More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1207 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1207  chaperonin Cpn10  100 
 
 		 99 aa  196  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.867572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1170  chaperonin Cpn10  84 
 
 		 127 aa  171  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.480442 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1180  chaperonin Cpn10  84 
 
 		 127 aa  171  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0241756 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1153  chaperonin Cpn10  84 
 
 		 127 aa  171  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4925  co-chaperonin GroES  84 
 
 		 100 aa  170  6.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1494  co-chaperonin GroES  84 
 
 		 100 aa  170  6.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13452  co-chaperonin GroES  83 
 
 		 100 aa  167  3e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000956292  hitchhiker  0.00171205 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6544  chaperonin Cpn10  81.25 
 
 		 97 aa  161  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.303398  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4453  chaperonin Cpn10  79.17 
 
 		 102 aa  159  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1719  chaperonin Cpn10  77.78 
 
 		 99 aa  158  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3842  chaperonin Cpn10  80.21 
 
 		 102 aa  157  4e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4232  chaperonin Cpn10  80.21 
 
 		 104 aa  157  5e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0774007 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1086  chaperonin Cpn10  79.17 
 
 		 98 aa  155  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.692359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04660  Co-chaperonin GroES  80.21 
 
 		 97 aa  155  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00798314  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3058  co-chaperonin GroES  77.32 
 
 		 98 aa  154  4e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.495905 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6002  co-chaperonin GroES  77.08 
 
 		 101 aa  150  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0711534 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2589  Chaperonin Cpn10  77.08 
 
 		 97 aa  149  8.999999999999999e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.565547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4258  chaperonin Cpn10  76.04 
 
 		 102 aa  147  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0632  co-chaperonin GroES  76.04 
 
 		 101 aa  147  5e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0684  chaperonin Cpn10  76.84 
 
 		 98 aa  147  5e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448895  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3647  co-chaperonin GroES  75 
 
 		 97 aa  147  5e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0735  co-chaperonin GroES  76.29 
 
 		 98 aa  146  9e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.224017  normal  0.240552 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2599  10 kD chaperone  73.2 
 
 		 103 aa  145  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0362  chaperonin Cpn10  80.43 
 
 		 102 aa  146  1.0000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.686615  normal  0.421985 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16550  Co-chaperonin GroES  74.23 
 
 		 98 aa  145  2.0000000000000003e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.639377  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0898  chaperonin Cpn10  69.7 
 
 		 99 aa  145  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.520012  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1007  chaperonin Cpn10  71.72 
 
 		 98 aa  145  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.103756 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0635  chaperonin Cpn10  76.84 
 
 		 97 aa  145  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28700  Co-chaperonin GroES  76.34 
 
 		 97 aa  143  8.000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.235736  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4026  Chaperonin Cpn10  73.68 
 
 		 103 aa  141  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1154  co-chaperonin GroES  72.16 
 
 		 103 aa  140  8e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2887  co-chaperonin GroES  73.2 
 
 		 97 aa  139  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0300428  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0619  chaperonin Cpn10  71.13 
 
 		 104 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143984  normal  0.40407 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2595  co-chaperonin GroES  72.16 
 
 		 97 aa  138  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000536943 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08630  Co-chaperonin GroES  63.54 
 
 		 98 aa  133  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0234  chaperonin GroS  67.74 
 
 		 97 aa  132  9.999999999999999e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1677  co-chaperonin GroES  66.67 
 
 		 97 aa  131  3e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0443  chaperonin Cpn10  64.95 
 
 		 97 aa  128  2.0000000000000002e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07560  Co-chaperonin GroES  63.54 
 
 		 98 aa  128  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.371401  normal  0.691399 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1856  groes  60.42 
 
 		 96 aa  123  8.000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.70749  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5811  chaperonin Cpn10  60.42 
 
 		 97 aa  119  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.907137  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0358  chaperonin Cpn10  53.68 
 
 		 98 aa  114  6e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1231  chaperonin Cpn10  58.33 
 
 		 96 aa  113  6.9999999999999995e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0288  co-chaperonin GroES  55.91 
 
 		 94 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000514345  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0252  co-chaperonin GroES  55.91 
 
 		 94 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000529101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0238  co-chaperonin GroES  55.91 
 
 		 94 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.27511e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0239  co-chaperonin GroES  55.91 
 
 		 94 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000442423  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0292  co-chaperonin GroES  55.91 
 
 		 94 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0316  co-chaperonin GroES  55.91 
 
 		 94 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000403137  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0266  co-chaperonin GroES  55.91 
 
 		 94 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164514  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1109  co-chaperonin GroES  60.22 
 
 		 94 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5027  co-chaperonin GroES  55.91 
 
 		 94 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000449913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0297  co-chaperonin GroES  55.91 
 
 		 94 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000149482  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1837  co-chaperonin GroES  52.04 
 
 		 98 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.747297  normal  0.0192495 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0245  co-chaperonin GroES  56.67 
 
 		 94 aa  111  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000139504  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0251  co-chaperonin GroES  55.91 
 
 		 94 aa  111  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000150313  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2130  chaperonin Cpn10  54.74 
 
 		 95 aa  110  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000318883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0958  co-chaperonin GroES  54.35 
 
 		 96 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4126  co-chaperonin GroES  51.02 
 
 		 98 aa  110  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.505672  normal  0.752904 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1332  co-chaperonin GroES  51.02 
 
 		 98 aa  110  6e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1405  co-chaperonin GroES  59.78 
 
 		 94 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000307277  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4725  co-chaperonin GroES  50.53 
 
 		 98 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0316  chaperonin Cpn10  56.84 
 
 		 92 aa  108  2.0000000000000002e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0011552  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1088  chaperonin Cpn10  54.44 
 
 		 98 aa  108  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000000466109  normal  0.037414 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0230  co-chaperonin GroES  58.06 
 
 		 94 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000701184  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0611  Chaperonin Cpn10  54.44 
 
 		 98 aa  108  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.740191  normal  0.337946 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0549  co-chaperonin GroES  55.43 
 
 		 95 aa  107  5e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000019989  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1789  co-chaperonin GroES  51.96 
 
 		 103 aa  107  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0425  co-chaperonin GroES  54.35 
 
 		 96 aa  107  6e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.1607099999999999e-20  hitchhiker  0.002869 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0160  chaperonin Cpn10  57.78 
 
 		 94 aa  106  8.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0409  co-chaperonin GroES  49.47 
 
 		 98 aa  105  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0379  chaperonin Cpn10  55.32 
 
 		 95 aa  106  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000945621  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6083  co-chaperonin GroES  49.47 
 
 		 98 aa  105  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1173  co-chaperonin GroES  47.37 
 
 		 98 aa  105  2e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.749354  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1165  chaperonin Cpn10  50 
 
 		 96 aa  105  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.731664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0545  chaperonin Cpn10  53.33 
 
 		 94 aa  105  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000554341  normal  0.812353 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0196  co-chaperonin GroES  48.98 
 
 		 98 aa  104  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2657  co-chaperonin GroES  51.04 
 
 		 96 aa  105  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2458  co-chaperonin GroES  51.09 
 
 		 104 aa  104  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0615  co-chaperonin GroES  51.04 
 
 		 96 aa  105  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0242301 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0489  chaperonin Cpn10  54 
 
 		 100 aa  104  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000458511  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05031  hypothetical protein  53.19 
 
 		 166 aa  104  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5366  chaperonin Cpn10  53.26 
 
 		 95 aa  104  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.583884  normal  0.676466 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2334  co-chaperonin GroES  52.08 
 
 		 96 aa  104  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0638712  normal  0.0156201 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2928  chaperonin Cpn10  51.04 
 
 		 96 aa  103  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000296393  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0794  co-chaperonin GroES  51.06 
 
 		 95 aa  104  5e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0142401 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0365  co-chaperonin GroES  55.43 
 
 		 96 aa  103  6e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000241312  hitchhiker  0.00832872 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5464  co-chaperonin GroES  50.55 
 
 		 104 aa  103  7e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.835161  normal  0.183317 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2228  co-chaperonin GroES  50 
 
 		 105 aa  103  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.145562  normal  0.505926 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1768  chaperonin Cpn10  48.91 
 
 		 95 aa  103  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.939398  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3339  co-chaperonin GroES  51.09 
 
 		 95 aa  103  8e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.148697  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3233  co-chaperonin GroES  50 
 
 		 105 aa  103  8e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.211647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3678  chaperonin Cpn10  48.48 
 
 		 100 aa  103  8e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00275768  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1672  co-chaperonin GroES  50.52 
 
 		 98 aa  103  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.723246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0471  co-chaperonin GroES  48.42 
 
 		 98 aa  103  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0516  co-chaperonin GroES  48.42 
 
 		 98 aa  103  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218545 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2175  chaperonin Cpn10  50 
 
 		 96 aa  103  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.95289 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0911  co-chaperonin GroES  50.53 
 
 		 97 aa  102  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.740154  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3171  co-chaperonin GroES  50 
 
 		 105 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.50399  normal  0.859314 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1737  co-chaperonin GroES  48.42 
 
 		 95 aa  102  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.168742  hitchhiker  0.00175489 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>