More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5829 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5829  10 KD chaperonin (protein CPN10)  100 
 
 		 98 aa  191  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0158717  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0358  chaperonin Cpn10  85.71 
 
 		 98 aa  171  3.9999999999999995e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0471  co-chaperonin GroES  84.69 
 
 		 98 aa  169  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0409  co-chaperonin GroES  85.71 
 
 		 98 aa  169  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6083  co-chaperonin GroES  85.71 
 
 		 98 aa  169  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0516  co-chaperonin GroES  84.69 
 
 		 98 aa  169  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218545 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5326  co-chaperonin GroES  83.87 
 
 		 96 aa  160  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.769005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4783  co-chaperonin GroES  83.87 
 
 		 96 aa  160  6e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0265575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5250  co-chaperonin GroES  83.87 
 
 		 96 aa  160  6e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.584342  normal  0.464773 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0674  chaperonin Cpn10  83.87 
 
 		 95 aa  160  8.000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248436  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1672  co-chaperonin GroES  77.32 
 
 		 98 aa  159  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.723246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2573  co-chaperonin GroES  75.51 
 
 		 98 aa  158  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.320362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1837  co-chaperonin GroES  76.53 
 
 		 98 aa  158  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.747297  normal  0.0192495 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3195  co-chaperonin GroES  77.32 
 
 		 98 aa  158  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0535  co-chaperonin GroES  81.72 
 
 		 96 aa  158  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.235794  normal  0.722093 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1332  co-chaperonin GroES  77.55 
 
 		 98 aa  158  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7829  chaperonin Cpn10  81.72 
 
 		 95 aa  157  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4725  co-chaperonin GroES  75.26 
 
 		 98 aa  157  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1770  chaperonin Cpn10  81.72 
 
 		 95 aa  157  5e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0933044  normal  0.173989 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1737  co-chaperonin GroES  80.85 
 
 		 95 aa  157  7e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.168742  hitchhiker  0.00175489 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5581  chaperonin Cpn10  80.65 
 
 		 95 aa  155  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1768  chaperonin Cpn10  80.65 
 
 		 95 aa  155  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.939398  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0794  co-chaperonin GroES  82.8 
 
 		 95 aa  155  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0142401 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4126  co-chaperonin GroES  74.49 
 
 		 98 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.505672  normal  0.752904 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2458  co-chaperonin GroES  79.57 
 
 		 104 aa  155  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5284  co-chaperonin GroES  79.35 
 
 		 104 aa  154  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.262452 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2504  co-chaperonin GroES  78.49 
 
 		 104 aa  154  5.0000000000000005e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3233  co-chaperonin GroES  78.49 
 
 		 105 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.211647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3660  chaperonin Cpn10  77.17 
 
 		 96 aa  153  6e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.39196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3335  chaperonin Cpn10  77.17 
 
 		 96 aa  153  6e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2228  co-chaperonin GroES  78.49 
 
 		 105 aa  153  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.145562  normal  0.505926 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1165  chaperonin Cpn10  80.65 
 
 		 96 aa  153  7e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.731664  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5039  chaperonin Cpn10  76.34 
 
 		 104 aa  153  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4265  chaperonin Cpn10  77.17 
 
 		 104 aa  152  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228969  normal  0.0528982 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5464  co-chaperonin GroES  76.34 
 
 		 104 aa  152  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.835161  normal  0.183317 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3027  chaperonin Cpn10  75.51 
 
 		 121 aa  152  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0272  co-chaperonin GroES  76.6 
 
 		 96 aa  152  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1177  co-chaperonin GroES  78.49 
 
 		 105 aa  152  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.510717  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1282  chaperonin Cpn10  76.09 
 
 		 104 aa  152  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.509292 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3033  co-chaperonin GroES  76.34 
 
 		 104 aa  152  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.960902  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5848  chaperonin Cpn10  73.12 
 
 		 104 aa  152  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0740  co-chaperonin GroES  79.57 
 
 		 95 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2191  co-chaperonin GroES  76.34 
 
 		 105 aa  151  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3096  chaperonin Cpn10  72.04 
 
 		 104 aa  151  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0196  co-chaperonin GroES  75.51 
 
 		 98 aa  151  4e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2114  co-chaperonin GroES  75.27 
 
 		 104 aa  149  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1173  co-chaperonin GroES  73.2 
 
 		 98 aa  149  1e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.749354  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4151  co-chaperonin GroES  76.34 
 
 		 96 aa  148  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0190602  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0586  chaperonin Cpn10  76.34 
 
 		 95 aa  148  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.515387  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2078  chaperonin Cpn10  75.27 
 
 		 104 aa  149  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.354886  normal  0.301492 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2520  chaperone Hsp10, part of GroE chaperone system  77.66 
 
 		 95 aa  148  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.691961  normal  0.971453 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3171  co-chaperonin GroES  74.19 
 
 		 105 aa  147  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.50399  normal  0.859314 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0178  co-chaperonin GroES  73.47 
 
 		 98 aa  147  4e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000749715  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2593  co-chaperonin GroES  75.27 
 
 		 105 aa  147  4e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.458654  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2190  co-chaperonin GroES  71.74 
 
 		 95 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2310  co-chaperonin GroES  70.65 
 
 		 95 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4586  co-chaperonin GroES  75.27 
 
 		 95 aa  144  4.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.480478 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0984  co-chaperonin GroES  70.65 
 
 		 95 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0034  chaperonin Cpn10  74.47 
 
 		 95 aa  144  5e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0295415  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0453  chaperonin Cpn10  73.12 
 
 		 95 aa  143  8.000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3375  chaperonin Cpn10  69.15 
 
 		 95 aa  140  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0900877 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0605  chaperonin Cpn10  70.97 
 
 		 95 aa  136  7.999999999999999e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.131818 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2920  chaperonin 10 Kd subunit  70.65 
 
 		 103 aa  135  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.907264  normal  0.269903 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3954  co-chaperonin GroES  67.02 
 
 		 97 aa  135  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000645476  normal  0.0983553 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1457  co-chaperonin GroES  65.96 
 
 		 97 aa  135  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2529  co-chaperonin GroES  67.02 
 
 		 97 aa  136  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0262789 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3118  co-chaperonin GroES  65.96 
 
 		 97 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.143414  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2002  co-chaperonin GroES  65.96 
 
 		 97 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2741  co-chaperonin GroES  65.96 
 
 		 97 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.260788  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1043  chaperonin Cpn10  69.89 
 
 		 105 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3176  co-chaperonin GroES  65.96 
 
 		 97 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.521457  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2334  co-chaperonin GroES  67.02 
 
 		 96 aa  135  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0638712  normal  0.0156201 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3154  co-chaperonin GroES  65.96 
 
 		 97 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0911  co-chaperonin GroES  65.96 
 
 		 97 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.740154  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0830  co-chaperonin GroES  67.02 
 
 		 97 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000337917  decreased coverage  0.00000232712 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0862  chaperonin Cpn10  64.21 
 
 		 99 aa  135  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.000545681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3816  co-chaperonin GroES  67.74 
 
 		 96 aa  135  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0863  co-chaperonin GroES  67.74 
 
 		 96 aa  135  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000337259  normal  0.081408 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0377  co-chaperonin GroES  67.02 
 
 		 97 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00305942  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0732  co-chaperonin GroES  65.96 
 
 		 97 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138377  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0859  co-chaperonin GroES  67.02 
 
 		 97 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00336057  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1864  co-chaperonin GroES  65.96 
 
 		 97 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.563369  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0749  co-chaperonin GroES  65.96 
 
 		 97 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0685029 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0161  chaperonin Cpn10  72.83 
 
 		 104 aa  134  4e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327073  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0296  chaperonin Cpn10  66.67 
 
 		 97 aa  134  4e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.018883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0425  co-chaperonin GroES  66.67 
 
 		 96 aa  134  6.0000000000000005e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.1607099999999999e-20  hitchhiker  0.002869 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3359  co-chaperonin GroES  65.22 
 
 		 95 aa  132  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.755845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0596  co-chaperonin GroES  67.39 
 
 		 95 aa  132  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.474477  normal  0.0912075 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0641  co-chaperonin GroES  64.52 
 
 		 96 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2657  co-chaperonin GroES  63.83 
 
 		 96 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0615  co-chaperonin GroES  63.83 
 
 		 96 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0242301 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0611  co-chaperonin GroES  77.42 
 
 		 105 aa  132  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.506455  normal  0.35889 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0534  co-chaperonin GroES  64.52 
 
 		 96 aa  131  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0678  co-chaperonin GroES  64.52 
 
 		 96 aa  131  3.9999999999999996e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.651132  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0092  co-chaperonin GroES  65.59 
 
 		 96 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000241636  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0578  co-chaperonin GroES  63.83 
 
 		 96 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.196352  normal  0.456012 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0700  co-chaperonin GroES  64.52 
 
 		 96 aa  131  3.9999999999999996e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.210155  normal  0.0126966 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0658  co-chaperonin GroES  65.59 
 
 		 96 aa  129  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.00000000933767  decreased coverage  0.00156326 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0482  co-chaperonin GroES  64.52 
 
 		 96 aa  129  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2474  co-chaperonin GroES  65.59 
 
 		 95 aa  128  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0230053  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>