16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0112 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0112  hypothetical protein  100 
 
 
630 aa  1253    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0111  hypothetical protein  80.56 
 
 
1165 aa  526  1e-148  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0114  hypothetical protein  68.31 
 
 
370 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0115  hypothetical protein  75.1 
 
 
296 aa  348  2e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0116  hypothetical protein  41.41 
 
 
393 aa  223  9e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.967324  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3346  hypothetical protein  43.86 
 
 
300 aa  147  6e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.605131  normal  0.0139562 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3111  hypothetical protein  37.38 
 
 
241 aa  128  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00823962  normal  0.703719 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2006  hypothetical protein  38.83 
 
 
435 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0404  hypothetical protein  37.43 
 
 
478 aa  107  8e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0186  hypothetical protein  32.79 
 
 
450 aa  103  1e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1317  hypothetical protein  34.39 
 
 
480 aa  89  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1360  hypothetical protein  32.8 
 
 
467 aa  88.2  4e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.117671  unclonable  0.0000000289708 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0593  hypothetical protein  32.28 
 
 
465 aa  87.4  7e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.336496  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2238  hypothetical protein  34.69 
 
 
232 aa  81.6  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2011  hypothetical protein  24.42 
 
 
606 aa  79  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000217201  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  51.52 
 
 
1979 aa  52.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>