More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0183 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0183  chaperonin Cpn10  100 
 
 		 96 aa  189  1e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0379  chaperonin Cpn10  63.44 
 
 		 95 aa  127  8.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000945621  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2821  chaperonin Cpn10  61.7 
 
 		 95 aa  120  5e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0107479  normal  0.438388 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1305  co-chaperonin GroES  61.7 
 
 		 94 aa  120  8e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000222526  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0679  co-chaperonin GroES  57.89 
 
 		 95 aa  118  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.221594 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05480  Co-chaperonin GroES  62.5 
 
 		 96 aa  118  1.9999999999999998e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0541  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 		 95 aa  118  3e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000000160733  normal  0.58747 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1919  chaperonin Cpn10  56.25 
 
 		 100 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3647  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 		 97 aa  116  7.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0833  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 		 95 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000406281  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0160  chaperonin Cpn10  58.06 
 
 		 94 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2803  co-chaperonin GroES  57.89 
 
 		 95 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000132343  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0782  co-chaperonin GroES  57.89 
 
 		 95 aa  114  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000134232  normal  0.229637 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1405  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 		 94 aa  115  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000307277  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1937  co-chaperonin GroES  57.89 
 
 		 95 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000542677  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2008  chaperonin Cpn10  55.91 
 
 		 94 aa  113  6.9999999999999995e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.377969  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04660  Co-chaperonin GroES  58.51 
 
 		 97 aa  113  6.9999999999999995e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00798314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2874  chaperonin Cpn10  59.14 
 
 		 94 aa  113  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000282007  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0497  co-chaperonin GroES  57.89 
 
 		 95 aa  113  7.999999999999999e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000741059  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0641  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 		 96 aa  113  8.999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0534  co-chaperonin GroES  58.95 
 
 		 96 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0120  chaperonin Cpn10  57.89 
 
 		 96 aa  113  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2928  chaperonin Cpn10  55.79 
 
 		 96 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000296393  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01330  Co-chaperonin GroES  57.89 
 
 		 95 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3816  co-chaperonin GroES  57.89 
 
 		 96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0863  co-chaperonin GroES  57.89 
 
 		 96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000337259  normal  0.081408 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0578  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 		 96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.196352  normal  0.456012 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1195  co-chaperonin GroES  57.89 
 
 		 95 aa  111  3e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0507909  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2529  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 		 97 aa  111  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0262789 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28700  Co-chaperonin GroES  58.51 
 
 		 97 aa  111  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.235736  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2002  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 		 97 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2657  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 		 96 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3154  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 		 97 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3176  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 		 97 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.521457  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0911  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 		 97 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.740154  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1864  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 		 97 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.563369  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0684  chaperonin Cpn10  59.78 
 
 		 98 aa  110  4.0000000000000004e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448895  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0449  chaperonin Cpn10  55.79 
 
 		 95 aa  111  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00196884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1457  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 		 97 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0830  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 		 97 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000337917  decreased coverage  0.00000232712 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0615  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 		 96 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0242301 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3118  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 		 97 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.143414  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0377  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 		 97 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00305942  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0749  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 		 97 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0685029 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0732  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 		 97 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138377  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2741  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 		 97 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.260788  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0859  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 		 97 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00336057  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3954  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 		 97 aa  110  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000645476  normal  0.0983553 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3339  co-chaperonin GroES  51.58 
 
 		 95 aa  110  6e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.148697  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3063  co-chaperonin GroES  57.89 
 
 		 95 aa  110  6e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428511 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2175  chaperonin Cpn10  55.21 
 
 		 96 aa  110  6e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.95289 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2334  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 		 96 aa  110  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0638712  normal  0.0156201 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2474  co-chaperonin GroES  58.95 
 
 		 95 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0230053  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0735  co-chaperonin GroES  57.61 
 
 		 98 aa  110  7.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.224017  normal  0.240552 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4258  chaperonin Cpn10  59.14 
 
 		 102 aa  110  7.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5811  chaperonin Cpn10  58.06 
 
 		 97 aa  110  8.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.907137  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0425  co-chaperonin GroES  56.38 
 
 		 96 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.1607099999999999e-20  hitchhiker  0.002869 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2589  Chaperonin Cpn10  56.38 
 
 		 97 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.565547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0438  co-chaperonin GroES  53.68 
 
 		 96 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000705596  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4453  chaperonin Cpn10  56.84 
 
 		 102 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4026  Chaperonin Cpn10  61.7 
 
 		 103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3058  co-chaperonin GroES  53.68 
 
 		 98 aa  108  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.495905 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0443  chaperonin Cpn10  56.99 
 
 		 97 aa  108  3e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1806  co-chaperonin GroES  54.74 
 
 		 96 aa  108  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265316  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0365  co-chaperonin GroES  57.89 
 
 		 96 aa  108  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000241312  hitchhiker  0.00832872 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0020  co-chaperonin GroES  55.79 
 
 		 95 aa  108  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.436916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1547  co-chaperonin GroES  56.84 
 
 		 95 aa  107  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.807216  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0234  chaperonin GroS  55.32 
 
 		 97 aa  107  6e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3373  chaperonin Cpn10  51.61 
 
 		 94 aa  106  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0028  co-chaperonin GroES  50.53 
 
 		 95 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.32588e-17  normal  0.625386 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1677  co-chaperonin GroES  56.38 
 
 		 97 aa  106  9.000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0543  co-chaperonin GroES  51.58 
 
 		 96 aa  106  9.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00172283  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0699  co-chaperonin GroES  51.58 
 
 		 96 aa  106  9.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000000127096  unclonable  0.0000000000292135 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1519  co-chaperonin GroES  55.79 
 
 		 96 aa  106  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000013656  normal  0.699142 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0706  co-chaperonin GroES  53.68 
 
 		 96 aa  105  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6544  chaperonin Cpn10  53.19 
 
 		 97 aa  106  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.303398  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16550  Co-chaperonin GroES  53.19 
 
 		 98 aa  106  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.639377  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3842  chaperonin Cpn10  54.84 
 
 		 102 aa  106  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4232  chaperonin Cpn10  53.76 
 
 		 104 aa  106  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0774007 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1154  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2599  10 kD chaperone  59.57 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0092  co-chaperonin GroES  52.63 
 
 		 96 aa  105  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000241636  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1173  co-chaperonin GroES  52.17 
 
 		 98 aa  105  2e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.749354  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0291  Chaperonin Cpn10  53.68 
 
 		 96 aa  105  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0587447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0985  chaperonin Cpn10  57.45 
 
 		 98 aa  105  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.844996  normal  0.719219 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4306  co-chaperonin GroES  49.47 
 
 		 96 aa  105  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235031  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0512  co-chaperonin GroES  57.89 
 
 		 94 aa  104  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2922  co-chaperonin GroES  53.68 
 
 		 96 aa  105  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000127335  n/a   
 
 
 
NC_010730  SYO3AOP1_0587  chaperonin Cpn10  56.84 
 
 		 98 aa  105  3e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0674011  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5284  co-chaperonin GroES  51.04 
 
 		 104 aa  105  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.262452 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0639  co-chaperonin GroES  49.47 
 
 		 96 aa  105  3e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00560672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0958  co-chaperonin GroES  50 
 
 		 96 aa  105  3e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0619  chaperonin Cpn10  57.45 
 
 		 104 aa  104  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143984  normal  0.40407 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1119  chaperonin Cpn10  54.74 
 
 		 96 aa  104  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5366  chaperonin Cpn10  50.53 
 
 		 95 aa  104  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.583884  normal  0.676466 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0635  chaperonin Cpn10  55.32 
 
 		 97 aa  104  4e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3233  co-chaperonin GroES  50 
 
 		 105 aa  103  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.211647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0549  co-chaperonin GroES  53.68 
 
 		 95 aa  104  5e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000019989  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0742  co-chaperonin GroES  51.58 
 
 		 96 aa  103  6e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2228  co-chaperonin GroES  50 
 
 		 105 aa  103  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.145562  normal  0.505926 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>