More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2983 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2983  magnesium and cobalt transport protein CorA  100 
 
 
354 aa  719    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.23033  normal  0.025318 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2713  magnesium and cobalt transport protein CorA  55.07 
 
 
367 aa  424  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3419  magnesium and cobalt transport protein CorA  53.14 
 
 
355 aa  392  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000222754  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0646  magnesium and cobalt transport protein CorA  53.58 
 
 
353 aa  392  1e-108  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1189  magnesium/cobalt transporter CorA  53.14 
 
 
365 aa  389  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0252  magnesium and cobalt transport protein CorA  50.57 
 
 
353 aa  380  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000575717 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0267  magnesium and cobalt transport protein CorA  50.57 
 
 
353 aa  378  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0176371  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3012  magnesium and cobalt transport protein CorA  46.13 
 
 
354 aa  362  8e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.815439  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1617  magnesium and cobalt transport protein CorA  49.44 
 
 
354 aa  359  4e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0359  magnesium and cobalt transport protein CorA  50.14 
 
 
351 aa  359  4e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000101398  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2520  magnesium and cobalt transport protein CorA  47.85 
 
 
357 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00107852  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1399  magnesium and cobalt transport protein CorA  50.57 
 
 
354 aa  353  2e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0376  magnesium and cobalt transport protein CorA  49.86 
 
 
351 aa  354  2e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00229946  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1740  magnesium and cobalt transport protein CorA  49.13 
 
 
354 aa  351  1e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2085  magnesium and cobalt transport protein CorA  47.14 
 
 
353 aa  347  2e-94  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2768  magnesium and cobalt transport protein CorA  47.7 
 
 
354 aa  346  3e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1006  magnesium and cobalt transport protein CorA  46.22 
 
 
547 aa  345  6e-94  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1725  magnesium and cobalt transport protein CorA  46.53 
 
 
372 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0787  magnesium and cobalt transport protein CorA  54.11 
 
 
341 aa  337  9.999999999999999e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00324534  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0582  magnesium and cobalt transport protein CorA  43.02 
 
 
354 aa  335  7e-91  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000747796  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1870  magnesium and cobalt transport protein CorA  46.02 
 
 
363 aa  334  1e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0556  magnesium and cobalt transport protein CorA  43.59 
 
 
354 aa  333  2e-90  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_521  magnesium and cobalt transport protein  43.87 
 
 
354 aa  326  3e-88  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.015404  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0433  magnesium and cobalt transport protein CorA  44.1 
 
 
356 aa  325  6e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1521  magnesium/cobalt transporter CorA  43.87 
 
 
375 aa  325  7e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.954015 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0696  magnesium and cobalt transport protein CorA  47.31 
 
 
355 aa  322  5e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181573  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1912  magnesium and cobalt transport protein CorA  45.24 
 
 
374 aa  322  6e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107117  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1913  magnesium and cobalt transport protein CorA  44.48 
 
 
375 aa  319  6e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1732  magnesium and cobalt transport protein CorA  44.19 
 
 
355 aa  317  2e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2244  magnesium and cobalt transport protein CorA  45.53 
 
 
357 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000192841  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3662  magnesium and cobalt transport protein  43.63 
 
 
358 aa  311  1e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10618  Magnesium and cobalt transport protein  40.4 
 
 
363 aa  299  5e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1416  magnesium/cobalt transporter CorA  43.06 
 
 
354 aa  298  9e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.623057  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1928  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.17 
 
 
362 aa  298  1e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185921  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2333  magnesium and cobalt transport protein CorA  43.3 
 
 
387 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0795  magnesium/cobalt transporter CorA  40.29 
 
 
380 aa  294  1e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3204  magnesium and cobalt transport protein CorA  41.19 
 
 
379 aa  289  4e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.648086  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0668  magnesium and cobalt transport protein CorA  45.7 
 
 
385 aa  289  6e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0284032  normal  0.71068 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0648  magnesium and cobalt transport protein CorA  45.7 
 
 
385 aa  289  6e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1041  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.35 
 
 
348 aa  288  1e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.78816  normal  0.435904 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4989  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.24 
 
 
376 aa  277  2e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.627889 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1581  magnesium/cobalt transporter CorA  39 
 
 
367 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0107279  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2937  putative cobalt/magnesium uptake transporter  39.14 
 
 
354 aa  269  7e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2791  putative cobalt/magnesium uptake transporter  39.43 
 
 
354 aa  268  8.999999999999999e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0436  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.28 
 
 
354 aa  266  5e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2267  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.62 
 
 
360 aa  265  7e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0974553 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0137  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.4 
 
 
368 aa  263  4e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1997  magnesium and cobalt transport protein CorA  41.11 
 
 
395 aa  261  1e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.223184  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0489  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.53 
 
 
383 aa  260  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0173  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.89 
 
 
352 aa  260  3e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4191  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.02 
 
 
382 aa  257  2e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.259759  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0865  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.02 
 
 
352 aa  255  7e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.916446  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2107  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.01 
 
 
381 aa  254  2.0000000000000002e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.61648 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1738  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.04 
 
 
352 aa  251  9.000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.277865 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2665  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.73 
 
 
390 aa  249  7e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.111176 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0739  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.78 
 
 
374 aa  248  8e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000829129 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4182  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.59 
 
 
381 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1587  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.36 
 
 
353 aa  248  1e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.188358  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4221  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.59 
 
 
381 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1992  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.74 
 
 
360 aa  244  9.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2170  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.01 
 
 
372 aa  241  9e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.574954 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2074  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.84 
 
 
357 aa  237  2e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2182  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.42 
 
 
327 aa  231  1e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.709225  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1371  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.08 
 
 
387 aa  228  1e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2667  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.39 
 
 
355 aa  225  1e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0785  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.14 
 
 
332 aa  224  2e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0685097  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0969  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.07 
 
 
356 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.231272  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4037  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.37 
 
 
327 aa  216  5.9999999999999996e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0054  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.33 
 
 
325 aa  212  5.999999999999999e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349471  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1102  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.21 
 
 
351 aa  210  2e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.528236  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3070  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.34 
 
 
339 aa  200  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2408  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.01 
 
 
339 aa  199  6e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.518253  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1294  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.15 
 
 
322 aa  196  6e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0267  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.25 
 
 
316 aa  194  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2224  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.65 
 
 
291 aa  190  4e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000656607  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1811  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.87 
 
 
333 aa  189  9e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3530  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.49 
 
 
357 aa  188  1e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.203134  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0560  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.09 
 
 
321 aa  188  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0933  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.33 
 
 
325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1239  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.06 
 
 
325 aa  173  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3587  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.66 
 
 
325 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.677282  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4178  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.05 
 
 
322 aa  166  5.9999999999999996e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2264  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.82 
 
 
325 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6358  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.94 
 
 
325 aa  166  8e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1721  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.94 
 
 
325 aa  166  8e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2266  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.9 
 
 
325 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.802444  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1735  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.94 
 
 
325 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596714  normal  0.577516 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2077  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.9 
 
 
325 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2133  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.9 
 
 
325 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1081  magnesium/cobalt transporter CorA  29.77 
 
 
321 aa  163  3e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.99494  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2140  magnesium/cobalt transporter CorA  28.28 
 
 
323 aa  164  3e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5013  magnesium/cobalt transporter CorA  30.49 
 
 
325 aa  164  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.117877  normal  0.108957 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1996  magnesium/cobalt transporter CorA  32.61 
 
 
325 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.215662  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2504  putative metal ion transport protein  29.74 
 
 
321 aa  162  7e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1864  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.32 
 
 
321 aa  162  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0979  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.56 
 
 
325 aa  162  9e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.272451  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2311  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.9 
 
 
325 aa  162  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1642  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.62 
 
 
325 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2270  Mg2 transporter protein CorA family protein  30.33 
 
 
314 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0371321  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11264  magnesium and cobalt transport transmembrane protein corA  30.33 
 
 
366 aa  160  3e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00777117  hitchhiker  0.000740018 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>