More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5464 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5464  co-chaperonin GroES  100 
 
 		 104 aa  203  6e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.835161  normal  0.183317 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1768  chaperonin Cpn10  93.62 
 
 		 95 aa  180  7e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.939398  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7829  chaperonin Cpn10  92.55 
 
 		 95 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0674  chaperonin Cpn10  90.43 
 
 		 95 aa  175  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248436  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3033  co-chaperonin GroES  83.65 
 
 		 104 aa  174  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.960902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5581  chaperonin Cpn10  89.36 
 
 		 95 aa  174  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5284  co-chaperonin GroES  80.77 
 
 		 104 aa  174  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.262452 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1770  chaperonin Cpn10  88.3 
 
 		 95 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0933044  normal  0.173989 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1165  chaperonin Cpn10  88.3 
 
 		 96 aa  171  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.731664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2114  co-chaperonin GroES  79.81 
 
 		 104 aa  170  5.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0358  chaperonin Cpn10  86.02 
 
 		 98 aa  169  9e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1737  co-chaperonin GroES  82.98 
 
 		 95 aa  169  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.168742  hitchhiker  0.00175489 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2504  co-chaperonin GroES  78.85 
 
 		 104 aa  169  1e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2191  co-chaperonin GroES  78.85 
 
 		 105 aa  168  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2458  co-chaperonin GroES  77.88 
 
 		 104 aa  168  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0535  co-chaperonin GroES  86.17 
 
 		 96 aa  167  6e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.235794  normal  0.722093 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1837  co-chaperonin GroES  82.98 
 
 		 98 aa  167  6e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.747297  normal  0.0192495 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0794  co-chaperonin GroES  82.98 
 
 		 95 aa  166  7e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0142401 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5326  co-chaperonin GroES  83.33 
 
 		 96 aa  166  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.769005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2078  chaperonin Cpn10  79.81 
 
 		 104 aa  166  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.354886  normal  0.301492 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4265  chaperonin Cpn10  77.88 
 
 		 104 aa  166  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228969  normal  0.0528982 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0409  co-chaperonin GroES  82.8 
 
 		 98 aa  166  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6083  co-chaperonin GroES  82.8 
 
 		 98 aa  166  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3233  co-chaperonin GroES  75 
 
 		 105 aa  165  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.211647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2228  co-chaperonin GroES  75 
 
 		 105 aa  165  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.145562  normal  0.505926 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1177  co-chaperonin GroES  75 
 
 		 105 aa  165  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.510717  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1282  chaperonin Cpn10  74.04 
 
 		 104 aa  164  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.509292 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4783  co-chaperonin GroES  84.04 
 
 		 96 aa  164  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0265575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5250  co-chaperonin GroES  84.04 
 
 		 96 aa  164  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.584342  normal  0.464773 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4725  co-chaperonin GroES  80.65 
 
 		 98 aa  163  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5848  chaperonin Cpn10  71.15 
 
 		 104 aa  163  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4126  co-chaperonin GroES  79.79 
 
 		 98 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.505672  normal  0.752904 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3195  co-chaperonin GroES  81.52 
 
 		 98 aa  162  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3096  chaperonin Cpn10  75 
 
 		 104 aa  162  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0740  co-chaperonin GroES  84.04 
 
 		 95 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0196  co-chaperonin GroES  85.11 
 
 		 98 aa  162  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0471  co-chaperonin GroES  81.72 
 
 		 98 aa  161  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0516  co-chaperonin GroES  81.72 
 
 		 98 aa  161  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218545 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2593  co-chaperonin GroES  80.85 
 
 		 105 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.458654  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1672  co-chaperonin GroES  81.52 
 
 		 98 aa  161  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.723246  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5039  chaperonin Cpn10  71.15 
 
 		 104 aa  160  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3660  chaperonin Cpn10  77.08 
 
 		 96 aa  160  6e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.39196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3335  chaperonin Cpn10  77.08 
 
 		 96 aa  160  7e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2520  chaperone Hsp10, part of GroE chaperone system  80.85 
 
 		 95 aa  160  8.000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.691961  normal  0.971453 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3171  co-chaperonin GroES  71.15 
 
 		 105 aa  160  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.50399  normal  0.859314 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1332  co-chaperonin GroES  77.66 
 
 		 98 aa  159  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2573  co-chaperonin GroES  79.35 
 
 		 98 aa  158  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.320362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0178  co-chaperonin GroES  82.98 
 
 		 98 aa  159  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000749715  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3027  chaperonin Cpn10  80.85 
 
 		 121 aa  157  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0453  chaperonin Cpn10  79.79 
 
 		 95 aa  157  5e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3375  chaperonin Cpn10  78.72 
 
 		 95 aa  156  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0900877 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0034  chaperonin Cpn10  78.72 
 
 		 95 aa  154  3e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0295415  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4151  co-chaperonin GroES  77.08 
 
 		 96 aa  152  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0190602  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5829  10 KD chaperonin (protein CPN10)  76.34 
 
 		 98 aa  152  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0158717  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0272  co-chaperonin GroES  75.27 
 
 		 96 aa  152  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2190  co-chaperonin GroES  76.6 
 
 		 95 aa  150  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0586  chaperonin Cpn10  77.66 
 
 		 95 aa  150  5e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.515387  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0984  co-chaperonin GroES  75.53 
 
 		 95 aa  150  8e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2310  co-chaperonin GroES  75.53 
 
 		 95 aa  150  8e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1043  chaperonin Cpn10  70.19 
 
 		 105 aa  148  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4586  co-chaperonin GroES  73.4 
 
 		 95 aa  147  6e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.480478 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0605  chaperonin Cpn10  75.53 
 
 		 95 aa  147  6e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.131818 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2920  chaperonin 10 Kd subunit  68.27 
 
 		 103 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.907264  normal  0.269903 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1173  co-chaperonin GroES  72.83 
 
 		 98 aa  144  3e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.749354  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0862  chaperonin Cpn10  72.92 
 
 		 99 aa  143  9e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.000545681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0161  chaperonin Cpn10  71.28 
 
 		 104 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327073  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3359  co-chaperonin GroES  65.26 
 
 		 95 aa  137  4.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.755845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0596  co-chaperonin GroES  65.26 
 
 		 95 aa  137  6e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.474477  normal  0.0912075 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0549  co-chaperonin GroES  70.21 
 
 		 95 aa  137  7e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000019989  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0296  chaperonin Cpn10  67.02 
 
 		 97 aa  133  9e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.018883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4306  co-chaperonin GroES  63.83 
 
 		 96 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235031  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0611  co-chaperonin GroES  76.6 
 
 		 105 aa  132  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.506455  normal  0.35889 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1806  co-chaperonin GroES  61.7 
 
 		 96 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265316  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0425  co-chaperonin GroES  61.46 
 
 		 96 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.1607099999999999e-20  hitchhiker  0.002869 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2803  co-chaperonin GroES  61.7 
 
 		 95 aa  129  9e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000132343  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1098  chaperonin Cpn10/GroES  62.22 
 
 		 101 aa  129  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000000000347589  hitchhiker  0.000183313 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2928  chaperonin Cpn10  58.51 
 
 		 96 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000296393  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3339  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 		 95 aa  128  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.148697  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2529  co-chaperonin GroES  59.38 
 
 		 97 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0262789 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1864  co-chaperonin GroES  58.33 
 
 		 97 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.563369  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2002  co-chaperonin GroES  58.33 
 
 		 97 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3154  co-chaperonin GroES  58.33 
 
 		 97 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3176  co-chaperonin GroES  58.33 
 
 		 97 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.521457  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3714  co-chaperonin GroES  64.13 
 
 		 97 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.31168 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1457  co-chaperonin GroES  58.33 
 
 		 97 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0749  co-chaperonin GroES  58.33 
 
 		 97 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0685029 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3118  co-chaperonin GroES  58.33 
 
 		 97 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.143414  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2741  co-chaperonin GroES  58.33 
 
 		 97 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.260788  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0911  co-chaperonin GroES  58.33 
 
 		 97 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.740154  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0732  co-chaperonin GroES  58.33 
 
 		 97 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138377  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2657  co-chaperonin GroES  57.45 
 
 		 96 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0092  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 		 96 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000241636  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0028  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 		 95 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.32588e-17  normal  0.625386 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0615  co-chaperonin GroES  57.45 
 
 		 96 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0242301 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0641  co-chaperonin GroES  57.45 
 
 		 96 aa  125  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0830  co-chaperonin GroES  57.29 
 
 		 97 aa  124  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000337917  decreased coverage  0.00000232712 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3954  co-chaperonin GroES  58.33 
 
 		 97 aa  125  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000645476  normal  0.0983553 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5366  chaperonin Cpn10  57.45 
 
 		 95 aa  124  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.583884  normal  0.676466 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0377  co-chaperonin GroES  57.29 
 
 		 97 aa  124  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00305942  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0859  co-chaperonin GroES  57.29 
 
 		 97 aa  124  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00336057  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>