More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0443 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0443  chaperonin Cpn10  100 
 
 		 97 aa  191  3e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0735  co-chaperonin GroES  65.98 
 
 		 98 aa  131  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.224017  normal  0.240552 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04660  Co-chaperonin GroES  68.42 
 
 		 97 aa  131  3.9999999999999996e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00798314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13452  co-chaperonin GroES  65.98 
 
 		 100 aa  130  6.999999999999999e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000956292  hitchhiker  0.00171205 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16550  Co-chaperonin GroES  65.98 
 
 		 98 aa  129  1.0000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.639377  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1180  chaperonin Cpn10  63.92 
 
 		 127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0241756 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1170  chaperonin Cpn10  63.92 
 
 		 127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.480442 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1153  chaperonin Cpn10  63.92 
 
 		 127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6544  chaperonin Cpn10  67.74 
 
 		 97 aa  128  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.303398  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1207  chaperonin Cpn10  64.95 
 
 		 99 aa  128  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.867572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3647  co-chaperonin GroES  65.26 
 
 		 97 aa  128  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4258  chaperonin Cpn10  67.37 
 
 		 102 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4026  Chaperonin Cpn10  65.26 
 
 		 103 aa  127  5.0000000000000004e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1494  co-chaperonin GroES  63.92 
 
 		 100 aa  127  6e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4925  co-chaperonin GroES  63.92 
 
 		 100 aa  127  6e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2599  10 kD chaperone  64.21 
 
 		 103 aa  127  7.000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4453  chaperonin Cpn10  62.89 
 
 		 102 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0234  chaperonin GroS  65.59 
 
 		 97 aa  126  1.0000000000000001e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5811  chaperonin Cpn10  66.32 
 
 		 97 aa  126  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.907137  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3058  co-chaperonin GroES  62.89 
 
 		 98 aa  125  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.495905 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2887  co-chaperonin GroES  61.86 
 
 		 97 aa  124  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0300428  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3842  chaperonin Cpn10  64.21 
 
 		 102 aa  124  5e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2589  Chaperonin Cpn10  64.21 
 
 		 97 aa  124  5e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.565547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1086  chaperonin Cpn10  63.16 
 
 		 98 aa  123  7e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.692359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6002  co-chaperonin GroES  61.86 
 
 		 101 aa  123  7e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0711534 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28700  Co-chaperonin GroES  66.67 
 
 		 97 aa  123  8.000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.235736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4232  chaperonin Cpn10  63.16 
 
 		 104 aa  123  9e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0774007 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1677  co-chaperonin GroES  62.37 
 
 		 97 aa  122  1e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2595  co-chaperonin GroES  60.82 
 
 		 97 aa  123  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000536943 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0632  co-chaperonin GroES  62.11 
 
 		 101 aa  123  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1719  chaperonin Cpn10  62.89 
 
 		 99 aa  122  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07560  Co-chaperonin GroES  61.96 
 
 		 98 aa  121  3e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.371401  normal  0.691399 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0619  chaperonin Cpn10  64.21 
 
 		 104 aa  121  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143984  normal  0.40407 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1856  groes  59.38 
 
 		 96 aa  120  5e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.70749  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1154  co-chaperonin GroES  63.16 
 
 		 103 aa  120  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0362  chaperonin Cpn10  63.74 
 
 		 102 aa  119  9e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.686615  normal  0.421985 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0684  chaperonin Cpn10  62.77 
 
 		 98 aa  118  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448895  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08630  Co-chaperonin GroES  59.14 
 
 		 98 aa  117  3.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0635  chaperonin Cpn10  64.21 
 
 		 97 aa  117  3.9999999999999996e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0358  chaperonin Cpn10  55.43 
 
 		 98 aa  117  6e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0898  chaperonin Cpn10  58.76 
 
 		 99 aa  116  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.520012  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1007  chaperonin Cpn10  58.95 
 
 		 98 aa  115  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.103756 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5464  co-chaperonin GroES  53.12 
 
 		 104 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.835161  normal  0.183317 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2114  co-chaperonin GroES  51.55 
 
 		 104 aa  115  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1768  chaperonin Cpn10  53.76 
 
 		 95 aa  115  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.939398  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0674  chaperonin Cpn10  53.76 
 
 		 95 aa  114  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248436  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1737  co-chaperonin GroES  52.63 
 
 		 95 aa  114  3.9999999999999997e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.168742  hitchhiker  0.00175489 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0379  chaperonin Cpn10  56.84 
 
 		 95 aa  114  6e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000945621  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3096  chaperonin Cpn10  58.06 
 
 		 104 aa  114  6e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2927  chaperonin Cpn10  57.89 
 
 		 96 aa  113  6.9999999999999995e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2458  co-chaperonin GroES  51.61 
 
 		 104 aa  113  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1282  chaperonin Cpn10  55.91 
 
 		 104 aa  113  6.9999999999999995e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.509292 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1165  chaperonin Cpn10  50.52 
 
 		 96 aa  113  7.999999999999999e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.731664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7829  chaperonin Cpn10  51.61 
 
 		 95 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6083  co-chaperonin GroES  52.17 
 
 		 98 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4265  chaperonin Cpn10  52.69 
 
 		 104 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228969  normal  0.0528982 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0409  co-chaperonin GroES  52.17 
 
 		 98 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5284  co-chaperonin GroES  51.61 
 
 		 104 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.262452 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0794  co-chaperonin GroES  52.63 
 
 		 95 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0142401 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3233  co-chaperonin GroES  50.54 
 
 		 105 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.211647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2928  chaperonin Cpn10  53.61 
 
 		 96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000296393  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1770  chaperonin Cpn10  52.69 
 
 		 95 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0933044  normal  0.173989 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2228  co-chaperonin GroES  50.54 
 
 		 105 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.145562  normal  0.505926 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2733  chaperonin Cpn10  55.79 
 
 		 98 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.958869 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5250  co-chaperonin GroES  53.68 
 
 		 96 aa  111  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.584342  normal  0.464773 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5581  chaperonin Cpn10  52.69 
 
 		 95 aa  111  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2191  co-chaperonin GroES  51.61 
 
 		 105 aa  111  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5326  co-chaperonin GroES  53.68 
 
 		 96 aa  111  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.769005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4783  co-chaperonin GroES  53.68 
 
 		 96 aa  111  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0265575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3033  co-chaperonin GroES  51.61 
 
 		 104 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.960902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0782  co-chaperonin GroES  55.91 
 
 		 95 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000134232  normal  0.229637 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0497  co-chaperonin GroES  54.84 
 
 		 95 aa  110  5e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000741059  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3171  co-chaperonin GroES  50.54 
 
 		 105 aa  110  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.50399  normal  0.859314 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0535  co-chaperonin GroES  53.68 
 
 		 96 aa  110  6e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.235794  normal  0.722093 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1177  co-chaperonin GroES  50.54 
 
 		 105 aa  110  6e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.510717  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1937  co-chaperonin GroES  55.91 
 
 		 95 aa  110  6e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000542677  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6246  chaperonin Cpn10  53.68 
 
 		 93 aa  110  7.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2593  co-chaperonin GroES  49.46 
 
 		 105 aa  110  8.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.458654  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1405  co-chaperonin GroES  55.91 
 
 		 94 aa  110  9e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000307277  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2803  co-chaperonin GroES  54.74 
 
 		 95 aa  110  9e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000132343  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0564  chaperonin Cpn10  58.7 
 
 		 102 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2078  chaperonin Cpn10  54.35 
 
 		 104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.354886  normal  0.301492 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4306  co-chaperonin GroES  53.61 
 
 		 96 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235031  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0196  co-chaperonin GroES  51.58 
 
 		 98 aa  108  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0309  hypothetical protein  54.74 
 
 		 92 aa  108  2.0000000000000002e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0958  co-chaperonin GroES  55.91 
 
 		 96 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3660  chaperonin Cpn10  54.84 
 
 		 96 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.39196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3375  chaperonin Cpn10  50.53 
 
 		 95 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0900877 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1305  co-chaperonin GroES  53.76 
 
 		 94 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000222526  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0833  co-chaperonin GroES  53.76 
 
 		 95 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000406281  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1806  co-chaperonin GroES  49.48 
 
 		 96 aa  108  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265316  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3063  co-chaperonin GroES  56.99 
 
 		 95 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428511 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1043  chaperonin Cpn10  50.52 
 
 		 105 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3335  chaperonin Cpn10  54.84 
 
 		 96 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0679  co-chaperonin GroES  52.69 
 
 		 95 aa  108  3e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.221594 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1672  co-chaperonin GroES  51.06 
 
 		 98 aa  108  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.723246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0034  chaperonin Cpn10  52.69 
 
 		 95 aa  108  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0295415  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4725  co-chaperonin GroES  51.09 
 
 		 98 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0471  co-chaperonin GroES  50 
 
 		 98 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0183  chaperonin Cpn10  56.99 
 
 		 96 aa  108  3e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>