More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4026 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4026  Chaperonin Cpn10  100 
 
 
103 aa  201  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2599  10 kD chaperone  92.23 
 
 
103 aa  186  7e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4258  chaperonin Cpn10  85.44 
 
 
102 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1154  co-chaperonin GroES  80.58 
 
 
103 aa  169  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0619  chaperonin Cpn10  79.41 
 
 
104 aa  166  8e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143984  normal  0.40407 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3842  chaperonin Cpn10  80.58 
 
 
102 aa  166  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4453  chaperonin Cpn10  83.5 
 
 
102 aa  166  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4232  chaperonin Cpn10  78.64 
 
 
104 aa  162  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0774007 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3058  co-chaperonin GroES  83.16 
 
 
98 aa  162  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.495905 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0632  co-chaperonin GroES  78.64 
 
 
101 aa  161  3e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04660  Co-chaperonin GroES  85.11 
 
 
97 aa  160  7e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00798314  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6002  co-chaperonin GroES  77.67 
 
 
101 aa  159  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0711534 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1180  chaperonin Cpn10  78.95 
 
 
127 aa  158  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0241756 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1153  chaperonin Cpn10  78.95 
 
 
127 aa  158  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1170  chaperonin Cpn10  78.95 
 
 
127 aa  158  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.480442 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1086  chaperonin Cpn10  82.11 
 
 
98 aa  157  7e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.692359  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4925  co-chaperonin GroES  77.89 
 
 
100 aa  155  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1494  co-chaperonin GroES  77.89 
 
 
100 aa  155  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13452  co-chaperonin GroES  75.51 
 
 
100 aa  154  3e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000956292  hitchhiker  0.00171205 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3647  co-chaperonin GroES  82.8 
 
 
97 aa  154  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28700  Co-chaperonin GroES  82.8 
 
 
97 aa  154  6e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.235736  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0684  chaperonin Cpn10  82.8 
 
 
98 aa  153  7e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448895  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6544  chaperonin Cpn10  79.79 
 
 
97 aa  152  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.303398  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2589  Chaperonin Cpn10  78.49 
 
 
97 aa  150  5e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.565547  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1007  chaperonin Cpn10  81.05 
 
 
98 aa  150  8e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.103756 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16550  Co-chaperonin GroES  81.05 
 
 
98 aa  149  1e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.639377  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0635  chaperonin Cpn10  79.57 
 
 
97 aa  149  2e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07560  Co-chaperonin GroES  69.47 
 
 
98 aa  148  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.371401  normal  0.691399 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0362  chaperonin Cpn10  74.26 
 
 
102 aa  148  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.686615  normal  0.421985 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2887  co-chaperonin GroES  77.89 
 
 
97 aa  147  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0300428  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2595  co-chaperonin GroES  76.84 
 
 
97 aa  146  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000536943 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0735  co-chaperonin GroES  77.89 
 
 
98 aa  146  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.224017  normal  0.240552 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08630  Co-chaperonin GroES  75.27 
 
 
98 aa  143  7.0000000000000006e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1207  chaperonin Cpn10  73.68 
 
 
99 aa  141  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.867572  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1719  chaperonin Cpn10  71.58 
 
 
99 aa  140  8e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0234  chaperonin GroS  70.97 
 
 
97 aa  138  3e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1677  co-chaperonin GroES  70.97 
 
 
97 aa  137  4.999999999999999e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5811  chaperonin Cpn10  69.89 
 
 
97 aa  132  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.907137  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0898  chaperonin Cpn10  65.26 
 
 
99 aa  127  4.0000000000000003e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.520012  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0443  chaperonin Cpn10  65.26 
 
 
97 aa  127  5.0000000000000004e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0379  chaperonin Cpn10  64.58 
 
 
95 aa  126  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000945621  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1856  groes  64.89 
 
 
96 aa  124  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.70749  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0611  Chaperonin Cpn10  62.24 
 
 
98 aa  123  8.000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.740191  normal  0.337946 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2928  chaperonin Cpn10  62.11 
 
 
96 aa  122  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000296393  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1405  co-chaperonin GroES  66.67 
 
 
94 aa  122  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000307277  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1231  chaperonin Cpn10  63.16 
 
 
96 aa  122  2e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0160  chaperonin Cpn10  64.21 
 
 
94 aa  121  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1088  chaperonin Cpn10  61.22 
 
 
98 aa  121  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000000466109  normal  0.037414 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2130  chaperonin Cpn10  62.77 
 
 
95 aa  118  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000318883  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0365  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 
96 aa  118  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000241312  hitchhiker  0.00832872 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0958  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 
96 aa  117  3.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2114  co-chaperonin GroES  58.95 
 
 
104 aa  117  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2657  co-chaperonin GroES  61.05 
 
 
96 aa  117  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0615  co-chaperonin GroES  61.05 
 
 
96 aa  117  6e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0242301 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0230  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 
94 aa  117  7e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000701184  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1109  co-chaperonin GroES  61.7 
 
 
94 aa  117  7e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0534  co-chaperonin GroES  62.11 
 
 
96 aa  116  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1098  chaperonin Cpn10/GroES  53.92 
 
 
101 aa  116  7.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000000000347589  hitchhiker  0.000183313 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0292  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 
94 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0288  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 
94 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000514345  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0252  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 
94 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000529101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0238  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 
94 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.27511e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0239  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 
94 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000442423  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0700  co-chaperonin GroES  62.11 
 
 
96 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.210155  normal  0.0126966 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0266  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 
94 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164514  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0678  co-chaperonin GroES  62.11 
 
 
96 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.651132  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0316  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 
94 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000403137  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0641  co-chaperonin GroES  61.05 
 
 
96 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0545  chaperonin Cpn10  58.95 
 
 
94 aa  115  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000554341  normal  0.812353 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0297  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 
94 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000149482  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0578  co-chaperonin GroES  62.11 
 
 
96 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.196352  normal  0.456012 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5027  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 
94 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000449913  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2008  chaperonin Cpn10  60 
 
 
94 aa  114  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.377969  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0425  co-chaperonin GroES  60.22 
 
 
96 aa  114  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.1607099999999999e-20  hitchhiker  0.002869 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1165  chaperonin Cpn10  58.95 
 
 
96 aa  115  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.731664  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2874  chaperonin Cpn10  61.05 
 
 
94 aa  115  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000282007  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0251  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 
94 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000150313  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0245  co-chaperonin GroES  57.45 
 
 
94 aa  114  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000139504  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4265  chaperonin Cpn10  56.38 
 
 
104 aa  114  6e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228969  normal  0.0528982 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0358  chaperonin Cpn10  55.79 
 
 
98 aa  114  6e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0427  co-chaperonin GroES  61.05 
 
 
96 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0874691  normal  0.929555 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2474  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 
95 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0230053  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0863  co-chaperonin GroES  58.95 
 
 
96 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000337259  normal  0.081408 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1909  co-chaperonin GroES  58.95 
 
 
96 aa  112  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.815751  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0286  co-chaperonin GroES  58.95 
 
 
127 aa  112  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000313463  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3816  co-chaperonin GroES  58.95 
 
 
96 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125602  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2334  co-chaperonin GroES  61.05 
 
 
96 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0638712  normal  0.0156201 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0794  co-chaperonin GroES  59.14 
 
 
95 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0142401 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2566  co-chaperonin GroES  61.05 
 
 
96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000246528  normal  0.0576287 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1789  co-chaperonin GroES  57.89 
 
 
103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1737  co-chaperonin GroES  56.99 
 
 
95 aa  112  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.168742  hitchhiker  0.00175489 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2504  co-chaperonin GroES  56.38 
 
 
104 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2574  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 
94 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2276  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 
94 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1672  co-chaperonin GroES  55.67 
 
 
98 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.723246  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3176  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 
97 aa  111  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.521457  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3154  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 
97 aa  111  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0911  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 
97 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.740154  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0760  co-chaperonin GroES  58.95 
 
 
96 aa  111  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000383794  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0749  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 
97 aa  111  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0685029 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>