24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3346 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3346  hypothetical protein  100 
 
 		 300 aa  601  1.0000000000000001e-171  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.605131  normal  0.0139562 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3111  hypothetical protein  56.09 
 
 		 241 aa  225  8e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00823962  normal  0.703719 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0112  hypothetical protein  43.86 
 
 		 630 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0115  hypothetical protein  41.62 
 
 		 296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0114  hypothetical protein  43.86 
 
 		 370 aa  142  8e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0404  hypothetical protein  35.19 
 
 		 478 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1360  hypothetical protein  39.47 
 
 		 467 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.117671  unclonable  0.0000000289708 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2006  hypothetical protein  36.9 
 
 		 435 aa  105  6e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1317  hypothetical protein  35.53 
 
 		 480 aa  106  6e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0186  hypothetical protein  34.67 
 
 		 450 aa  105  7e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0593  hypothetical protein  35.29 
 
 		 465 aa  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.336496  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2238  hypothetical protein  32.52 
 
 		 232 aa  93.2  4e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2341  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  53.42 
 
 		 757 aa  71.2  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.480473 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5804  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  45.12 
 
 		 1394 aa  62  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.512223  normal  0.443028 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  43.84 
 
 		 2042 aa  55.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2563  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  45.78 
 
 		 336 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.23893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5889  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  34.75 
 
 		 859 aa  52.4  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.622586 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  36.05 
 
 		 1848 aa  47.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0115  putative hemagglutinin-related protein  42.65 
 
 		 1672 aa  46.6  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2564  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  40.91 
 
 		 247 aa  46.6  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2915  cell wall/surface repeat protein  41.89 
 
 		 1310 aa  46.2  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3003  Outer membrane autotransporter barrel  33.78 
 
 		 1695 aa  45.8  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.277946 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1858  IPT/TIG domain-containing protein  35.8 
 
 		 1081 aa  45.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0239021  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1454  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  38.6 
 
 		 1095 aa  42.4  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000744178  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>