More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1919 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1919  chaperonin Cpn10  100 
 
 		 100 aa  192  1e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1305  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 		 94 aa  128  3e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000222526  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0679  co-chaperonin GroES  63.16 
 
 		 95 aa  127  5.0000000000000004e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.221594 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0160  chaperonin Cpn10  66.67 
 
 		 94 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0833  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 		 95 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000406281  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0497  co-chaperonin GroES  61.05 
 
 		 95 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000741059  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0782  co-chaperonin GroES  61.05 
 
 		 95 aa  125  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000134232  normal  0.229637 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1405  co-chaperonin GroES  64.52 
 
 		 94 aa  123  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000307277  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0541  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 		 95 aa  122  1e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000000160733  normal  0.58747 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1007  chaperonin Cpn10  60.2 
 
 		 98 aa  122  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.103756 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2874  chaperonin Cpn10  63.44 
 
 		 94 aa  122  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000282007  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2008  chaperonin Cpn10  62.37 
 
 		 94 aa  122  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.377969  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1937  co-chaperonin GroES  60 
 
 		 95 aa  121  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000542677  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0985  chaperonin Cpn10  62.77 
 
 		 98 aa  120  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.844996  normal  0.719219 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3063  co-chaperonin GroES  63.16 
 
 		 95 aa  120  6e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428511 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0309  hypothetical protein  59.38 
 
 		 92 aa  119  9.999999999999999e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0379  chaperonin Cpn10  60.22 
 
 		 95 aa  119  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000945621  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1547  co-chaperonin GroES  60 
 
 		 95 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.807216  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1195  co-chaperonin GroES  62.11 
 
 		 95 aa  118  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0507909  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6002  co-chaperonin GroES  59.38 
 
 		 101 aa  118  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0711534 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3678  chaperonin Cpn10  56.57 
 
 		 100 aa  118  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00275768  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1844  co-chaperonin GroES  63.44 
 
 		 91 aa  117  4.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.986067  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0183  chaperonin Cpn10  56.25 
 
 		 96 aa  117  4.9999999999999996e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0632  co-chaperonin GroES  58.33 
 
 		 101 aa  117  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0362  chaperonin Cpn10  57.89 
 
 		 102 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.686615  normal  0.421985 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2474  co-chaperonin GroES  61.05 
 
 		 95 aa  117  6e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0230053  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0958  co-chaperonin GroES  59.38 
 
 		 96 aa  117  6e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6246  chaperonin Cpn10  62.37 
 
 		 93 aa  117  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0316  chaperonin Cpn10  60.42 
 
 		 92 aa  117  7.999999999999999e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0011552  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1173  co-chaperonin GroES  55.67 
 
 		 98 aa  116  9.999999999999999e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.749354  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2504  co-chaperonin GroES  60 
 
 		 104 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2175  chaperonin Cpn10  58.33 
 
 		 96 aa  115  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.95289 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1672  co-chaperonin GroES  58.76 
 
 		 98 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.723246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2920  chaperonin 10 Kd subunit  58.76 
 
 		 103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.907264  normal  0.269903 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16550  Co-chaperonin GroES  57.89 
 
 		 98 aa  115  3e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.639377  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3373  chaperonin Cpn10  61.29 
 
 		 94 aa  115  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1212  chaperonin Cpn10  59.79 
 
 		 101 aa  114  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.694559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3195  co-chaperonin GroES  57.14 
 
 		 98 aa  114  5e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4725  co-chaperonin GroES  57.73 
 
 		 98 aa  114  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4126  co-chaperonin GroES  57.73 
 
 		 98 aa  114  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.505672  normal  0.752904 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0449  chaperonin Cpn10  58.95 
 
 		 95 aa  113  7.999999999999999e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00196884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1332  co-chaperonin GroES  58.76 
 
 		 98 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1837  co-chaperonin GroES  57.73 
 
 		 98 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.747297  normal  0.0192495 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2078  chaperonin Cpn10  57.29 
 
 		 104 aa  113  8.999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.354886  normal  0.301492 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0358  chaperonin Cpn10  56.7 
 
 		 98 aa  113  8.999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2573  co-chaperonin GroES  57.73 
 
 		 98 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.320362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4453  chaperonin Cpn10  56.7 
 
 		 102 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0489  chaperonin Cpn10  58 
 
 		 100 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000458511  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0512  co-chaperonin GroES  57.45 
 
 		 94 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1088  chaperonin Cpn10  60.87 
 
 		 98 aa  112  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000000466109  normal  0.037414 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4130  chaperonin Cpn10  58.76 
 
 		 101 aa  113  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00154355  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3339  co-chaperonin GroES  57.89 
 
 		 95 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.148697  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3714  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 		 97 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.31168 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1076  chaperonin Cpn10  59.18 
 
 		 98 aa  112  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.12184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2190  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 		 95 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0596  co-chaperonin GroES  55.32 
 
 		 95 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.474477  normal  0.0912075 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2733  chaperonin Cpn10  58.51 
 
 		 98 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.958869 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0516  co-chaperonin GroES  54.64 
 
 		 98 aa  111  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218545 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00675  co-chaperonin GroES  56.99 
 
 		 91 aa  111  3e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0028  co-chaperonin GroES  56.84 
 
 		 95 aa  111  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.32588e-17  normal  0.625386 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0409  co-chaperonin GroES  54.64 
 
 		 98 aa  111  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6083  co-chaperonin GroES  54.64 
 
 		 98 aa  111  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0471  co-chaperonin GroES  54.64 
 
 		 98 aa  111  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4258  chaperonin Cpn10  56.7 
 
 		 102 aa  111  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3027  chaperonin Cpn10  57.73 
 
 		 121 aa  111  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2928  chaperonin Cpn10  55.21 
 
 		 96 aa  111  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000296393  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0521  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 		 89 aa  111  4.0000000000000004e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.125145 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0611  Chaperonin Cpn10  59.78 
 
 		 98 aa  111  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.740191  normal  0.337946 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0564  chaperonin Cpn10  57.45 
 
 		 102 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2599  10 kD chaperone  57.73 
 
 		 103 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2130  chaperonin Cpn10  55.79 
 
 		 95 aa  111  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000318883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0120  chaperonin Cpn10  61.05 
 
 		 96 aa  111  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3842  chaperonin Cpn10  55.67 
 
 		 102 aa  110  5e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0545  chaperonin Cpn10  59.14 
 
 		 94 aa  110  5e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000554341  normal  0.812353 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0251  co-chaperonin GroES  58.7 
 
 		 94 aa  110  5e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000150313  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5464  co-chaperonin GroES  58.7 
 
 		 104 aa  110  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.835161  normal  0.183317 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1737  co-chaperonin GroES  58.7 
 
 		 95 aa  110  5e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.168742  hitchhiker  0.00175489 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2803  co-chaperonin GroES  54.74 
 
 		 95 aa  110  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000132343  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3647  co-chaperonin GroES  55.21 
 
 		 97 aa  110  5e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2114  co-chaperonin GroES  55.79 
 
 		 104 aa  110  6e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0984  co-chaperonin GroES  57.45 
 
 		 95 aa  110  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2310  co-chaperonin GroES  57.45 
 
 		 95 aa  110  6e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1719  chaperonin Cpn10  58.76 
 
 		 99 aa  110  6e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0549  co-chaperonin GroES  58.95 
 
 		 95 aa  110  6e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000019989  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0535  co-chaperonin GroES  56.38 
 
 		 96 aa  110  6e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.235794  normal  0.722093 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2138  co-chaperonin GroES  58.95 
 
 		 95 aa  110  6e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.580367  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0898  chaperonin Cpn10  54.64 
 
 		 99 aa  110  7.000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.520012  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4265  chaperonin Cpn10  55.91 
 
 		 104 aa  110  7.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228969  normal  0.0528982 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4232  chaperonin Cpn10  55.67 
 
 		 104 aa  110  8.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0774007 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5581  chaperonin Cpn10  56.38 
 
 		 95 aa  110  9e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0674  chaperonin Cpn10  54.26 
 
 		 95 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248436  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0288  co-chaperonin GroES  58.7 
 
 		 94 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000514345  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0239  co-chaperonin GroES  58.7 
 
 		 94 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000442423  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0316  co-chaperonin GroES  58.7 
 
 		 94 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000403137  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0266  co-chaperonin GroES  58.7 
 
 		 94 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164514  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3359  co-chaperonin GroES  55.32 
 
 		 95 aa  109  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.755845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0292  co-chaperonin GroES  58.7 
 
 		 94 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3096  chaperonin Cpn10  54.64 
 
 		 104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2574  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 		 94 aa  109  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0794  co-chaperonin GroES  57.45 
 
 		 95 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0142401 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>