More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0596 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0596  co-chaperonin GroES  100 
 
 		 95 aa  187  4e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.474477  normal  0.0912075 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3359  co-chaperonin GroES  85.26 
 
 		 95 aa  163  8e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.755845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2190  co-chaperonin GroES  80.85 
 
 		 95 aa  160  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0984  co-chaperonin GroES  79.79 
 
 		 95 aa  159  9e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2310  co-chaperonin GroES  79.79 
 
 		 95 aa  159  9e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4586  co-chaperonin GroES  79.79 
 
 		 95 aa  156  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.480478 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2920  chaperonin 10 Kd subunit  78.95 
 
 		 103 aa  153  6e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.907264  normal  0.269903 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0034  chaperonin Cpn10  71.28 
 
 		 95 aa  142  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0295415  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0453  chaperonin Cpn10  73.4 
 
 		 95 aa  142  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5284  co-chaperonin GroES  69.15 
 
 		 104 aa  141  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.262452 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2114  co-chaperonin GroES  69.15 
 
 		 104 aa  140  5e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2504  co-chaperonin GroES  70.21 
 
 		 104 aa  140  5e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4265  chaperonin Cpn10  67.02 
 
 		 104 aa  138  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228969  normal  0.0528982 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3660  chaperonin Cpn10  68.09 
 
 		 96 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.39196  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5848  chaperonin Cpn10  64.89 
 
 		 104 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1282  chaperonin Cpn10  67.02 
 
 		 104 aa  138  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.509292 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5039  chaperonin Cpn10  65.96 
 
 		 104 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3335  chaperonin Cpn10  68.09 
 
 		 96 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0674  chaperonin Cpn10  68.09 
 
 		 95 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248436  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0471  co-chaperonin GroES  69.57 
 
 		 98 aa  138  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7829  chaperonin Cpn10  67.02 
 
 		 95 aa  137  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6083  co-chaperonin GroES  70.65 
 
 		 98 aa  138  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0358  chaperonin Cpn10  69.57 
 
 		 98 aa  138  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0516  co-chaperonin GroES  69.57 
 
 		 98 aa  138  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218545 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0409  co-chaperonin GroES  70.65 
 
 		 98 aa  138  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1165  chaperonin Cpn10  65.96 
 
 		 96 aa  137  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.731664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1768  chaperonin Cpn10  67.02 
 
 		 95 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.939398  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0586  chaperonin Cpn10  69.15 
 
 		 95 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.515387  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0535  co-chaperonin GroES  69.15 
 
 		 96 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.235794  normal  0.722093 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1737  co-chaperonin GroES  68.09 
 
 		 95 aa  137  4.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.168742  hitchhiker  0.00175489 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1173  co-chaperonin GroES  67.39 
 
 		 98 aa  137  4.999999999999999e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.749354  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5464  co-chaperonin GroES  65.26 
 
 		 104 aa  137  6e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.835161  normal  0.183317 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3033  co-chaperonin GroES  64.89 
 
 		 104 aa  137  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.960902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3027  chaperonin Cpn10  67.02 
 
 		 121 aa  137  7e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3233  co-chaperonin GroES  68.09 
 
 		 105 aa  136  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.211647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1770  chaperonin Cpn10  67.02 
 
 		 95 aa  136  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0933044  normal  0.173989 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5250  co-chaperonin GroES  68.09 
 
 		 96 aa  136  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.584342  normal  0.464773 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4783  co-chaperonin GroES  68.09 
 
 		 96 aa  136  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0265575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2228  co-chaperonin GroES  68.09 
 
 		 105 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.145562  normal  0.505926 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5326  co-chaperonin GroES  68.09 
 
 		 96 aa  136  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.769005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0272  co-chaperonin GroES  68.48 
 
 		 96 aa  136  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1672  co-chaperonin GroES  70.65 
 
 		 98 aa  135  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.723246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3096  chaperonin Cpn10  67.02 
 
 		 104 aa  135  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2458  co-chaperonin GroES  67.02 
 
 		 104 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5581  chaperonin Cpn10  67.02 
 
 		 95 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3375  chaperonin Cpn10  67.02 
 
 		 95 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0900877 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0794  co-chaperonin GroES  64.89 
 
 		 95 aa  134  4e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0142401 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0196  co-chaperonin GroES  65.96 
 
 		 98 aa  134  5e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2078  chaperonin Cpn10  67.02 
 
 		 104 aa  133  9e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.354886  normal  0.301492 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2191  co-chaperonin GroES  64.89 
 
 		 105 aa  132  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5829  10 KD chaperonin (protein CPN10)  67.39 
 
 		 98 aa  132  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0158717  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0740  co-chaperonin GroES  65.96 
 
 		 95 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4725  co-chaperonin GroES  66.3 
 
 		 98 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4151  co-chaperonin GroES  64.89 
 
 		 96 aa  131  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0190602  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1837  co-chaperonin GroES  64.89 
 
 		 98 aa  131  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.747297  normal  0.0192495 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4126  co-chaperonin GroES  64.89 
 
 		 98 aa  131  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.505672  normal  0.752904 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0178  co-chaperonin GroES  64.89 
 
 		 98 aa  131  3e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000749715  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3171  co-chaperonin GroES  63.83 
 
 		 105 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.50399  normal  0.859314 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2573  co-chaperonin GroES  65.22 
 
 		 98 aa  130  5e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.320362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2593  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 		 105 aa  130  6e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.458654  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2520  chaperone Hsp10, part of GroE chaperone system  61.7 
 
 		 95 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.691961  normal  0.971453 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1177  co-chaperonin GroES  61.7 
 
 		 105 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.510717  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1332  co-chaperonin GroES  63.83 
 
 		 98 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0605  chaperonin Cpn10  68.09 
 
 		 95 aa  127  4.0000000000000003e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.131818 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3195  co-chaperonin GroES  59.78 
 
 		 98 aa  127  7.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0862  chaperonin Cpn10  60.22 
 
 		 99 aa  126  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.000545681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2928  chaperonin Cpn10  60.64 
 
 		 96 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000296393  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1195  co-chaperonin GroES  63.83 
 
 		 95 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0507909  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3063  co-chaperonin GroES  63.83 
 
 		 95 aa  123  7e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428511 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0611  co-chaperonin GroES  71.28 
 
 		 105 aa  123  8.000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.506455  normal  0.35889 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1043  chaperonin Cpn10  61.7 
 
 		 105 aa  122  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2803  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 		 95 aa  122  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000132343  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0658  co-chaperonin GroES  61.7 
 
 		 96 aa  122  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.00000000933767  decreased coverage  0.00156326 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2474  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 		 95 aa  121  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0230053  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0552  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 		 96 aa  121  4e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0161  chaperonin Cpn10  62.77 
 
 		 104 aa  121  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327073  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0540  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 		 96 aa  121  4e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0263712 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1547  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 		 95 aa  120  5e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.807216  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2031  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 		 95 aa  120  7e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.133549  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0699  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 		 96 aa  120  8e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000000127096  unclonable  0.0000000000292135 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0543  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 		 96 aa  120  8e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00172283  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0760  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 		 96 aa  120  8e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000383794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0296  chaperonin Cpn10  58.51 
 
 		 97 aa  120  8e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.018883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0678  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 		 96 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.651132  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0742  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 		 96 aa  119  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0723  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 		 96 aa  119  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0425  co-chaperonin GroES  57.89 
 
 		 96 aa  119  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.1607099999999999e-20  hitchhiker  0.002869 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0092  co-chaperonin GroES  57.45 
 
 		 96 aa  119  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000241636  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0700  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 		 96 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.210155  normal  0.0126966 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0946  chaperonin Cpn10  57.45 
 
 		 96 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0150753  normal  0.737465 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2346  chaperonin Cpn10  56.38 
 
 		 95 aa  119  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00216658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0639  co-chaperonin GroES  55.32 
 
 		 96 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00560672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0549  co-chaperonin GroES  57.45 
 
 		 95 aa  118  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000019989  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2625  chaperonin Cpn10  58.51 
 
 		 96 aa  118  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0541  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 		 95 aa  118  3e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000000160733  normal  0.58747 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5366  chaperonin Cpn10  57.45 
 
 		 95 aa  117  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.583884  normal  0.676466 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2175  chaperonin Cpn10  58.51 
 
 		 96 aa  118  3.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.95289 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1132  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 		 96 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000135765  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0438  co-chaperonin GroES  57.45 
 
 		 96 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000705596  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0427  co-chaperonin GroES  56.38 
 
 		 96 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0874691  normal  0.929555 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>