More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1088 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1088  chaperonin Cpn10  100 
 
 
98 aa  189  8e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000000466109  normal  0.037414 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0611  Chaperonin Cpn10  94.9 
 
 
98 aa  184  3e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.740191  normal  0.337946 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0958  co-chaperonin GroES  79.35 
 
 
96 aa  152  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2230  co-chaperonin GroES  71.28 
 
 
95 aa  137  6e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1231  chaperonin Cpn10  66.3 
 
 
96 aa  131  3e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0160  chaperonin Cpn10  66.67 
 
 
94 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0545  chaperonin Cpn10  65.22 
 
 
94 aa  127  5.0000000000000004e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000554341  normal  0.812353 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0288  co-chaperonin GroES  63.44 
 
 
94 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000514345  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0252  co-chaperonin GroES  63.44 
 
 
94 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000529101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0238  co-chaperonin GroES  63.44 
 
 
94 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.27511e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0239  co-chaperonin GroES  63.44 
 
 
94 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000442423  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1109  co-chaperonin GroES  62.37 
 
 
94 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2599  10 kD chaperone  63.37 
 
 
103 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0292  co-chaperonin GroES  63.44 
 
 
94 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0266  co-chaperonin GroES  63.44 
 
 
94 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164514  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0549  co-chaperonin GroES  63.04 
 
 
95 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000019989  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0316  co-chaperonin GroES  63.44 
 
 
94 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000403137  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0251  co-chaperonin GroES  63.44 
 
 
94 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000150313  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5027  co-chaperonin GroES  62.37 
 
 
94 aa  124  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000449913  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0297  co-chaperonin GroES  62.37 
 
 
94 aa  124  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000149482  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2874  chaperonin Cpn10  62.37 
 
 
94 aa  124  5e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000282007  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2008  chaperonin Cpn10  63.44 
 
 
94 aa  123  9e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.377969  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0245  co-chaperonin GroES  61.29 
 
 
94 aa  123  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000139504  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1173  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 
98 aa  123  1e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.749354  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3660  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 
97 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0336408  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4453  chaperonin Cpn10  60.82 
 
 
102 aa  122  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0230  co-chaperonin GroES  64.52 
 
 
94 aa  122  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000701184  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0587  chaperonin Cpn10  65.59 
 
 
98 aa  122  2e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0674011  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3714  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 
97 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.31168 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3593  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 
97 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3734  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 
97 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.619596  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1719  chaperonin Cpn10  60.87 
 
 
99 aa  121  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28700  Co-chaperonin GroES  60 
 
 
97 aa  121  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.235736  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4026  Chaperonin Cpn10  61.22 
 
 
103 aa  121  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16550  Co-chaperonin GroES  56.84 
 
 
98 aa  120  5e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.639377  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1212  chaperonin Cpn10  60.61 
 
 
101 aa  120  5e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.694559  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0449  chaperonin Cpn10  60.87 
 
 
95 aa  120  7e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00196884  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0564  chaperonin Cpn10  61.86 
 
 
102 aa  120  7e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4258  chaperonin Cpn10  57.73 
 
 
102 aa  120  8e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2340  chaperonin Cpn10  58.7 
 
 
96 aa  120  8e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.4787  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4130  chaperonin Cpn10  59.6 
 
 
101 aa  120  8e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00154355  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2927  chaperonin Cpn10  66.67 
 
 
96 aa  120  9e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3842  chaperonin Cpn10  58.76 
 
 
102 aa  119  9e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3373  chaperonin Cpn10  62.37 
 
 
94 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0684  chaperonin Cpn10  60.87 
 
 
98 aa  119  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448895  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2130  chaperonin Cpn10  61.96 
 
 
95 aa  119  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000318883  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4232  chaperonin Cpn10  58.76 
 
 
104 aa  119  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0774007 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0120  chaperonin Cpn10  60.87 
 
 
96 aa  119  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427234  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2625  chaperonin Cpn10  59.78 
 
 
96 aa  118  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04660  Co-chaperonin GroES  59.78 
 
 
97 aa  119  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00798314  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0296  chaperonin Cpn10  64.13 
 
 
97 aa  119  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.018883  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1705  chaperonin, 10 kDa subunit  63.04 
 
 
96 aa  118  3e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3058  co-chaperonin GroES  56.84 
 
 
98 aa  118  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.495905 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3647  co-chaperonin GroES  58.7 
 
 
97 aa  117  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0512  co-chaperonin GroES  63.04 
 
 
94 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2928  chaperonin Cpn10  57.61 
 
 
96 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000296393  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6083  co-chaperonin GroES  56.25 
 
 
98 aa  117  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0898  chaperonin Cpn10  57.61 
 
 
99 aa  117  4.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.520012  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0409  co-chaperonin GroES  56.25 
 
 
98 aa  117  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2346  chaperonin Cpn10  55.43 
 
 
95 aa  117  6e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00216658  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2031  co-chaperonin GroES  63.04 
 
 
95 aa  117  7e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.133549  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3339  co-chaperonin GroES  57.61 
 
 
95 aa  116  7.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.148697  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0619  chaperonin Cpn10  57.14 
 
 
104 aa  116  7.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143984  normal  0.40407 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0699  co-chaperonin GroES  57.61 
 
 
96 aa  116  9e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000000127096  unclonable  0.0000000000292135 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0543  co-chaperonin GroES  57.61 
 
 
96 aa  116  9e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00172283  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2520  chaperone Hsp10, part of GroE chaperone system  61.96 
 
 
95 aa  116  9e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.691961  normal  0.971453 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0706  co-chaperonin GroES  57.61 
 
 
96 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0883  Bvg accessory factor  64.52 
 
 
96 aa  116  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000200777  hitchhiker  0.000120487 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0516  co-chaperonin GroES  55.21 
 
 
98 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.218545 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1086  chaperonin Cpn10  58.7 
 
 
98 aa  116  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.692359  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0471  co-chaperonin GroES  55.21 
 
 
98 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2803  co-chaperonin GroES  56.52 
 
 
95 aa  116  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000132343  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1098  chaperonin Cpn10/GroES  55.67 
 
 
101 aa  115  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000000000347589  hitchhiker  0.000183313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1154  co-chaperonin GroES  57.14 
 
 
103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2175  chaperonin Cpn10  55.43 
 
 
96 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.95289 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5811  chaperonin Cpn10  60.44 
 
 
97 aa  115  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.907137  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6544  chaperonin Cpn10  56.52 
 
 
97 aa  115  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.303398  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4725  co-chaperonin GroES  57.45 
 
 
98 aa  114  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0362  chaperonin Cpn10  55.88 
 
 
102 aa  114  3e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.686615  normal  0.421985 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1165  chaperonin Cpn10  60.87 
 
 
96 aa  114  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.731664  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0674  chaperonin Cpn10  58.7 
 
 
95 aa  114  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248436  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1170  chaperonin Cpn10  59.14 
 
 
127 aa  114  6e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.480442 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3063  co-chaperonin GroES  55.43 
 
 
95 aa  114  6e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428511 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1180  chaperonin Cpn10  59.14 
 
 
127 aa  114  6e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0241756 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1153  chaperonin Cpn10  59.14 
 
 
127 aa  114  6e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5366  chaperonin Cpn10  56.52 
 
 
95 aa  114  6e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.583884  normal  0.676466 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0794  co-chaperonin GroES  59.78 
 
 
95 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0142401 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2771  10 Kd chaperone GroES  58.7 
 
 
95 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  8.05146e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1305  co-chaperonin GroES  53.26 
 
 
94 aa  113  6.9999999999999995e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000222526  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0453  chaperonin Cpn10  56.52 
 
 
95 aa  113  6.9999999999999995e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2589  Chaperonin Cpn10  53.68 
 
 
97 aa  113  7.999999999999999e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.565547  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0605  chaperonin Cpn10  55.43 
 
 
95 aa  113  7.999999999999999e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.131818 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7829  chaperonin Cpn10  58.7 
 
 
95 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0859  chaperonin Cpn10  58.06 
 
 
96 aa  113  1.0000000000000001e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000206391  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0028  co-chaperonin GroES  55.43 
 
 
95 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.32588e-17  normal  0.625386 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1789  co-chaperonin GroES  57.61 
 
 
103 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1770  chaperonin Cpn10  57.61 
 
 
95 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0933044  normal  0.173989 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08630  Co-chaperonin GroES  55.79 
 
 
98 aa  112  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0635  chaperonin Cpn10  54.74 
 
 
97 aa  112  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3678  chaperonin Cpn10  60.22 
 
 
100 aa  112  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00275768  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>