More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1405 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1405  co-chaperonin GroES  100 
 
 
94 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000307277  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2874  chaperonin Cpn10  75 
 
 
94 aa  140  8e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000282007  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0251  co-chaperonin GroES  69.89 
 
 
94 aa  134  4e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000150313  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0160  chaperonin Cpn10  71.74 
 
 
94 aa  134  4e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1109  co-chaperonin GroES  70.65 
 
 
94 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0297  co-chaperonin GroES  69.89 
 
 
94 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000149482  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2008  chaperonin Cpn10  68.48 
 
 
94 aa  132  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.377969  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0230  co-chaperonin GroES  70.97 
 
 
94 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000701184  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5027  co-chaperonin GroES  69.89 
 
 
94 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000449913  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0288  co-chaperonin GroES  68.82 
 
 
94 aa  131  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000514345  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0252  co-chaperonin GroES  68.82 
 
 
94 aa  131  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000529101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0238  co-chaperonin GroES  68.82 
 
 
94 aa  131  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.27511e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0239  co-chaperonin GroES  68.82 
 
 
94 aa  131  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000442423  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0292  co-chaperonin GroES  68.82 
 
 
94 aa  131  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0266  co-chaperonin GroES  68.82 
 
 
94 aa  131  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164514  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0316  co-chaperonin GroES  68.82 
 
 
94 aa  131  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000403137  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0379  chaperonin Cpn10  68.48 
 
 
95 aa  130  6.999999999999999e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000945621  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0245  co-chaperonin GroES  66.67 
 
 
94 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000139504  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0512  co-chaperonin GroES  67.74 
 
 
94 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28700  Co-chaperonin GroES  67.37 
 
 
97 aa  128  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.235736  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2891  co-chaperonin GroES  66.67 
 
 
94 aa  127  4.0000000000000003e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1231  chaperonin Cpn10  64.89 
 
 
96 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2574  co-chaperonin GroES  66.67 
 
 
94 aa  127  6e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2276  co-chaperonin GroES  66.67 
 
 
94 aa  126  8.000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04660  Co-chaperonin GroES  66.32 
 
 
97 aa  126  9.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00798314  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3647  co-chaperonin GroES  64.89 
 
 
97 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0391  co-chaperonin GroES  66.67 
 
 
94 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2589  Chaperonin Cpn10  62.11 
 
 
97 aa  124  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.565547  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0545  chaperonin Cpn10  65.93 
 
 
94 aa  124  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000554341  normal  0.812353 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0635  chaperonin Cpn10  64.21 
 
 
97 aa  124  4.0000000000000003e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0449  chaperonin Cpn10  64.89 
 
 
95 aa  123  8.000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00196884  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3058  co-chaperonin GroES  63.83 
 
 
98 aa  123  9e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.495905 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1919  chaperonin Cpn10  64.52 
 
 
100 aa  123  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2130  chaperonin Cpn10  61.7 
 
 
95 aa  123  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000318883  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0958  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 
96 aa  123  1e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6002  co-chaperonin GroES  63.44 
 
 
101 aa  122  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0711534 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4026  Chaperonin Cpn10  66.67 
 
 
103 aa  122  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1737  co-chaperonin GroES  63.16 
 
 
95 aa  122  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.168742  hitchhiker  0.00175489 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5250  co-chaperonin GroES  63.83 
 
 
96 aa  122  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.584342  normal  0.464773 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0632  co-chaperonin GroES  63.44 
 
 
101 aa  122  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1837  co-chaperonin GroES  63.16 
 
 
98 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.747297  normal  0.0192495 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4453  chaperonin Cpn10  64.89 
 
 
102 aa  122  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4783  co-chaperonin GroES  63.83 
 
 
96 aa  122  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0265575  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5326  co-chaperonin GroES  63.83 
 
 
96 aa  122  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.769005  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6544  chaperonin Cpn10  63.16 
 
 
97 aa  121  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.303398  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0362  chaperonin Cpn10  63.74 
 
 
102 aa  121  3e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.686615  normal  0.421985 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2114  co-chaperonin GroES  61.7 
 
 
104 aa  120  4e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0535  co-chaperonin GroES  63.83 
 
 
96 aa  121  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.235794  normal  0.722093 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5829  10 KD chaperonin (protein CPN10)  63.83 
 
 
98 aa  121  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0158717  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5464  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 
104 aa  121  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.835161  normal  0.183317 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1007  chaperonin Cpn10  63.04 
 
 
98 aa  120  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.103756 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0358  chaperonin Cpn10  61.7 
 
 
98 aa  120  5e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0674  chaperonin Cpn10  62.77 
 
 
95 aa  120  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248436  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3842  chaperonin Cpn10  65.22 
 
 
102 aa  120  6e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0684  chaperonin Cpn10  65.22 
 
 
98 aa  120  7e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448895  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4151  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 
96 aa  120  7e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0190602  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4265  chaperonin Cpn10  61.7 
 
 
104 aa  120  8e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228969  normal  0.0528982 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08630  Co-chaperonin GroES  62.77 
 
 
98 aa  120  8e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7829  chaperonin Cpn10  61.7 
 
 
95 aa  120  8e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4232  chaperonin Cpn10  64.13 
 
 
104 aa  119  9e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0774007 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2887  co-chaperonin GroES  60.22 
 
 
97 aa  120  9e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0300428  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07560  Co-chaperonin GroES  61.7 
 
 
98 aa  119  9.999999999999999e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.371401  normal  0.691399 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1768  chaperonin Cpn10  61.7 
 
 
95 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.939398  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3335  chaperonin Cpn10  61.7 
 
 
96 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2595  co-chaperonin GroES  60.22 
 
 
97 aa  119  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000536943 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3373  chaperonin Cpn10  65.22 
 
 
94 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3660  chaperonin Cpn10  61.7 
 
 
96 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.39196  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5581  chaperonin Cpn10  61.7 
 
 
95 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3033  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 
104 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.960902  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2657  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 
96 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1770  chaperonin Cpn10  62.77 
 
 
95 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0933044  normal  0.173989 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1332  co-chaperonin GroES  60 
 
 
98 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0794  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 
95 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0142401 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2458  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 
104 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2504  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 
104 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2529  co-chaperonin GroES  61.05 
 
 
97 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0262789 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4126  co-chaperonin GroES  60 
 
 
98 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.505672  normal  0.752904 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0615  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 
96 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0242301 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1719  chaperonin Cpn10  61.05 
 
 
99 aa  118  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1864  co-chaperonin GroES  60 
 
 
97 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.563369  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1165  chaperonin Cpn10  62.77 
 
 
96 aa  118  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.731664  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2002  co-chaperonin GroES  60 
 
 
97 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3176  co-chaperonin GroES  60 
 
 
97 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.521457  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0409  co-chaperonin GroES  61.7 
 
 
98 aa  118  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0749  co-chaperonin GroES  60 
 
 
97 aa  118  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0685029 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1457  co-chaperonin GroES  60 
 
 
97 aa  118  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0578  co-chaperonin GroES  61.7 
 
 
96 aa  118  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.196352  normal  0.456012 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6083  co-chaperonin GroES  61.7 
 
 
98 aa  118  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3154  co-chaperonin GroES  60 
 
 
97 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3118  co-chaperonin GroES  60 
 
 
97 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.143414  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2228  co-chaperonin GroES  61.7 
 
 
105 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.145562  normal  0.505926 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2741  co-chaperonin GroES  60 
 
 
97 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.260788  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0911  co-chaperonin GroES  60 
 
 
97 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.740154  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1856  groes  64.21 
 
 
96 aa  118  3e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.70749  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0732  co-chaperonin GroES  60 
 
 
97 aa  118  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138377  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3233  co-chaperonin GroES  61.7 
 
 
105 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.211647  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2175  chaperonin Cpn10  61.7 
 
 
96 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.95289 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0534  co-chaperonin GroES  61.7 
 
 
96 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3063  co-chaperonin GroES  61.7 
 
 
95 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428511 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0516  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 
98 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.218545 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>