More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0521 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0521  co-chaperonin GroES  100 
 
 
89 aa  173  5e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.125145 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1844  co-chaperonin GroES  70.79 
 
 
91 aa  136  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.986067  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0316  chaperonin Cpn10  71.91 
 
 
92 aa  134  5e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0011552  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6246  chaperonin Cpn10  68.54 
 
 
93 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00675  co-chaperonin GroES  64.04 
 
 
91 aa  125  3e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1827  co-chaperonin GroES  65.17 
 
 
92 aa  124  3e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0862396 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0985  chaperonin Cpn10  65.17 
 
 
98 aa  124  6e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.844996  normal  0.719219 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0309  hypothetical protein  62.92 
 
 
92 aa  120  4e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2733  chaperonin Cpn10  62.92 
 
 
98 aa  120  6e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.958869 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0541  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 
95 aa  117  7e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000000160733  normal  0.58747 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1305  co-chaperonin GroES  61.7 
 
 
94 aa  116  9.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000222526  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1937  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 
95 aa  114  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000542677  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0833  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 
95 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000406281  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2928  chaperonin Cpn10  54.26 
 
 
96 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000296393  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1919  chaperonin Cpn10  62.77 
 
 
100 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0679  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 
95 aa  110  6e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.221594 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3339  co-chaperonin GroES  55.32 
 
 
95 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.148697  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0782  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 
95 aa  110  9e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000134232  normal  0.229637 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0120  chaperonin Cpn10  59.57 
 
 
96 aa  109  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427234  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0497  co-chaperonin GroES  57.45 
 
 
95 aa  108  3e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000741059  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3063  co-chaperonin GroES  57.45 
 
 
95 aa  108  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428511 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0449  chaperonin Cpn10  57.45 
 
 
95 aa  107  7.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00196884  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2175  chaperonin Cpn10  55.32 
 
 
96 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.95289 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3375  chaperonin Cpn10  54.26 
 
 
95 aa  107  8.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0900877 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0028  co-chaperonin GroES  54.26 
 
 
95 aa  106  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.32588e-17  normal  0.625386 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2474  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 
95 aa  106  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0230053  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3714  co-chaperonin GroES  55.91 
 
 
97 aa  105  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.31168 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1195  co-chaperonin GroES  57.45 
 
 
95 aa  105  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0507909  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2228  co-chaperonin GroES  53.19 
 
 
105 aa  104  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.145562  normal  0.505926 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3233  co-chaperonin GroES  53.19 
 
 
105 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.211647  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1165  chaperonin Cpn10  53.19 
 
 
96 aa  104  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.731664  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0358  chaperonin Cpn10  53.76 
 
 
98 aa  104  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3096  chaperonin Cpn10  53.19 
 
 
104 aa  104  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2504  co-chaperonin GroES  52.13 
 
 
104 aa  104  4e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0379  chaperonin Cpn10  56.52 
 
 
95 aa  104  5e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000945621  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1405  co-chaperonin GroES  58.06 
 
 
94 aa  104  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000307277  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4306  co-chaperonin GroES  50 
 
 
96 aa  103  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235031  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2458  co-chaperonin GroES  52.13 
 
 
104 aa  103  7e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0586  chaperonin Cpn10  48.94 
 
 
95 aa  103  7e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.515387  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3359  co-chaperonin GroES  50 
 
 
95 aa  103  7e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.755845  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1282  chaperonin Cpn10  53.19 
 
 
104 aa  103  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.509292 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5366  chaperonin Cpn10  52.13 
 
 
95 aa  103  8e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.583884  normal  0.676466 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5581  chaperonin Cpn10  52.13 
 
 
95 aa  102  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1837  co-chaperonin GroES  54.26 
 
 
98 aa  102  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.747297  normal  0.0192495 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2574  co-chaperonin GroES  56.99 
 
 
94 aa  102  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2276  co-chaperonin GroES  56.99 
 
 
94 aa  102  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2803  co-chaperonin GroES  48.94 
 
 
95 aa  102  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000132343  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5284  co-chaperonin GroES  51.06 
 
 
104 aa  102  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.262452 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2191  co-chaperonin GroES  52.13 
 
 
105 aa  102  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6083  co-chaperonin GroES  49.46 
 
 
98 aa  102  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0272  co-chaperonin GroES  49.46 
 
 
96 aa  102  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0549  co-chaperonin GroES  52.13 
 
 
95 aa  102  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000019989  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0409  co-chaperonin GroES  49.46 
 
 
98 aa  102  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0453  chaperonin Cpn10  50 
 
 
95 aa  102  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0291  Chaperonin Cpn10  53.19 
 
 
96 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0587447  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1737  co-chaperonin GroES  51.06 
 
 
95 aa  102  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.168742  hitchhiker  0.00175489 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1407  chaperonin Cpn10  56.99 
 
 
96 aa  102  2e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.780371 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0020  co-chaperonin GroES  52.13 
 
 
95 aa  102  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.436916  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4265  chaperonin Cpn10  52.13 
 
 
104 aa  102  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228969  normal  0.0528982 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3660  co-chaperonin GroES  54.84 
 
 
97 aa  101  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0336408  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3734  co-chaperonin GroES  54.84 
 
 
97 aa  101  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.619596  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5464  co-chaperonin GroES  52.13 
 
 
104 aa  101  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.835161  normal  0.183317 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3593  co-chaperonin GroES  54.84 
 
 
97 aa  101  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2891  co-chaperonin GroES  54.84 
 
 
94 aa  101  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5848  chaperonin Cpn10  50 
 
 
104 aa  101  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134005  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4126  co-chaperonin GroES  53.19 
 
 
98 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.505672  normal  0.752904 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1672  co-chaperonin GroES  53.76 
 
 
98 aa  101  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.723246  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0535  co-chaperonin GroES  48.94 
 
 
96 aa  101  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.235794  normal  0.722093 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2920  chaperonin 10 Kd subunit  53.19 
 
 
103 aa  101  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.907264  normal  0.269903 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4586  co-chaperonin GroES  52.13 
 
 
95 aa  101  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.480478 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1332  co-chaperonin GroES  54.26 
 
 
98 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2114  co-chaperonin GroES  50 
 
 
104 aa  101  4e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0512  co-chaperonin GroES  53.76 
 
 
94 aa  100  5e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0471  co-chaperonin GroES  49.46 
 
 
98 aa  100  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0516  co-chaperonin GroES  49.46 
 
 
98 aa  100  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.218545 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0248  chaperonin Cpn10  50 
 
 
96 aa  100  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000171869  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5829  10 KD chaperonin (protein CPN10)  52.69 
 
 
98 aa  100  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0158717  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2573  co-chaperonin GroES  53.76 
 
 
98 aa  100  6e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.320362  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4725  co-chaperonin GroES  52.69 
 
 
98 aa  100  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2130  chaperonin Cpn10  52.13 
 
 
95 aa  100  7e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000318883  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0794  co-chaperonin GroES  50 
 
 
95 aa  100  7e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0142401 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0034  chaperonin Cpn10  52.13 
 
 
95 aa  100  8e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0295415  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0699  co-chaperonin GroES  48.94 
 
 
96 aa  100  9e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000000127096  unclonable  0.0000000000292135 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3171  co-chaperonin GroES  50 
 
 
105 aa  100  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.50399  normal  0.859314 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1177  co-chaperonin GroES  50 
 
 
105 aa  100  9e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.510717  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0543  co-chaperonin GroES  48.94 
 
 
96 aa  100  9e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00172283  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0674  chaperonin Cpn10  47.87 
 
 
95 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248436  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1770  chaperonin Cpn10  47.87 
 
 
95 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0933044  normal  0.173989 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0244  chaperonin Cpn10  53.76 
 
 
96 aa  99.8  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.329801  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0619  chaperonin Cpn10  52.69 
 
 
104 aa  99.8  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143984  normal  0.40407 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0161  chaperonin Cpn10  50 
 
 
104 aa  99.4  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327073  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1547  co-chaperonin GroES  54.26 
 
 
95 aa  99.4  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.807216  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1806  co-chaperonin GroES  48.94 
 
 
96 aa  99.8  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265316  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0183  chaperonin Cpn10  51.06 
 
 
96 aa  99.8  1e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0232  chaperonin Cpn10  48.94 
 
 
96 aa  99.8  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1419  chaperonin Cpn10  52.13 
 
 
96 aa  99.8  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0269029  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3373  chaperonin Cpn10  55.43 
 
 
94 aa  99  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7829  chaperonin Cpn10  47.87 
 
 
95 aa  99  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2885  chaperonin cpn10  50.54 
 
 
103 aa  99  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.478438  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4783  co-chaperonin GroES  46.81 
 
 
96 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0265575  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>