More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1542 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1542  co-chaperonin GroES  100 
 
 		 92 aa  179  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1090  co-chaperonin GroES  65.17 
 
 		 90 aa  125  3e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.908111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1055  co-chaperonin GroES  60.67 
 
 		 90 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0958  co-chaperonin GroES  41.67 
 
 		 96 aa  77  0.00000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0521  co-chaperonin GroES  46.07 
 
 		 89 aa  75.9  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.125145 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0611  Chaperonin Cpn10  40.86 
 
 		 98 aa  75.5  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.740191  normal  0.337946 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0362  chaperonin Cpn10  37.36 
 
 		 102 aa  74.3  0.0000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.686615  normal  0.421985 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3678  chaperonin Cpn10  40.86 
 
 		 100 aa  74.3  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00275768  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0512  co-chaperonin GroES  43.01 
 
 		 94 aa  73.6  0.0000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1919  chaperonin Cpn10  42.55 
 
 		 100 aa  73.2  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1088  chaperonin Cpn10  38.71 
 
 		 98 aa  73.2  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000000466109  normal  0.037414 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3373  chaperonin Cpn10  39.78 
 
 		 94 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0160  chaperonin Cpn10  38.71 
 
 		 94 aa  72.8  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1231  chaperonin Cpn10  36.17 
 
 		 96 aa  72.8  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1212  chaperonin Cpn10  42.11 
 
 		 101 aa  72  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.694559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01330  Co-chaperonin GroES  41.3 
 
 		 95 aa  71.6  0.000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4130  chaperonin Cpn10  41.05 
 
 		 101 aa  71.6  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00154355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0632  co-chaperonin GroES  39.56 
 
 		 101 aa  70.9  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2104  co-chaperonin GroES  35.48 
 
 		 94 aa  70.5  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00575627  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2067  co-chaperonin GroES  35.48 
 
 		 94 aa  70.5  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000661626  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2053  chaperonin Cpn10  44.57 
 
 		 98 aa  70.1  0.000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2008  chaperonin Cpn10  37.63 
 
 		 94 aa  70.5  0.000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.377969  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2874  chaperonin Cpn10  38.71 
 
 		 94 aa  69.7  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000282007  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0453  chaperonin Cpn10  38.95 
 
 		 95 aa  69.7  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0541  co-chaperonin GroES  36.84 
 
 		 95 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000000160733  normal  0.58747 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1007  chaperonin Cpn10  37.36 
 
 		 98 aa  69.3  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.103756 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2803  co-chaperonin GroES  37.23 
 
 		 95 aa  68.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000132343  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0449  chaperonin Cpn10  39.36 
 
 		 95 aa  69.3  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00196884  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2523  chaperonin Cpn10  38.71 
 
 		 104 aa  68.6  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2175  chaperonin Cpn10  39.36 
 
 		 96 aa  68.6  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.95289 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0309  hypothetical protein  36.78 
 
 		 92 aa  68.2  0.00000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6002  co-chaperonin GroES  38.46 
 
 		 101 aa  67.8  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0711534 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2625  chaperonin Cpn10  39.36 
 
 		 96 aa  67.8  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2920  chaperonin 10 Kd subunit  35.05 
 
 		 103 aa  67.8  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.907264  normal  0.269903 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1076  chaperonin Cpn10  37.76 
 
 		 98 aa  67.4  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.12184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3734  co-chaperonin GroES  41.3 
 
 		 97 aa  67.4  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.619596  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2885  chaperonin cpn10  35.48 
 
 		 103 aa  67.4  0.00000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.478438  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3660  co-chaperonin GroES  41.3 
 
 		 97 aa  67.4  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0336408  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1501  chaperonin Cpn10  34.78 
 
 		 93 aa  67.4  0.00000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00381683  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3593  co-chaperonin GroES  41.3 
 
 		 97 aa  67.4  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00675  co-chaperonin GroES  37.93 
 
 		 91 aa  67  0.00000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0489  chaperonin Cpn10  38.95 
 
 		 100 aa  67  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000458511  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3714  co-chaperonin GroES  42.39 
 
 		 97 aa  67  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.31168 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4306  co-chaperonin GroES  38.3 
 
 		 96 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235031  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0549  co-chaperonin GroES  39.36 
 
 		 95 aa  66.6  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000019989  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3627  co-chaperonin GroES  35.87 
 
 		 103 aa  66.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.711938  normal  0.0667876 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0028  co-chaperonin GroES  36.17 
 
 		 95 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.32588e-17  normal  0.625386 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0034  chaperonin Cpn10  37.23 
 
 		 95 aa  66.6  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0295415  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2138  co-chaperonin GroES  41.94 
 
 		 95 aa  65.9  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.580367  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2230  co-chaperonin GroES  34.04 
 
 		 95 aa  65.9  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0596  co-chaperonin GroES  32.98 
 
 		 95 aa  65.9  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.474477  normal  0.0912075 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1407  chaperonin Cpn10  40.86 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.780371 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0353  co-chaperonin GroES  36.56 
 
 		 94 aa  65.9  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000711109  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1195  co-chaperonin GroES  38.3 
 
 		 95 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0507909  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3082  chaperonin Cpn10  37.23 
 
 		 105 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3290  chaperonin Cpn10  37.89 
 
 		 95 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000053121  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6246  chaperonin Cpn10  35.96 
 
 		 93 aa  65.5  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1405  co-chaperonin GroES  40.43 
 
 		 94 aa  65.1  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000307277  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2474  co-chaperonin GroES  38.3 
 
 		 95 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0230053  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1737  co-chaperonin GroES  36.84 
 
 		 95 aa  65.1  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.168742  hitchhiker  0.00175489 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3428  chaperonin Cpn10  37.23 
 
 		 105 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0248  chaperonin Cpn10  35.11 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000171869  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1789  co-chaperonin GroES  37.63 
 
 		 103 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3375  chaperonin Cpn10  36.84 
 
 		 95 aa  64.7  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0900877 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3063  co-chaperonin GroES  37.23 
 
 		 95 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428511 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2520  chaperone Hsp10, part of GroE chaperone system  37.89 
 
 		 95 aa  64.7  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.691961  normal  0.971453 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3359  co-chaperonin GroES  34.69 
 
 		 95 aa  64.7  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.755845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1305  co-chaperonin GroES  34.04 
 
 		 94 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000222526  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1827  co-chaperonin GroES  35.63 
 
 		 92 aa  64.3  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0862396 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0120  chaperonin Cpn10  37.23 
 
 		 96 aa  64.3  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5366  chaperonin Cpn10  38.3 
 
 		 95 aa  64.3  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.583884  normal  0.676466 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2295  chaperonin Cpn10  37.36 
 
 		 88 aa  63.9  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1856  groes  38.95 
 
 		 96 aa  64.3  0.0000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.70749  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4586  co-chaperonin GroES  36.84 
 
 		 95 aa  64.3  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.480478 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02000  Chaperonin GroES (HSP10)  38.71 
 
 		 94 aa  63.9  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0662925  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0232  chaperonin Cpn10  34.04 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4326  co-chaperonin GroES  38.04 
 
 		 103 aa  63.9  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.212063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7829  chaperonin Cpn10  34.74 
 
 		 95 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0605  chaperonin Cpn10  34.74 
 
 		 95 aa  63.5  0.0000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.131818 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2494  chaperonin Cpn10  42.22 
 
 		 87 aa  63.5  0.0000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000670366  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2130  chaperonin Cpn10  35.11 
 
 		 95 aa  63.5  0.0000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000318883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1056  chaperonin Cpn10  44.33 
 
 		 97 aa  63.5  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.900711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0183  chaperonin Cpn10  37.23 
 
 		 96 aa  63.5  0.0000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3335  chaperonin Cpn10  36.84 
 
 		 96 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3339  co-chaperonin GroES  35.11 
 
 		 95 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.148697  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0409  co-chaperonin GroES  34.78 
 
 		 98 aa  63.2  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1768  chaperonin Cpn10  34.74 
 
 		 95 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.939398  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5254  chaperonin Cpn10  34.02 
 
 		 105 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.321205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2771  10 Kd chaperone GroES  37.23 
 
 		 95 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  8.05146e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0985  chaperonin Cpn10  34.48 
 
 		 98 aa  63.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.844996  normal  0.719219 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1844  co-chaperonin GroES  34.48 
 
 		 91 aa  62.8  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.986067  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5138  co-chaperonin GroES  36.56 
 
 		 103 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2610  10 kDa chaperonin (Cpn10), groES  35.11 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000523216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4543  10 kDa chaperonin (Cpn10), groES  35.11 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000123576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2928  chaperonin Cpn10  32.98 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000296393  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0794  co-chaperonin GroES  36.84 
 
 		 95 aa  63.2  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0142401 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6083  co-chaperonin GroES  34.78 
 
 		 98 aa  63.2  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0316  chaperonin Cpn10  33.33 
 
 		 92 aa  63.2  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0011552  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0833  co-chaperonin GroES  33.68 
 
 		 95 aa  62.4  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000406281  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0145  co-chaperonin GroES  34.78 
 
 		 103 aa  62.8  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>