45.56 
 
 
117 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.502253 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1437  transcriptional regulator family protein  44.86 
 
 
141 aa  89.7  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3293  putative transcriptional regulator  49.44 
 
 
119 aa  90.1  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1870  transcriptional regulator family protein  45.05 
 
 
144 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284748  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>