More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2574 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2574  co-chaperonin GroES  100 
 
 		 94 aa  182  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2276  co-chaperonin GroES  98.94 
 
 		 94 aa  181  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2891  co-chaperonin GroES  74.47 
 
 		 94 aa  147  6e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0391  co-chaperonin GroES  75.53 
 
 		 94 aa  146  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0512  co-chaperonin GroES  65.96 
 
 		 94 aa  132  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3290  chaperonin Cpn10  66.67 
 
 		 95 aa  131  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000053121  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1405  co-chaperonin GroES  66.67 
 
 		 94 aa  127  6e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000307277  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2138  co-chaperonin GroES  65.96 
 
 		 95 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.580367  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0449  chaperonin Cpn10  65.26 
 
 		 95 aa  122  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00196884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0160  chaperonin Cpn10  64.52 
 
 		 94 aa  122  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2175  chaperonin Cpn10  61.05 
 
 		 96 aa  122  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.95289 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2008  chaperonin Cpn10  61.29 
 
 		 94 aa  118  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.377969  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2874  chaperonin Cpn10  62.37 
 
 		 94 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000282007  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0632  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 		 101 aa  116  7.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1231  chaperonin Cpn10  60 
 
 		 96 aa  116  7.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1007  chaperonin Cpn10  61.7 
 
 		 98 aa  116  9e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.103756 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6002  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 		 101 aa  116  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0711534 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3647  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 		 97 aa  116  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0635  chaperonin Cpn10  61.7 
 
 		 97 aa  115  1.9999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28700  Co-chaperonin GroES  60.64 
 
 		 97 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.235736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2130  chaperonin Cpn10  60 
 
 		 95 aa  115  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000318883  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3058  co-chaperonin GroES  57.89 
 
 		 98 aa  114  3.9999999999999997e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.495905 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3063  co-chaperonin GroES  57.89 
 
 		 95 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428511 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0379  chaperonin Cpn10  62.37 
 
 		 95 aa  114  6e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000945621  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2589  Chaperonin Cpn10  59.57 
 
 		 97 aa  113  6.9999999999999995e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.565547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0794  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 		 95 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0142401 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04660  Co-chaperonin GroES  58.95 
 
 		 97 aa  113  8.999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00798314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2625  chaperonin Cpn10  55.79 
 
 		 96 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4232  chaperonin Cpn10  60 
 
 		 104 aa  112  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0774007 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0619  chaperonin Cpn10  61.46 
 
 		 104 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143984  normal  0.40407 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4258  chaperonin Cpn10  59.14 
 
 		 102 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4026  Chaperonin Cpn10  59.57 
 
 		 103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0545  chaperonin Cpn10  62.37 
 
 		 94 aa  112  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000554341  normal  0.812353 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3842  chaperonin Cpn10  58.95 
 
 		 102 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0362  chaperonin Cpn10  56.38 
 
 		 102 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.686615  normal  0.421985 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1109  co-chaperonin GroES  58.7 
 
 		 94 aa  111  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1195  co-chaperonin GroES  56.84 
 
 		 95 aa  112  3e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0507909  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2595  co-chaperonin GroES  58.06 
 
 		 97 aa  111  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000536943 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0958  co-chaperonin GroES  56.84 
 
 		 96 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0251  co-chaperonin GroES  57.61 
 
 		 94 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000150313  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2887  co-chaperonin GroES  58.06 
 
 		 97 aa  111  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0300428  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4453  chaperonin Cpn10  57.89 
 
 		 102 aa  110  5e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0120  chaperonin Cpn10  58.95 
 
 		 96 aa  110  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2474  co-chaperonin GroES  55.79 
 
 		 95 aa  110  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0230053  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0684  chaperonin Cpn10  59.57 
 
 		 98 aa  110  7.000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448895  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0297  co-chaperonin GroES  58.7 
 
 		 94 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000149482  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5027  co-chaperonin GroES  58.7 
 
 		 94 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000449913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08630  Co-chaperonin GroES  57.89 
 
 		 98 aa  110  9e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1547  co-chaperonin GroES  54.74 
 
 		 95 aa  110  9e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.807216  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1154  co-chaperonin GroES  59.38 
 
 		 103 aa  110  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1856  groes  60.22 
 
 		 96 aa  110  9e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.70749  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0288  co-chaperonin GroES  57.61 
 
 		 94 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000514345  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0252  co-chaperonin GroES  57.61 
 
 		 94 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000529101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0238  co-chaperonin GroES  57.61 
 
 		 94 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.27511e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0239  co-chaperonin GroES  57.61 
 
 		 94 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000442423  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2599  10 kD chaperone  59.57 
 
 		 103 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0292  co-chaperonin GroES  57.61 
 
 		 94 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0266  co-chaperonin GroES  57.61 
 
 		 94 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164514  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0316  co-chaperonin GroES  57.61 
 
 		 94 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000403137  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0245  co-chaperonin GroES  58.7 
 
 		 94 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000139504  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16550  Co-chaperonin GroES  58.51 
 
 		 98 aa  109  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.639377  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1086  chaperonin Cpn10  56.84 
 
 		 98 aa  108  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.692359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2928  chaperonin Cpn10  51.58 
 
 		 96 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000296393  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0365  co-chaperonin GroES  57.89 
 
 		 96 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000241312  hitchhiker  0.00832872 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0230  co-chaperonin GroES  58.7 
 
 		 94 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000701184  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0497  co-chaperonin GroES  54.74 
 
 		 95 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000741059  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1919  chaperonin Cpn10  58.51 
 
 		 100 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1937  co-chaperonin GroES  55.79 
 
 		 95 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000542677  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6544  chaperonin Cpn10  55.79 
 
 		 97 aa  108  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.303398  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0543  co-chaperonin GroES  55.79 
 
 		 96 aa  108  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00172283  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0699  co-chaperonin GroES  55.79 
 
 		 96 aa  108  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000000127096  unclonable  0.0000000000292135 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2340  chaperonin Cpn10  53.68 
 
 		 96 aa  108  3e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.4787  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2078  chaperonin Cpn10  53.68 
 
 		 104 aa  108  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.354886  normal  0.301492 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4326  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 		 103 aa  108  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.212063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2855  co-chaperonin GroES  57.45 
 
 		 103 aa  107  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3335  chaperonin Cpn10  53.19 
 
 		 96 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3660  chaperonin Cpn10  53.19 
 
 		 96 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.39196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0833  co-chaperonin GroES  57.45 
 
 		 95 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000406281  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3241  co-chaperonin GroES  57.45 
 
 		 103 aa  107  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.257157  normal  0.413821 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5138  co-chaperonin GroES  61.29 
 
 		 103 aa  107  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0735  co-chaperonin GroES  57.45 
 
 		 98 aa  107  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.224017  normal  0.240552 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1305  co-chaperonin GroES  57.45 
 
 		 94 aa  107  6e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000222526  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0145  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 		 103 aa  107  7.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3375  chaperonin Cpn10  56.38 
 
 		 95 aa  107  8.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0900877 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0020  co-chaperonin GroES  53.68 
 
 		 95 aa  106  9.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.436916  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0706  co-chaperonin GroES  52.63 
 
 		 96 aa  106  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0782  co-chaperonin GroES  54.74 
 
 		 95 aa  106  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000134232  normal  0.229637 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1789  co-chaperonin GroES  59.34 
 
 		 103 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3714  co-chaperonin GroES  53.76 
 
 		 97 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.31168 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1770  chaperonin Cpn10  53.19 
 
 		 95 aa  106  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0933044  normal  0.173989 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3373  chaperonin Cpn10  55.91 
 
 		 94 aa  105  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5464  co-chaperonin GroES  54.26 
 
 		 104 aa  105  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.835161  normal  0.183317 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0286  co-chaperonin GroES  49.47 
 
 		 127 aa  106  1e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000313463  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1737  co-chaperonin GroES  53.19 
 
 		 95 aa  106  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.168742  hitchhiker  0.00175489 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5250  co-chaperonin GroES  52.13 
 
 		 96 aa  106  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.584342  normal  0.464773 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4783  co-chaperonin GroES  52.13 
 
 		 96 aa  106  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0265575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5326  co-chaperonin GroES  52.13 
 
 		 96 aa  106  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.769005  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2885  chaperonin cpn10  59.14 
 
 		 103 aa  105  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.478438  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1909  co-chaperonin GroES  49.47 
 
 		 96 aa  105  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.815751  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1768  chaperonin Cpn10  52.13 
 
 		 95 aa  105  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.939398  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>