More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1090 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1090  co-chaperonin GroES  100 
 
 		 90 aa  177  2.9999999999999997e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.908111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1542  co-chaperonin GroES  65.17 
 
 		 92 aa  125  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1055  co-chaperonin GroES  61.8 
 
 		 90 aa  113  8.999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0362  chaperonin Cpn10  46.81 
 
 		 102 aa  82  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.686615  normal  0.421985 
 
 
-
 
NC_002950  PG0521  co-chaperonin GroES  46.07 
 
 		 89 aa  79.3  0.00000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.125145 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0958  co-chaperonin GroES  45.26 
 
 		 96 aa  79.3  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0449  chaperonin Cpn10  45.26 
 
 		 95 aa  79  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00196884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0453  chaperonin Cpn10  44.68 
 
 		 95 aa  78.2  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0316  chaperonin Cpn10  42.7 
 
 		 92 aa  77.8  0.00000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0011552  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1231  chaperonin Cpn10  42.11 
 
 		 96 aa  77.4  0.00000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1501  chaperonin Cpn10  41.94 
 
 		 93 aa  77  0.00000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00381683  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6002  co-chaperonin GroES  45.74 
 
 		 101 aa  77  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0711534 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0512  co-chaperonin GroES  43.62 
 
 		 94 aa  76.6  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2008  chaperonin Cpn10  45.16 
 
 		 94 aa  76.3  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.377969  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0632  co-chaperonin GroES  44.68 
 
 		 101 aa  76.3  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0309  hypothetical protein  42.17 
 
 		 92 aa  75.5  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4258  chaperonin Cpn10  43.96 
 
 		 102 aa  75.9  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0541  co-chaperonin GroES  42.39 
 
 		 95 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000000160733  normal  0.58747 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00675  co-chaperonin GroES  41.57 
 
 		 91 aa  75.5  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0443  chaperonin Cpn10  38.95 
 
 		 97 aa  75.9  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6246  chaperonin Cpn10  41.38 
 
 		 93 aa  75.5  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0619  chaperonin Cpn10  43.62 
 
 		 104 aa  75.1  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143984  normal  0.40407 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1305  co-chaperonin GroES  40.22 
 
 		 94 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000222526  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1212  chaperonin Cpn10  44.68 
 
 		 101 aa  75.1  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.694559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3678  chaperonin Cpn10  39.36 
 
 		 100 aa  74.7  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00275768  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1844  co-chaperonin GroES  40.45 
 
 		 91 aa  74.7  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.986067  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0160  chaperonin Cpn10  41.94 
 
 		 94 aa  74.7  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1086  chaperonin Cpn10  43.16 
 
 		 98 aa  74.3  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.692359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0489  chaperonin Cpn10  41.49 
 
 		 100 aa  74.3  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000458511  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1282  chaperonin Cpn10  42.11 
 
 		 104 aa  74.3  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.509292 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2130  chaperonin Cpn10  41.05 
 
 		 95 aa  73.9  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000318883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3373  chaperonin Cpn10  39.78 
 
 		 94 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2803  co-chaperonin GroES  41.05 
 
 		 95 aa  73.9  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000132343  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2067  co-chaperonin GroES  42.86 
 
 		 94 aa  73.6  0.0000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000661626  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2104  co-chaperonin GroES  42.86 
 
 		 94 aa  73.6  0.0000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00575627  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1827  co-chaperonin GroES  41.18 
 
 		 92 aa  73.6  0.0000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0862396 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0925  chaperonin Cpn10  44.09 
 
 		 97 aa  73.6  0.0000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000344509  hitchhiker  7.97374e-18 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3842  chaperonin Cpn10  42.11 
 
 		 102 aa  72.8  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2928  chaperonin Cpn10  38.95 
 
 		 96 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000296393  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0794  co-chaperonin GroES  42.39 
 
 		 95 aa  72.8  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0142401 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2599  10 kD chaperone  42.39 
 
 		 103 aa  72.8  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3375  chaperonin Cpn10  42.39 
 
 		 95 aa  73.6  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0900877 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1154  co-chaperonin GroES  43.48 
 
 		 103 aa  73.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1007  chaperonin Cpn10  42.86 
 
 		 98 aa  72.8  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.103756 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1856  groes  41.05 
 
 		 96 aa  73.2  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.70749  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02000  Chaperonin GroES (HSP10)  44.68 
 
 		 94 aa  73.2  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0662925  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4026  Chaperonin Cpn10  42.39 
 
 		 103 aa  72.4  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4130  chaperonin Cpn10  42.55 
 
 		 101 aa  72  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00154355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4232  chaperonin Cpn10  42.11 
 
 		 104 aa  72.4  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0774007 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5581  chaperonin Cpn10  42.39 
 
 		 95 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5464  co-chaperonin GroES  43.48 
 
 		 104 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.835161  normal  0.183317 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2885  chaperonin cpn10  43.18 
 
 		 103 aa  72  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.478438  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0765  co-chaperonin GroES  44.32 
 
 		 90 aa  72.8  0.000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2610  10 kDa chaperonin (Cpn10), groES  41.05 
 
 		 105 aa  72  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000523216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4543  10 kDa chaperonin (Cpn10), groES  41.05 
 
 		 105 aa  72  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000123576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1919  chaperonin Cpn10  43.48 
 
 		 100 aa  72.4  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5811  chaperonin Cpn10  38.95 
 
 		 97 aa  72.8  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.907137  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0409  co-chaperonin GroES  41.11 
 
 		 98 aa  72  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0028  co-chaperonin GroES  36.84 
 
 		 95 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.32588e-17  normal  0.625386 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0379  chaperonin Cpn10  40.66 
 
 		 95 aa  72  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000945621  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6083  co-chaperonin GroES  41.11 
 
 		 98 aa  72  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2114  co-chaperonin GroES  40 
 
 		 104 aa  71.6  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0985  chaperonin Cpn10  39.76 
 
 		 98 aa  71.2  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.844996  normal  0.719219 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0611  Chaperonin Cpn10  42.22 
 
 		 98 aa  71.6  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.740191  normal  0.337946 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2920  chaperonin 10 Kd subunit  40.43 
 
 		 103 aa  71.2  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.907264  normal  0.269903 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3335  chaperonin Cpn10  39.36 
 
 		 96 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3660  chaperonin Cpn10  39.36 
 
 		 96 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.39196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0674  chaperonin Cpn10  41.3 
 
 		 95 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248436  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0833  co-chaperonin GroES  39.13 
 
 		 95 aa  70.9  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000406281  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4306  co-chaperonin GroES  38.95 
 
 		 96 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235031  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0232  chaperonin Cpn10  36.84 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0605  chaperonin Cpn10  41.3 
 
 		 95 aa  70.9  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.131818 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1770  chaperonin Cpn10  41.3 
 
 		 95 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0933044  normal  0.173989 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1165  chaperonin Cpn10  42.55 
 
 		 96 aa  70.5  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.731664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2874  chaperonin Cpn10  41.94 
 
 		 94 aa  70.9  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000282007  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4453  chaperonin Cpn10  41.94 
 
 		 102 aa  70.5  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1195  co-chaperonin GroES  41.05 
 
 		 95 aa  70.9  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0507909  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1768  chaperonin Cpn10  41.3 
 
 		 95 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.939398  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0883  Bvg accessory factor  41.67 
 
 		 96 aa  70.5  0.000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000200777  hitchhiker  0.000120487 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1088  chaperonin Cpn10  42.05 
 
 		 98 aa  70.5  0.000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000000466109  normal  0.037414 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7829  chaperonin Cpn10  41.3 
 
 		 95 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16550  Co-chaperonin GroES  38.3 
 
 		 98 aa  70.5  0.000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.639377  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0586  chaperonin Cpn10  40.22 
 
 		 95 aa  70.5  0.000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.515387  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01330  Co-chaperonin GroES  36.96 
 
 		 95 aa  70.5  0.000000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1207  chaperonin Cpn10  42.39 
 
 		 99 aa  70.1  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.867572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04660  Co-chaperonin GroES  43.33 
 
 		 97 aa  70.1  0.000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00798314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0225  chaperonin Cpn10  40 
 
 		 88 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3627  co-chaperonin GroES  40.91 
 
 		 103 aa  69.7  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.711938  normal  0.0667876 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2474  co-chaperonin GroES  40 
 
 		 95 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0230053  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0034  chaperonin Cpn10  40.43 
 
 		 95 aa  70.1  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0295415  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1153  chaperonin Cpn10  40.66 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5254  chaperonin Cpn10  38.95 
 
 		 105 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.321205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1180  chaperonin Cpn10  40.66 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0241756 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1170  chaperonin Cpn10  40.66 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.480442 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0934  co-chaperonin GroES  36.67 
 
 		 88 aa  68.9  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4151  co-chaperonin GroES  38.95 
 
 		 96 aa  68.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0190602  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3359  co-chaperonin GroES  38.3 
 
 		 95 aa  68.9  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.755845  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2138  co-chaperonin GroES  45.74 
 
 		 95 aa  68.9  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.580367  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3714  co-chaperonin GroES  39.78 
 
 		 97 aa  68.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.31168 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0248  chaperonin Cpn10  35.79 
 
 		 96 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000171869  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>