More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3171 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_3171  co-chaperonin GroES  100 
 
 
105 aa  206  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.50399  normal  0.859314 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1177  co-chaperonin GroES  87.62 
 
 
105 aa  186  7e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.510717  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2191  co-chaperonin GroES  86.67 
 
 
105 aa  185  2e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3233  co-chaperonin GroES  87.62 
 
 
105 aa  185  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.211647  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2228  co-chaperonin GroES  87.62 
 
 
105 aa  184  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.145562  normal  0.505926 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5284  co-chaperonin GroES  84.62 
 
 
104 aa  181  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.262452 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2458  co-chaperonin GroES  85.58 
 
 
104 aa  180  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2593  co-chaperonin GroES  87.5 
 
 
105 aa  173  7e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.458654  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1672  co-chaperonin GroES  89.36 
 
 
98 aa  171  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.723246  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3195  co-chaperonin GroES  86.02 
 
 
98 aa  168  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2573  co-chaperonin GroES  86.02 
 
 
98 aa  167  5e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.320362  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1837  co-chaperonin GroES  82.98 
 
 
98 aa  163  8e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.747297  normal  0.0192495 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4725  co-chaperonin GroES  81.91 
 
 
98 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1332  co-chaperonin GroES  80.85 
 
 
98 aa  160  6e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5464  co-chaperonin GroES  71.15 
 
 
104 aa  160  8.000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.835161  normal  0.183317 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5581  chaperonin Cpn10  78.95 
 
 
95 aa  159  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0674  chaperonin Cpn10  77.89 
 
 
95 aa  159  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248436  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4126  co-chaperonin GroES  79.79 
 
 
98 aa  159  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.505672  normal  0.752904 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7829  chaperonin Cpn10  78.72 
 
 
95 aa  158  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1165  chaperonin Cpn10  76.84 
 
 
96 aa  158  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.731664  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0358  chaperonin Cpn10  76.34 
 
 
98 aa  157  4e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2504  co-chaperonin GroES  68.27 
 
 
104 aa  157  4e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1737  co-chaperonin GroES  78.72 
 
 
95 aa  157  4e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.168742  hitchhiker  0.00175489 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4265  chaperonin Cpn10  72.12 
 
 
104 aa  157  5e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228969  normal  0.0528982 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1768  chaperonin Cpn10  77.66 
 
 
95 aa  157  5e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.939398  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2114  co-chaperonin GroES  70.19 
 
 
104 aa  157  6e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1770  chaperonin Cpn10  76.84 
 
 
95 aa  157  7e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0933044  normal  0.173989 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3033  co-chaperonin GroES  69.52 
 
 
104 aa  155  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.960902  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0794  co-chaperonin GroES  75.79 
 
 
95 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0142401 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5250  co-chaperonin GroES  75.79 
 
 
96 aa  153  7e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.584342  normal  0.464773 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5326  co-chaperonin GroES  75.79 
 
 
96 aa  153  7e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.769005  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4783  co-chaperonin GroES  75.79 
 
 
96 aa  153  7e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0265575  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0535  co-chaperonin GroES  73.68 
 
 
96 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.235794  normal  0.722093 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3096  chaperonin Cpn10  66.35 
 
 
104 aa  151  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0409  co-chaperonin GroES  72.04 
 
 
98 aa  149  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6083  co-chaperonin GroES  72.04 
 
 
98 aa  149  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0453  chaperonin Cpn10  71.58 
 
 
95 aa  148  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0740  co-chaperonin GroES  72.63 
 
 
95 aa  147  4e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5829  10 KD chaperonin (protein CPN10)  74.19 
 
 
98 aa  147  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0158717  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2078  chaperonin Cpn10  66.35 
 
 
104 aa  146  1.0000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.354886  normal  0.301492 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0196  co-chaperonin GroES  69.15 
 
 
98 aa  145  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1282  chaperonin Cpn10  59.62 
 
 
104 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.509292 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0272  co-chaperonin GroES  69.15 
 
 
96 aa  145  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0516  co-chaperonin GroES  68.82 
 
 
98 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.218545 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0471  co-chaperonin GroES  68.82 
 
 
98 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5848  chaperonin Cpn10  57.69 
 
 
104 aa  143  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134005  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3027  chaperonin Cpn10  69.15 
 
 
121 aa  143  7.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0034  chaperonin Cpn10  69.15 
 
 
95 aa  142  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0295415  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3660  chaperonin Cpn10  65.26 
 
 
96 aa  142  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.39196  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0178  co-chaperonin GroES  67.02 
 
 
98 aa  142  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000749715  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0586  chaperonin Cpn10  68.42 
 
 
95 aa  142  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.515387  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5039  chaperonin Cpn10  60 
 
 
104 aa  141  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747065  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3375  chaperonin Cpn10  67.02 
 
 
95 aa  140  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0900877 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3335  chaperonin Cpn10  64.21 
 
 
96 aa  140  4e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2920  chaperonin 10 Kd subunit  62.38 
 
 
103 aa  140  6e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.907264  normal  0.269903 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0425  co-chaperonin GroES  68.42 
 
 
96 aa  140  7e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.1607099999999999e-20  hitchhiker  0.002869 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2520  chaperone Hsp10, part of GroE chaperone system  65.96 
 
 
95 aa  139  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.691961  normal  0.971453 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1043  chaperonin Cpn10  60.95 
 
 
105 aa  138  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1806  co-chaperonin GroES  67.02 
 
 
96 aa  138  3e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265316  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1173  co-chaperonin GroES  63.83 
 
 
98 aa  137  7e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.749354  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0611  co-chaperonin GroES  76.6 
 
 
105 aa  136  7.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.506455  normal  0.35889 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2310  co-chaperonin GroES  64.21 
 
 
95 aa  136  8.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0984  co-chaperonin GroES  64.21 
 
 
95 aa  136  8.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4151  co-chaperonin GroES  63.83 
 
 
96 aa  135  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0190602  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3359  co-chaperonin GroES  64.21 
 
 
95 aa  135  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.755845  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4586  co-chaperonin GroES  66.32 
 
 
95 aa  135  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.480478 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2190  co-chaperonin GroES  63.16 
 
 
95 aa  135  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2529  co-chaperonin GroES  64.21 
 
 
97 aa  134  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0262789 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0578  co-chaperonin GroES  64.21 
 
 
96 aa  134  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.196352  normal  0.456012 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0641  co-chaperonin GroES  63.16 
 
 
96 aa  134  5e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0534  co-chaperonin GroES  64.89 
 
 
96 aa  134  5e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0911  co-chaperonin GroES  63.16 
 
 
97 aa  133  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.740154  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3118  co-chaperonin GroES  63.16 
 
 
97 aa  133  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.143414  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2002  co-chaperonin GroES  63.16 
 
 
97 aa  133  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3176  co-chaperonin GroES  63.16 
 
 
97 aa  133  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.521457  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2741  co-chaperonin GroES  63.16 
 
 
97 aa  133  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.260788  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1457  co-chaperonin GroES  63.16 
 
 
97 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3154  co-chaperonin GroES  63.16 
 
 
97 aa  133  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0749  co-chaperonin GroES  63.16 
 
 
97 aa  133  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0685029 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0732  co-chaperonin GroES  63.16 
 
 
97 aa  133  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138377  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1864  co-chaperonin GroES  63.16 
 
 
97 aa  133  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.563369  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2657  co-chaperonin GroES  62.11 
 
 
96 aa  132  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0830  co-chaperonin GroES  64.21 
 
 
97 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000337917  decreased coverage  0.00000232712 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0615  co-chaperonin GroES  62.11 
 
 
96 aa  132  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0242301 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0377  co-chaperonin GroES  64.21 
 
 
97 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00305942  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0549  co-chaperonin GroES  65.96 
 
 
95 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000019989  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0859  co-chaperonin GroES  64.21 
 
 
97 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00336057  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2334  co-chaperonin GroES  63.16 
 
 
96 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0638712  normal  0.0156201 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0092  co-chaperonin GroES  63.83 
 
 
96 aa  131  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000241636  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3954  co-chaperonin GroES  63.16 
 
 
97 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000645476  normal  0.0983553 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3339  co-chaperonin GroES  63.83 
 
 
95 aa  131  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.148697  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0863  co-chaperonin GroES  63.83 
 
 
96 aa  131  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000337259  normal  0.081408 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3816  co-chaperonin GroES  63.83 
 
 
96 aa  131  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125602  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0161  chaperonin Cpn10  67.02 
 
 
104 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327073  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0596  co-chaperonin GroES  63.83 
 
 
95 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.474477  normal  0.0912075 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4306  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 
96 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235031  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0482  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 
96 aa  129  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0605  chaperonin Cpn10  63.83 
 
 
95 aa  129  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.131818 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0296  chaperonin Cpn10  62.77 
 
 
97 aa  129  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.018883  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1519  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 
96 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000013656  normal  0.699142 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>