More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1806 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1806  co-chaperonin GroES  100 
 
 		 96 aa  189  9e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265316  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1519  co-chaperonin GroES  92.71 
 
 		 96 aa  176  1e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000013656  normal  0.699142 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3816  co-chaperonin GroES  86.46 
 
 		 96 aa  167  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0863  co-chaperonin GroES  86.46 
 
 		 96 aa  167  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000337259  normal  0.081408 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2334  co-chaperonin GroES  85.42 
 
 		 96 aa  166  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0638712  normal  0.0156201 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3954  co-chaperonin GroES  85.26 
 
 		 97 aa  164  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000645476  normal  0.0983553 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2529  co-chaperonin GroES  85.26 
 
 		 97 aa  163  6.9999999999999995e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0262789 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2002  co-chaperonin GroES  84.21 
 
 		 97 aa  163  9e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3176  co-chaperonin GroES  84.21 
 
 		 97 aa  163  9e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.521457  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3154  co-chaperonin GroES  84.21 
 
 		 97 aa  163  9e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0749  co-chaperonin GroES  84.21 
 
 		 97 aa  163  9e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0685029 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1864  co-chaperonin GroES  84.21 
 
 		 97 aa  163  9e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.563369  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2741  co-chaperonin GroES  84.21 
 
 		 97 aa  163  9e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.260788  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0732  co-chaperonin GroES  84.21 
 
 		 97 aa  163  9e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138377  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3118  co-chaperonin GroES  84.21 
 
 		 97 aa  163  9e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.143414  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0911  co-chaperonin GroES  84.21 
 
 		 97 aa  163  9e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.740154  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1457  co-chaperonin GroES  84.21 
 
 		 97 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0830  co-chaperonin GroES  85.26 
 
 		 97 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000337917  decreased coverage  0.00000232712 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0377  co-chaperonin GroES  85.26 
 
 		 97 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00305942  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0859  co-chaperonin GroES  85.26 
 
 		 97 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00336057  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0534  co-chaperonin GroES  82.29 
 
 		 96 aa  160  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0641  co-chaperonin GroES  81.25 
 
 		 96 aa  159  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0578  co-chaperonin GroES  81.25 
 
 		 96 aa  158  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.196352  normal  0.456012 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2657  co-chaperonin GroES  80.21 
 
 		 96 aa  157  5e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1119  chaperonin Cpn10  79.17 
 
 		 96 aa  157  5e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0615  co-chaperonin GroES  80.21 
 
 		 96 aa  157  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0242301 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0658  co-chaperonin GroES  75 
 
 		 96 aa  156  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.00000000933767  decreased coverage  0.00156326 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0427  co-chaperonin GroES  77.08 
 
 		 96 aa  155  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0874691  normal  0.929555 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1132  co-chaperonin GroES  73.96 
 
 		 96 aa  155  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000135765  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0760  co-chaperonin GroES  73.96 
 
 		 96 aa  155  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000383794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0678  co-chaperonin GroES  75 
 
 		 96 aa  154  3e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.651132  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0700  co-chaperonin GroES  75 
 
 		 96 aa  154  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.210155  normal  0.0126966 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5660  co-chaperonin GroES  75 
 
 		 96 aa  154  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00582828  hitchhiker  0.00523053 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0482  co-chaperonin GroES  77.08 
 
 		 96 aa  153  6e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0092  co-chaperonin GroES  76.04 
 
 		 96 aa  153  8e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000241636  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0737  co-chaperonin GroES  77.89 
 
 		 96 aa  152  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.060744  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2029  co-chaperonin GroES  76.84 
 
 		 96 aa  151  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.218748  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0645  co-chaperonin GroES  77.89 
 
 		 96 aa  152  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0733336  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0946  chaperonin Cpn10  72.92 
 
 		 96 aa  150  5e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0150753  normal  0.737465 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2566  co-chaperonin GroES  73.96 
 
 		 96 aa  150  5e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000246528  normal  0.0576287 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0425  co-chaperonin GroES  75.53 
 
 		 96 aa  147  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.1607099999999999e-20  hitchhiker  0.002869 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0136  co-chaperonin GroES  71.88 
 
 		 96 aa  147  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0500096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1568  co-chaperonin GroES  70.83 
 
 		 96 aa  147  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1939  co-chaperonin GroES  75 
 
 		 96 aa  146  8e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0365  co-chaperonin GroES  71.58 
 
 		 96 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000241312  hitchhiker  0.00832872 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2458  co-chaperonin GroES  71.28 
 
 		 104 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3233  co-chaperonin GroES  71.28 
 
 		 105 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.211647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2228  co-chaperonin GroES  71.28 
 
 		 105 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.145562  normal  0.505926 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2345  co-chaperonin GroES  71.58 
 
 		 96 aa  144  3e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000000286758  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1419  chaperonin Cpn10  73.68 
 
 		 96 aa  144  5e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0269029  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3452  co-chaperonin GroES  69.79 
 
 		 96 aa  142  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.225017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2615  co-chaperonin GroES  69.79 
 
 		 96 aa  142  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.983112 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5284  co-chaperonin GroES  69.15 
 
 		 104 aa  143  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.262452 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5272  co-chaperonin GroES  69.79 
 
 		 96 aa  142  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.834518 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3523  co-chaperonin GroES  69.79 
 
 		 96 aa  142  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.85375  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1332  co-chaperonin GroES  65.96 
 
 		 98 aa  140  4e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3996  co-chaperonin GroES  68.75 
 
 		 96 aa  141  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0806135 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1837  co-chaperonin GroES  67.02 
 
 		 98 aa  139  9e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.747297  normal  0.0192495 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1672  co-chaperonin GroES  68.82 
 
 		 98 aa  139  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.723246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2191  co-chaperonin GroES  67.02 
 
 		 105 aa  138  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4725  co-chaperonin GroES  64.89 
 
 		 98 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2928  chaperonin Cpn10  65.62 
 
 		 96 aa  138  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000296393  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3171  co-chaperonin GroES  67.02 
 
 		 105 aa  138  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.50399  normal  0.859314 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4126  co-chaperonin GroES  64.89 
 
 		 98 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.505672  normal  0.752904 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1177  co-chaperonin GroES  68.09 
 
 		 105 aa  137  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.510717  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2573  co-chaperonin GroES  65.59 
 
 		 98 aa  137  4.999999999999999e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.320362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6097  chaperonin Cpn10  65.62 
 
 		 105 aa  137  6e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5254  chaperonin Cpn10  65.26 
 
 		 105 aa  137  7e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.321205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1165  chaperonin Cpn10  64.58 
 
 		 96 aa  137  7e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.731664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6393  chaperonin Cpn10  65.62 
 
 		 105 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.673453  normal  0.108093 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5326  co-chaperonin GroES  64.89 
 
 		 96 aa  135  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.769005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0358  chaperonin Cpn10  63.44 
 
 		 98 aa  135  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1737  co-chaperonin GroES  64.89 
 
 		 95 aa  135  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.168742  hitchhiker  0.00175489 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5250  co-chaperonin GroES  64.89 
 
 		 96 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.584342  normal  0.464773 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0794  co-chaperonin GroES  64.89 
 
 		 95 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0142401 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1770  chaperonin Cpn10  63.83 
 
 		 95 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0933044  normal  0.173989 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4783  co-chaperonin GroES  64.89 
 
 		 96 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0265575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2593  co-chaperonin GroES  65.96 
 
 		 105 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.458654  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0674  chaperonin Cpn10  64.89 
 
 		 95 aa  134  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248436  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3428  chaperonin Cpn10  64.21 
 
 		 105 aa  134  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3082  chaperonin Cpn10  64.21 
 
 		 105 aa  134  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2114  co-chaperonin GroES  61.46 
 
 		 104 aa  134  5e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2504  co-chaperonin GroES  61.05 
 
 		 104 aa  133  7.000000000000001e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7829  chaperonin Cpn10  63.83 
 
 		 95 aa  133  8e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2610  10 kDa chaperonin (Cpn10), groES  64.21 
 
 		 105 aa  133  8e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000523216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4543  10 kDa chaperonin (Cpn10), groES  64.21 
 
 		 105 aa  133  8e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000123576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0543  co-chaperonin GroES  67.71 
 
 		 96 aa  132  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00172283  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0535  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 		 96 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.235794  normal  0.722093 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0699  co-chaperonin GroES  67.71 
 
 		 96 aa  132  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000000127096  unclonable  0.0000000000292135 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6726  chaperonin Cpn10  62.11 
 
 		 105 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0286  co-chaperonin GroES  62.5 
 
 		 127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000313463  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5464  co-chaperonin GroES  61.7 
 
 		 104 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.835161  normal  0.183317 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3195  co-chaperonin GroES  63.44 
 
 		 98 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1768  chaperonin Cpn10  62.77 
 
 		 95 aa  131  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.939398  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0020  co-chaperonin GroES  64.21 
 
 		 95 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.436916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5581  chaperonin Cpn10  61.7 
 
 		 95 aa  131  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1581  chaperonin Cpn10  61.05 
 
 		 105 aa  131  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6250  chaperonin Cpn10  61.05 
 
 		 105 aa  131  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.646299 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0120  chaperonin Cpn10  65.62 
 
 		 96 aa  131  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2803  co-chaperonin GroES  62.11 
 
 		 95 aa  131  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000132343  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>