48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2811 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2811  potassium channel protein  100 
 
 		 399 aa  813    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.775034  normal  0.031805 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0790  TrkA-C  72.04 
 
 		 410 aa  604  9.999999999999999e-173  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000750791  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1552  TrkA domain-containing protein  48.59 
 
 		 400 aa  386  1e-106  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.724565  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0734  hypothetical protein  47.79 
 
 		 402 aa  328  9e-89  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1044  hypothetical protein  45.45 
 
 		 399 aa  327  3e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1522  TrkA-C domain protein  44.5 
 
 		 405 aa  321  1.9999999999999998e-86  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.551094  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1691  TrkA-C domain protein  43.98 
 
 		 401 aa  317  2e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0838  TrkA-C domain protein  44.39 
 
 		 405 aa  311  9e-84  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0368  TrkA-C domain protein  41.07 
 
 		 404 aa  310  2.9999999999999997e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2179  PhoU family protein  47.62 
 
 		 310 aa  151  2e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0292095  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0932  TrkA-C domain protein  44.51 
 
 		 190 aa  150  3e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0931  PhoU family protein  42.13 
 
 		 184 aa  142  9.999999999999999e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1689  GntR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 214 aa  51.2  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.248739  normal  0.372482 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1170  TrkA domain-containing protein  34.33 
 
 		 220 aa  48.5  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.241712  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1148  TrkA domain-containing protein  34.33 
 
 		 220 aa  48.5  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.967319  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1754  hypothetical protein  42.86 
 
 		 227 aa  47.8  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  37.04 
 
 		 668 aa  47.8  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0257  sodium/hydrogen exchanger  42.11 
 
 		 674 aa  47  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0120325  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0062  putative potassium/proton antiporter  40 
 
 		 720 aa  47  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000657168  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1338  transcriptional regulator, GntR family  36.62 
 
 		 201 aa  46.6  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0674  potassium uptake protein TrkA  37.5 
 
 		 219 aa  46.2  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  42.31 
 
 		 356 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  42.31 
 
 		 356 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0233  TrkA-C domain protein  36.51 
 
 		 164 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1200  TrkA domain-containing protein  37.93 
 
 		 212 aa  44.7  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.228424  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0799  TrkA-C domain protein  35.71 
 
 		 162 aa  45.1  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.6922  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  39.22 
 
 		 354 aa  44.3  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  41.07 
 
 		 332 aa  43.9  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0362  TrkA-C domain protein  36.51 
 
 		 159 aa  43.1  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.541071 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2680  TrkA domain-containing protein  32.86 
 
 		 221 aa  43.5  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000338081  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  37.93 
 
 		 355 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  32.76 
 
 		 581 aa  43.1  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1274  putative sodium:sulfate symporter  38.6 
 
 		 610 aa  43.1  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14360  putative sodium:sulfate symporter  38.6 
 
 		 610 aa  43.1  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1611  sodium/hydrogen exchanger  27.33 
 
 		 660 aa  43.1  0.009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2967  sodium/hydrogen exchanger  35.09 
 
 		 762 aa  43.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.619834 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5202  trkA domain protein  29.91 
 
 		 165 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.137218  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4872  TrkA domain-containing protein  28.97 
 
 		 165 aa  43.1  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0357705  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3993  potassium uptake protein, TrkA family  32.86 
 
 		 221 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1159  potassium uptake protein, TrkA family  32.86 
 
 		 221 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4081  potassium uptake protein, TrkA family  32.86 
 
 		 221 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4098  potassium uptake protein, TrkA family  32.86 
 
 		 221 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00103413  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1273  TrkA-N  42.86 
 
 		 224 aa  42.7  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4191  TrkA family potassium uptake protein  32.86 
 
 		 221 aa  42.7  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.841712  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3736  Trk family potassium uptake protein  32.86 
 
 		 221 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3720  Trk family potassium uptake protein  32.86 
 
 		 221 aa  42.7  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.430715  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3888  TrkA family potassium uptake protein  32.86 
 
 		 221 aa  42.7  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4027  TrkA family potassium uptake protein  32.86 
 
 		 221 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.426006  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>