More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1007 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1007  chaperonin Cpn10  100 
 
 		 98 aa  194  5.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.103756 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0632  co-chaperonin GroES  85.26 
 
 		 101 aa  166  9e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0362  chaperonin Cpn10  86.02 
 
 		 102 aa  166  1e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.686615  normal  0.421985 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6002  co-chaperonin GroES  84.21 
 
 		 101 aa  161  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0711534 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2599  10 kD chaperone  83.51 
 
 		 103 aa  160  5.0000000000000005e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4258  chaperonin Cpn10  83.33 
 
 		 102 aa  156  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1154  co-chaperonin GroES  82.47 
 
 		 103 aa  152  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0619  chaperonin Cpn10  81.44 
 
 		 104 aa  152  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143984  normal  0.40407 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4925  co-chaperonin GroES  75 
 
 		 100 aa  150  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1494  co-chaperonin GroES  75 
 
 		 100 aa  150  4e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16550  Co-chaperonin GroES  78.35 
 
 		 98 aa  150  5.9999999999999996e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.639377  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4026  Chaperonin Cpn10  81.05 
 
 		 103 aa  150  8e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1153  chaperonin Cpn10  73 
 
 		 127 aa  149  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1180  chaperonin Cpn10  73 
 
 		 127 aa  149  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0241756 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1170  chaperonin Cpn10  73 
 
 		 127 aa  149  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.480442 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2887  co-chaperonin GroES  76.04 
 
 		 97 aa  149  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0300428  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13452  co-chaperonin GroES  75 
 
 		 100 aa  148  3e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000956292  hitchhiker  0.00171205 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3647  co-chaperonin GroES  79.17 
 
 		 97 aa  148  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2595  co-chaperonin GroES  75 
 
 		 97 aa  147  4e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000536943 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04660  Co-chaperonin GroES  77.08 
 
 		 97 aa  147  5e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00798314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1086  chaperonin Cpn10  77.08 
 
 		 98 aa  146  9e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.692359  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3058  co-chaperonin GroES  75.26 
 
 		 98 aa  145  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.495905 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1207  chaperonin Cpn10  71.72 
 
 		 99 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.867572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08630  Co-chaperonin GroES  73.96 
 
 		 98 aa  144  4.0000000000000006e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3842  chaperonin Cpn10  77.08 
 
 		 102 aa  144  5e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4232  chaperonin Cpn10  77.08 
 
 		 104 aa  143  7.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0774007 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4453  chaperonin Cpn10  78.12 
 
 		 102 aa  142  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1719  chaperonin Cpn10  70.71 
 
 		 99 aa  142  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6544  chaperonin Cpn10  72.92 
 
 		 97 aa  141  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.303398  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0735  co-chaperonin GroES  76.29 
 
 		 98 aa  140  4e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.224017  normal  0.240552 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0684  chaperonin Cpn10  76.84 
 
 		 98 aa  139  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448895  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2589  Chaperonin Cpn10  73.96 
 
 		 97 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.565547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28700  Co-chaperonin GroES  73.96 
 
 		 97 aa  137  4.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.235736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0635  chaperonin Cpn10  72.92 
 
 		 97 aa  135  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0898  chaperonin Cpn10  66.67 
 
 		 99 aa  132  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.520012  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07560  Co-chaperonin GroES  67 
 
 		 98 aa  132  1.9999999999999998e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.371401  normal  0.691399 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1919  chaperonin Cpn10  60.2 
 
 		 100 aa  122  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0234  chaperonin GroS  62.5 
 
 		 97 aa  122  1e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1677  co-chaperonin GroES  61.46 
 
 		 97 aa  121  3e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1405  co-chaperonin GroES  63.04 
 
 		 94 aa  120  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000307277  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2130  chaperonin Cpn10  60.64 
 
 		 95 aa  118  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000318883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0379  chaperonin Cpn10  63.83 
 
 		 95 aa  118  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000945621  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2574  co-chaperonin GroES  61.7 
 
 		 94 aa  116  7.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0443  chaperonin Cpn10  58.95 
 
 		 97 aa  115  9.999999999999999e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2276  co-chaperonin GroES  61.7 
 
 		 94 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0160  chaperonin Cpn10  64.13 
 
 		 94 aa  114  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5811  chaperonin Cpn10  62.5 
 
 		 97 aa  114  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.907137  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2874  chaperonin Cpn10  61.96 
 
 		 94 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000282007  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0288  co-chaperonin GroES  58.06 
 
 		 94 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000514345  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0252  co-chaperonin GroES  58.06 
 
 		 94 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000529101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0238  co-chaperonin GroES  58.06 
 
 		 94 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.27511e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0239  co-chaperonin GroES  58.06 
 
 		 94 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000442423  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0316  co-chaperonin GroES  58.06 
 
 		 94 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000403137  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0297  co-chaperonin GroES  58.06 
 
 		 94 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000149482  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5027  co-chaperonin GroES  58.06 
 
 		 94 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000449913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0266  co-chaperonin GroES  58.06 
 
 		 94 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164514  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0611  Chaperonin Cpn10  58.16 
 
 		 98 aa  112  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.740191  normal  0.337946 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0292  co-chaperonin GroES  58.06 
 
 		 94 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0512  co-chaperonin GroES  59.78 
 
 		 94 aa  111  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0245  co-chaperonin GroES  58.06 
 
 		 94 aa  111  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000139504  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2885  chaperonin cpn10  58.16 
 
 		 103 aa  110  5e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.478438  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0358  chaperonin Cpn10  55.1 
 
 		 98 aa  110  6e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0251  co-chaperonin GroES  58.06 
 
 		 94 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000150313  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1088  chaperonin Cpn10  57.14 
 
 		 98 aa  110  7.000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000000466109  normal  0.037414 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1856  groes  60.64 
 
 		 96 aa  110  8.000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.70749  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0545  chaperonin Cpn10  58.24 
 
 		 94 aa  109  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000554341  normal  0.812353 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0958  co-chaperonin GroES  55.32 
 
 		 96 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1173  co-chaperonin GroES  53.61 
 
 		 98 aa  108  3e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.749354  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3678  chaperonin Cpn10  55.56 
 
 		 100 aa  108  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00275768  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2008  chaperonin Cpn10  59.78 
 
 		 94 aa  108  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.377969  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0391  co-chaperonin GroES  58.7 
 
 		 94 aa  107  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0365  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 		 96 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000241312  hitchhiker  0.00832872 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0564  chaperonin Cpn10  53.06 
 
 		 102 aa  107  6e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1165  chaperonin Cpn10  56.25 
 
 		 96 aa  107  7.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.731664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1332  co-chaperonin GroES  54.08 
 
 		 98 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1231  chaperonin Cpn10  55.21 
 
 		 96 aa  106  8.000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3063  co-chaperonin GroES  57.61 
 
 		 95 aa  106  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428511 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2114  co-chaperonin GroES  54.17 
 
 		 104 aa  106  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4725  co-chaperonin GroES  52.04 
 
 		 98 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4126  co-chaperonin GroES  53.06 
 
 		 98 aa  105  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.505672  normal  0.752904 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5138  co-chaperonin GroES  56.7 
 
 		 103 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3627  co-chaperonin GroES  57.14 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.711938  normal  0.0667876 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1837  co-chaperonin GroES  53.06 
 
 		 98 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.747297  normal  0.0192495 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1109  co-chaperonin GroES  53.76 
 
 		 94 aa  105  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2175  chaperonin Cpn10  54.35 
 
 		 96 aa  105  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.95289 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2504  co-chaperonin GroES  56.52 
 
 		 104 aa  105  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4265  chaperonin Cpn10  53.19 
 
 		 104 aa  105  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228969  normal  0.0528982 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4326  co-chaperonin GroES  52.04 
 
 		 103 aa  105  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.212063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2891  co-chaperonin GroES  57.14 
 
 		 94 aa  105  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0737  co-chaperonin GroES  55.79 
 
 		 96 aa  104  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.060744  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2029  co-chaperonin GroES  54.74 
 
 		 96 aa  104  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.218748  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2615  co-chaperonin GroES  53.12 
 
 		 96 aa  104  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.983112 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2474  co-chaperonin GroES  55.91 
 
 		 95 aa  104  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0230053  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0645  co-chaperonin GroES  55.79 
 
 		 96 aa  104  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0733336  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3996  co-chaperonin GroES  53.12 
 
 		 96 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0806135 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3523  co-chaperonin GroES  53.12 
 
 		 96 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.85375  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1672  co-chaperonin GroES  53.61 
 
 		 98 aa  104  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.723246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0925  chaperonin Cpn10  54.64 
 
 		 97 aa  104  5e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000344509  hitchhiker  7.97374e-18 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3373  chaperonin Cpn10  56.52 
 
 		 94 aa  104  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18371  co-chaperonin GroES  54.08 
 
 		 103 aa  103  5e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>