More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0925 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0925  chaperonin Cpn10  100 
 
 
97 aa  188  2e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000344509  hitchhiker  7.97374e-18 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0160  chaperonin Cpn10  61.29 
 
 
94 aa  117  7e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3373  chaperonin Cpn10  59.14 
 
 
94 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0379  chaperonin Cpn10  56.99 
 
 
95 aa  115  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000945621  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0564  chaperonin Cpn10  59.14 
 
 
102 aa  113  6.9999999999999995e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0549  co-chaperonin GroES  60 
 
 
95 aa  113  8.999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000019989  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3033  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 
104 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.960902  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0358  chaperonin Cpn10  56.7 
 
 
98 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2175  chaperonin Cpn10  56.84 
 
 
96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.95289 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16550  Co-chaperonin GroES  56.38 
 
 
98 aa  112  2.0000000000000002e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.639377  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2874  chaperonin Cpn10  55.91 
 
 
94 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000282007  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4258  chaperonin Cpn10  56.84 
 
 
102 aa  111  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4306  co-chaperonin GroES  58.95 
 
 
96 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235031  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0362  chaperonin Cpn10  58.95 
 
 
102 aa  110  5e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.686615  normal  0.421985 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0196  co-chaperonin GroES  56.7 
 
 
98 aa  110  7.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08630  Co-chaperonin GroES  55.32 
 
 
98 aa  110  7.000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1405  co-chaperonin GroES  62.11 
 
 
94 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000307277  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3647  co-chaperonin GroES  56.25 
 
 
97 aa  110  8.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1282  chaperonin Cpn10  59.34 
 
 
104 aa  110  9e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.509292 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2130  chaperonin Cpn10  50.53 
 
 
95 aa  110  9e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000318883  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0272  co-chaperonin GroES  57.45 
 
 
96 aa  109  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2008  chaperonin Cpn10  55.91 
 
 
94 aa  109  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.377969  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1231  chaperonin Cpn10  54.74 
 
 
96 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2114  co-chaperonin GroES  56.84 
 
 
104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4151  co-chaperonin GroES  59.34 
 
 
96 aa  109  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0190602  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1212  chaperonin Cpn10  55.67 
 
 
101 aa  109  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.694559  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5464  co-chaperonin GroES  57.45 
 
 
104 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.835161  normal  0.183317 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0489  chaperonin Cpn10  53.54 
 
 
100 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000458511  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2625  chaperonin Cpn10  57.89 
 
 
96 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1856  groes  56.84 
 
 
96 aa  108  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.70749  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0120  chaperonin Cpn10  57.89 
 
 
96 aa  109  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427234  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1770  chaperonin Cpn10  56.38 
 
 
95 aa  108  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0933044  normal  0.173989 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0409  co-chaperonin GroES  54.64 
 
 
98 aa  108  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1837  co-chaperonin GroES  54.64 
 
 
98 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.747297  normal  0.0192495 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6083  co-chaperonin GroES  54.64 
 
 
98 aa  108  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0619  chaperonin Cpn10  59.38 
 
 
104 aa  108  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143984  normal  0.40407 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4130  chaperonin Cpn10  54.64 
 
 
101 aa  108  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00154355  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0794  co-chaperonin GroES  56.38 
 
 
95 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0142401 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0178  co-chaperonin GroES  56.7 
 
 
98 aa  107  4.0000000000000004e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000749715  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1768  chaperonin Cpn10  55.32 
 
 
95 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.939398  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0674  chaperonin Cpn10  56.38 
 
 
95 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248436  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0248  chaperonin Cpn10  55.79 
 
 
96 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000171869  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5581  chaperonin Cpn10  55.32 
 
 
95 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04660  Co-chaperonin GroES  57.45 
 
 
97 aa  107  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00798314  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1086  chaperonin Cpn10  57.89 
 
 
98 aa  107  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.692359  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7829  chaperonin Cpn10  55.32 
 
 
95 aa  107  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28700  Co-chaperonin GroES  57.45 
 
 
97 aa  107  5e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.235736  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0516  co-chaperonin GroES  54.64 
 
 
98 aa  107  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.218545 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0635  chaperonin Cpn10  57.45 
 
 
97 aa  107  5e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0471  co-chaperonin GroES  54.64 
 
 
98 aa  107  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1719  chaperonin Cpn10  53.61 
 
 
99 aa  107  6e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3714  co-chaperonin GroES  56.84 
 
 
97 aa  107  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.31168 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3734  co-chaperonin GroES  57.89 
 
 
97 aa  106  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.619596  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2589  Chaperonin Cpn10  54.74 
 
 
97 aa  106  9.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.565547  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3593  co-chaperonin GroES  57.89 
 
 
97 aa  106  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3660  co-chaperonin GroES  57.89 
 
 
97 aa  106  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0336408  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1332  co-chaperonin GroES  52.58 
 
 
98 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1165  chaperonin Cpn10  57.45 
 
 
96 aa  106  9.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.731664  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3339  co-chaperonin GroES  56.84 
 
 
95 aa  106  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.148697  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1737  co-chaperonin GroES  55.32 
 
 
95 aa  106  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.168742  hitchhiker  0.00175489 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0232  chaperonin Cpn10  54.74 
 
 
96 aa  106  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2520  chaperone Hsp10, part of GroE chaperone system  56.38 
 
 
95 aa  106  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.691961  normal  0.971453 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1098  chaperonin Cpn10/GroES  51.58 
 
 
101 aa  106  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000000000347589  hitchhiker  0.000183313 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5829  10 KD chaperonin (protein CPN10)  54.64 
 
 
98 aa  105  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0158717  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2346  chaperonin Cpn10  57.89 
 
 
95 aa  106  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00216658  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0535  co-chaperonin GroES  58.89 
 
 
96 aa  105  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.235794  normal  0.722093 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3063  co-chaperonin GroES  54.74 
 
 
95 aa  105  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428511 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0161  chaperonin Cpn10  58.24 
 
 
104 aa  105  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327073  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6544  chaperonin Cpn10  56.25 
 
 
97 aa  105  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.303398  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4725  co-chaperonin GroES  52.58 
 
 
98 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4126  co-chaperonin GroES  52.58 
 
 
98 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.505672  normal  0.752904 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1173  co-chaperonin GroES  51.55 
 
 
98 aa  105  2e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.749354  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4265  chaperonin Cpn10  58.24 
 
 
104 aa  105  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228969  normal  0.0528982 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2803  co-chaperonin GroES  54.74 
 
 
95 aa  105  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000132343  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1154  co-chaperonin GroES  57.29 
 
 
103 aa  105  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5848  chaperonin Cpn10  54.74 
 
 
104 aa  104  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134005  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3375  chaperonin Cpn10  56.38 
 
 
95 aa  105  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0900877 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13452  co-chaperonin GroES  54.55 
 
 
100 aa  105  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000956292  hitchhiker  0.00171205 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3842  chaperonin Cpn10  56.84 
 
 
102 aa  105  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0541  co-chaperonin GroES  56.38 
 
 
95 aa  105  3e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000000160733  normal  0.58747 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0028  co-chaperonin GroES  55.79 
 
 
95 aa  104  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.32588e-17  normal  0.625386 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0586  chaperonin Cpn10  57.78 
 
 
95 aa  105  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.515387  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4232  chaperonin Cpn10  56.84 
 
 
104 aa  104  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0774007 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2053  chaperonin Cpn10  53.06 
 
 
98 aa  104  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07560  Co-chaperonin GroES  53.68 
 
 
98 aa  104  4e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.371401  normal  0.691399 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4925  co-chaperonin GroES  54.55 
 
 
100 aa  104  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1494  co-chaperonin GroES  54.55 
 
 
100 aa  104  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4783  co-chaperonin GroES  57.78 
 
 
96 aa  104  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0265575  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5250  co-chaperonin GroES  57.78 
 
 
96 aa  104  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.584342  normal  0.464773 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1305  co-chaperonin GroES  55.32 
 
 
94 aa  104  5e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000222526  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5326  co-chaperonin GroES  57.78 
 
 
96 aa  104  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.769005  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1007  chaperonin Cpn10  54.64 
 
 
98 aa  104  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.103756 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3058  co-chaperonin GroES  54.74 
 
 
98 aa  104  5e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.495905 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1919  chaperonin Cpn10  55.1 
 
 
100 aa  103  6e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2458  co-chaperonin GroES  56.38 
 
 
104 aa  103  7e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3660  chaperonin Cpn10  55.56 
 
 
96 aa  103  7e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.39196  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3335  chaperonin Cpn10  55.56 
 
 
96 aa  103  8e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2573  co-chaperonin GroES  52.58 
 
 
98 aa  103  8e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.320362  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1180  chaperonin Cpn10  53.06 
 
 
127 aa  103  8e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0241756 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1170  chaperonin Cpn10  53.06 
 
 
127 aa  103  8e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.480442 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>