More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0883 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0883  Bvg accessory factor  100 
 
 		 96 aa  185  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000200777  hitchhiker  0.000120487 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13470  co-chaperonin GroES  70.83 
 
 		 97 aa  144  5e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2031  co-chaperonin GroES  72.92 
 
 		 95 aa  143  9e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.133549  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0967  co-chaperonin GroES  68.75 
 
 		 97 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387654  normal  0.774499 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3687  co-chaperonin GroES  67.71 
 
 		 97 aa  142  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.803225  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1360  co-chaperonin GroES  68.75 
 
 		 97 aa  141  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0209303  normal  0.159546 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4377  chaperonin, 10 kDa  68.75 
 
 		 97 aa  141  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4073  co-chaperonin GroES  68.75 
 
 		 97 aa  141  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.105969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4364  co-chaperonin GroES  68.75 
 
 		 97 aa  141  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.760414  normal  0.0428794 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4957  co-chaperonin GroES  69.79 
 
 		 97 aa  140  6e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.433731  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57020  co-chaperonin GroES  69.79 
 
 		 97 aa  140  6e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4489  co-chaperonin GroES  65.62 
 
 		 97 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0381842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2036  chaperonin Cpn10  67.71 
 
 		 96 aa  134  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.283417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4502  co-chaperonin GroES  64.58 
 
 		 97 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125331  hitchhiker  0.00150559 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0742  co-chaperonin GroES  66.67 
 
 		 96 aa  129  9e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0723  co-chaperonin GroES  66.67 
 
 		 96 aa  129  9e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0552  co-chaperonin GroES  63.54 
 
 		 96 aa  129  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0639  co-chaperonin GroES  62.5 
 
 		 96 aa  129  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00560672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0540  co-chaperonin GroES  63.54 
 
 		 96 aa  129  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0263712 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5254  chaperonin Cpn10  62.5 
 
 		 105 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.321205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1419  chaperonin Cpn10  63.54 
 
 		 96 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0269029  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2345  co-chaperonin GroES  63.54 
 
 		 96 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000000286758  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0020  co-chaperonin GroES  61.46 
 
 		 95 aa  124  4.0000000000000003e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.436916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2922  co-chaperonin GroES  61.46 
 
 		 96 aa  124  6e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000127335  n/a   
 
 
 
NC_002977  MCA0706  co-chaperonin GroES  61.46 
 
 		 96 aa  123  9e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0956  co-chaperonin GroES  64.58 
 
 		 96 aa  122  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.377346  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3428  chaperonin Cpn10  61.46 
 
 		 105 aa  123  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3082  chaperonin Cpn10  61.46 
 
 		 105 aa  123  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0120  chaperonin Cpn10  63.54 
 
 		 96 aa  122  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6726  chaperonin Cpn10  59.38 
 
 		 105 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2610  10 kDa chaperonin (Cpn10), groES  61.46 
 
 		 105 aa  122  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000523216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4543  10 kDa chaperonin (Cpn10), groES  61.46 
 
 		 105 aa  122  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000123576  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1705  chaperonin, 10 kDa subunit  60.42 
 
 		 96 aa  121  3e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0438  co-chaperonin GroES  60.42 
 
 		 96 aa  121  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000705596  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1581  chaperonin Cpn10  58.33 
 
 		 105 aa  120  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6393  chaperonin Cpn10  60.42 
 
 		 105 aa  121  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.673453  normal  0.108093 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6250  chaperonin Cpn10  58.33 
 
 		 105 aa  120  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.646299 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0760  co-chaperonin GroES  59.38 
 
 		 96 aa  120  6e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000383794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0699  co-chaperonin GroES  59.38 
 
 		 96 aa  120  8e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000000127096  unclonable  0.0000000000292135 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0543  co-chaperonin GroES  59.38 
 
 		 96 aa  120  8e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00172283  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0092  co-chaperonin GroES  61.46 
 
 		 96 aa  120  9e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000241636  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0286  co-chaperonin GroES  60.42 
 
 		 127 aa  120  9e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000313463  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03919  co-chaperonin GroES  61.46 
 
 		 96 aa  119  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0703  co-chaperonin GroES  61.05 
 
 		 96 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1909  co-chaperonin GroES  60.42 
 
 		 96 aa  119  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.815751  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3530  co-chaperonin GroES  61.46 
 
 		 97 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.437614  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6097  chaperonin Cpn10  59.38 
 
 		 105 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3398  co-chaperonin GroES  61.05 
 
 		 96 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.249246  decreased coverage  0.000697268 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0554  co-chaperonin GroES  61.05 
 
 		 96 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.136375  normal  0.109062 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3568  co-chaperonin GroES  61.05 
 
 		 96 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00627875  decreased coverage  0.00976024 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2494  chaperonin Cpn10, GroES, small subunit of GroESL  59.38 
 
 		 96 aa  118  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0174114 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3823  co-chaperonin GroES  60.42 
 
 		 97 aa  118  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0723  co-chaperonin GroES  60.42 
 
 		 97 aa  118  3e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1806  co-chaperonin GroES  55.21 
 
 		 96 aa  118  3e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265316  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3676  co-chaperonin GroES  60.42 
 
 		 97 aa  118  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3404  co-chaperonin GroES  60.42 
 
 		 97 aa  117  3.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0843  chaperonin Cpn10, GroES, small subunit of GroESL  59.38 
 
 		 96 aa  117  4.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.200224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3125  co-chaperonin GroES  59.38 
 
 		 96 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0218784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0296  chaperonin Cpn10  61.05 
 
 		 97 aa  117  4.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.018883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0619  chaperonin Cpn10  59.38 
 
 		 96 aa  117  6e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04012  co-chaperonin GroES  59.38 
 
 		 97 aa  117  7e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3850  chaperonin Cpn10  59.38 
 
 		 97 aa  117  7e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4690  co-chaperonin GroES  60.42 
 
 		 97 aa  117  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4726  co-chaperonin GroES  60.42 
 
 		 97 aa  117  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.785107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4747  co-chaperonin GroES  60.42 
 
 		 97 aa  117  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.739069  normal  0.604032 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03974  hypothetical protein  59.38 
 
 		 97 aa  117  7e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3870  co-chaperonin GroES  59.38 
 
 		 97 aa  117  7e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.819569 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4599  co-chaperonin GroES  60.42 
 
 		 97 aa  117  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4611  co-chaperonin GroES  59.38 
 
 		 97 aa  117  7e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.325354 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5658  co-chaperonin GroES  59.38 
 
 		 97 aa  117  7e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.308245 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4607  co-chaperonin GroES  60.42 
 
 		 97 aa  117  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4383  co-chaperonin GroES  59.38 
 
 		 97 aa  117  7e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4671  co-chaperonin GroES  59.38 
 
 		 97 aa  117  7e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0427  co-chaperonin GroES  58.33 
 
 		 96 aa  117  7e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0874691  normal  0.929555 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4697  co-chaperonin GroES  59.38 
 
 		 97 aa  117  7e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1132  co-chaperonin GroES  58.33 
 
 		 96 aa  116  9e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000135765  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0641  co-chaperonin GroES  57.89 
 
 		 96 aa  115  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.409973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0644  co-chaperonin GroES  57.89 
 
 		 96 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3429  chaperonin, 10 kDa  55.21 
 
 		 105 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000999948  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0471  co-chaperonin GroES  57.29 
 
 		 96 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.695304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0667  co-chaperonin GroES  57.89 
 
 		 96 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0408  co-chaperonin GroES  60.42 
 
 		 97 aa  115  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000567342 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0671  co-chaperonin GroES  57.89 
 
 		 96 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.139868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3391  chaperonin, 10 kDa  55.21 
 
 		 105 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.974932  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0700  co-chaperonin GroES  57.89 
 
 		 96 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000383643  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3425  chaperonin, 10 kDa  55.21 
 
 		 105 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3709  co-chaperonin GroES  57.89 
 
 		 96 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.771155  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1088  chaperonin Cpn10  64.52 
 
 		 98 aa  116  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000000466109  normal  0.037414 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2238  co-chaperonin GroES  58.33 
 
 		 96 aa  116  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0291  Chaperonin Cpn10  57.29 
 
 		 96 aa  116  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0587447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0329  co-chaperonin GroES  59.38 
 
 		 97 aa  115  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000330664 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4309  co-chaperonin GroES  57.89 
 
 		 96 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0727  co-chaperonin GroES  59.38 
 
 		 97 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.816729  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0508  co-chaperonin GroES  59.38 
 
 		 97 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0981396  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3752  co-chaperonin GroES  58.33 
 
 		 96 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.872968  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2346  chaperonin Cpn10  54.17 
 
 		 95 aa  115  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00216658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00143  co-chaperonin GroES  58.33 
 
 		 96 aa  114  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3690  co-chaperonin GroES  56.84 
 
 		 96 aa  114  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002224  heat shock protein 60 family co-chaperone GroES  58.33 
 
 		 96 aa  114  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0678  co-chaperonin GroES  57.29 
 
 		 96 aa  114  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.651132  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>