More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1859 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1859  thioredoxin  100 
 
 		 130 aa  273  8e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.263827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1934  Thioredoxin domain protein  39.52 
 
 		 140 aa  121  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0887571  normal  0.423901 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0227  thioredoxin-related  44.19 
 
 		 130 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0815  thioredoxin-related  41.09 
 
 		 130 aa  116  9e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.221245  normal  0.321644 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  35.45 
 
 		 259 aa  77.4  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3594  thioredoxin  33.33 
 
 		 257 aa  75.1  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0521557 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1006  thioredoxin  33 
 
 		 259 aa  72  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1456  thioredoxin  33.64 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724668  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_56519  predicted protein  41.1 
 
 		 700 aa  70.5  0.000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.532885  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  30.1 
 
 		 105 aa  70.1  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2201  thioredoxin  32.08 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0838449  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  32.35 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1675  thioredoxin  30.84 
 
 		 110 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.140064  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  33.01 
 
 		 107 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0405  thioredoxin  36.11 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1708  thioredoxin  29.36 
 
 		 110 aa  67.8  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00102285  normal  0.772138 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1294  thioredoxin  33.67 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  29.36 
 
 		 110 aa  67.4  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1746  thioredoxin  30.84 
 
 		 110 aa  67  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0618  thioredoxin  34.44 
 
 		 146 aa  67  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  31.37 
 
 		 280 aa  67  0.00000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4084  thioredoxin  35.23 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  31.13 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  30.1 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000534537  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0505  thioredoxin  31.43 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000129794  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2682  thioredoxin  34.69 
 
 		 106 aa  64.7  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.899838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2304  thioredoxin  31.43 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  32.58 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  33.65 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3151  thioredoxin  27.18 
 
 		 113 aa  63.5  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  28.97 
 
 		 108 aa  63.5  0.0000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3281  thioredoxin  31.13 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  30.69 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  31.18 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  29.17 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  31.18 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  31.18 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3067  thioredoxin  30.11 
 
 		 109 aa  63.5  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.788534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  31.18 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  31.18 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2784  thioredoxin  30.61 
 
 		 127 aa  63.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0698118 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  31.18 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  31.18 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  29.63 
 
 		 109 aa  62  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429326  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4107  thioredoxin  24.04 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000794835 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  29.13 
 
 		 107 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0127  thioredoxin  34.69 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000655412  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4854  thioredoxin  29.35 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  34.02 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0093  thioredoxin  28 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548015 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  35.11 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0621  thioredoxin  31.52 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000184635  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  30.28 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1679  thioredoxin  31.11 
 
 		 98 aa  62  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  35.48 
 
 		 293 aa  62  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0404  thioredoxin  31.19 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4407  thioredoxin  29.81 
 
 		 113 aa  62  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1976  thioredoxin  32.95 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4854  thioredoxin  33.7 
 
 		 111 aa  61.6  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.188061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3230  thioredoxin  30.19 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000930614  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7155  thioredoxin  31.58 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0404  thioredoxin  32.08 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000190247  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5085  thioredoxin  31.52 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03659  thioredoxin  28.28 
 
 		 109 aa  60.8  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000771604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  28.28 
 
 		 109 aa  60.8  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  28.28 
 
 		 109 aa  60.8  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03608  hypothetical protein  28.28 
 
 		 109 aa  60.8  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000236523  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0363  thioredoxin  29.36 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000145924  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  28.28 
 
 		 109 aa  60.8  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  28.28 
 
 		 109 aa  60.8  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  28.28 
 
 		 109 aa  60.8  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  28.28 
 
 		 109 aa  60.8  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  28.28 
 
 		 109 aa  60.8  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  28.28 
 
 		 109 aa  60.8  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  28.28 
 
 		 109 aa  60.8  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  28.28 
 
 		 109 aa  60.8  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  28.28 
 
 		 109 aa  60.8  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  28.28 
 
 		 109 aa  60.8  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  30.11 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  30.11 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0861  Thioredoxin domain  28 
 
 		 104 aa  60.8  0.000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.305166 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  30.11 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0603  thioredoxin domain-containing protein  31.19 
 
 		 287 aa  60.8  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0802586  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2099  thioredoxin  32.04 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0357  thioredoxin  28.57 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  28.28 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  26.47 
 
 		 106 aa  60.8  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  30.11 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  30.11 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  30.11 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1247  thioredoxin  25.93 
 
 		 113 aa  60.8  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000845354  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2360  thioredoxin domain-containing protein  30.56 
 
 		 111 aa  60.5  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.177499  hitchhiker  0.00135525 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  27.19 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  27.27 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0265  thioredoxin  40.24 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.28448  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  28.28 
 
 		 109 aa  60.5  0.000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  28.87 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  28.71 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3007  Thioredoxin domain protein  32.18 
 
 		 286 aa  60.1  0.000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  28.87 
 
 		 146 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>