More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0658 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_0658  co-chaperonin GroES  100 
 
 
96 aa  190  7e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.00000000933767  decreased coverage  0.00156326 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0760  co-chaperonin GroES  94.79 
 
 
96 aa  181  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000383794  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1132  co-chaperonin GroES  93.75 
 
 
96 aa  178  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000135765  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0678  co-chaperonin GroES  90.62 
 
 
96 aa  174  3e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.651132  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0700  co-chaperonin GroES  90.62 
 
 
96 aa  174  3e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.210155  normal  0.0126966 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5660  co-chaperonin GroES  90.62 
 
 
96 aa  173  6e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00582828  hitchhiker  0.00523053 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2566  co-chaperonin GroES  89.58 
 
 
96 aa  171  3.9999999999999995e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000246528  normal  0.0576287 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0946  chaperonin Cpn10  87.5 
 
 
96 aa  171  3.9999999999999995e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0150753  normal  0.737465 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0427  co-chaperonin GroES  87.5 
 
 
96 aa  170  6.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0874691  normal  0.929555 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1119  chaperonin Cpn10  86.46 
 
 
96 aa  166  7e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0482  co-chaperonin GroES  86.46 
 
 
96 aa  166  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0534  co-chaperonin GroES  82.29 
 
 
96 aa  159  9e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0641  co-chaperonin GroES  82.29 
 
 
96 aa  159  9e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2334  co-chaperonin GroES  82.29 
 
 
96 aa  159  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0638712  normal  0.0156201 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3816  co-chaperonin GroES  80.21 
 
 
96 aa  159  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125602  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0863  co-chaperonin GroES  80.21 
 
 
96 aa  159  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000337259  normal  0.081408 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0578  co-chaperonin GroES  82.29 
 
 
96 aa  158  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.196352  normal  0.456012 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2657  co-chaperonin GroES  82.29 
 
 
96 aa  159  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0615  co-chaperonin GroES  82.29 
 
 
96 aa  159  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0242301 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3954  co-chaperonin GroES  82.98 
 
 
97 aa  158  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000645476  normal  0.0983553 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2529  co-chaperonin GroES  82.98 
 
 
97 aa  157  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0262789 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1457  co-chaperonin GroES  81.91 
 
 
97 aa  157  5e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2002  co-chaperonin GroES  81.91 
 
 
97 aa  157  6e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0749  co-chaperonin GroES  81.91 
 
 
97 aa  157  6e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0685029 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3118  co-chaperonin GroES  81.91 
 
 
97 aa  157  6e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.143414  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3176  co-chaperonin GroES  81.91 
 
 
97 aa  157  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.521457  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1864  co-chaperonin GroES  81.91 
 
 
97 aa  157  6e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.563369  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3154  co-chaperonin GroES  81.91 
 
 
97 aa  157  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2741  co-chaperonin GroES  81.91 
 
 
97 aa  157  6e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.260788  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0911  co-chaperonin GroES  81.91 
 
 
97 aa  157  6e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.740154  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0732  co-chaperonin GroES  81.91 
 
 
97 aa  157  6e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138377  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1806  co-chaperonin GroES  75 
 
 
96 aa  156  1e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265316  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0377  co-chaperonin GroES  80.85 
 
 
97 aa  155  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00305942  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0859  co-chaperonin GroES  80.85 
 
 
97 aa  155  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00336057  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0830  co-chaperonin GroES  80.85 
 
 
97 aa  155  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000337917  decreased coverage  0.00000232712 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1519  co-chaperonin GroES  76.04 
 
 
96 aa  154  4e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000013656  normal  0.699142 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0092  co-chaperonin GroES  75 
 
 
96 aa  149  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000241636  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0425  co-chaperonin GroES  76.6 
 
 
96 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.1607099999999999e-20  hitchhiker  0.002869 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1419  chaperonin Cpn10  77.89 
 
 
96 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0269029  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2345  co-chaperonin GroES  73.68 
 
 
96 aa  142  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000000286758  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0737  co-chaperonin GroES  72.63 
 
 
96 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.060744  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0645  co-chaperonin GroES  72.63 
 
 
96 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0733336  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2029  co-chaperonin GroES  71.58 
 
 
96 aa  141  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.218748  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6097  chaperonin Cpn10  71.58 
 
 
105 aa  140  8e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6393  chaperonin Cpn10  71.58 
 
 
105 aa  140  8e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.673453  normal  0.108093 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3996  co-chaperonin GroES  69.79 
 
 
96 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0806135 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5272  co-chaperonin GroES  69.79 
 
 
96 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.834518 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3523  co-chaperonin GroES  69.79 
 
 
96 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.85375  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2615  co-chaperonin GroES  69.79 
 
 
96 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.983112 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1568  co-chaperonin GroES  68.75 
 
 
96 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0136  co-chaperonin GroES  69.79 
 
 
96 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0500096  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3452  co-chaperonin GroES  69.79 
 
 
96 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.225017  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2036  chaperonin Cpn10  67.37 
 
 
96 aa  138  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.283417  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1939  co-chaperonin GroES  71.58 
 
 
96 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0365  co-chaperonin GroES  69.47 
 
 
96 aa  137  6e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000241312  hitchhiker  0.00832872 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0619  chaperonin Cpn10  68.42 
 
 
96 aa  135  1e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4265  chaperonin Cpn10  66.32 
 
 
104 aa  134  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228969  normal  0.0528982 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0552  co-chaperonin GroES  65.26 
 
 
96 aa  134  4e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0540  co-chaperonin GroES  65.26 
 
 
96 aa  134  5e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0263712 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2928  chaperonin Cpn10  65.62 
 
 
96 aa  133  9e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000296393  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3428  chaperonin Cpn10  67.37 
 
 
105 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3082  chaperonin Cpn10  67.37 
 
 
105 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5254  chaperonin Cpn10  67.37 
 
 
105 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.321205  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2610  10 kDa chaperonin (Cpn10), groES  68.42 
 
 
105 aa  131  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000523216  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4543  10 kDa chaperonin (Cpn10), groES  68.42 
 
 
105 aa  131  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000123576  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0639  co-chaperonin GroES  64.21 
 
 
96 aa  132  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00560672  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2114  co-chaperonin GroES  60.42 
 
 
104 aa  130  6e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3233  co-chaperonin GroES  63.83 
 
 
105 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.211647  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2228  co-chaperonin GroES  63.83 
 
 
105 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.145562  normal  0.505926 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0438  co-chaperonin GroES  67.37 
 
 
96 aa  130  7.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000705596  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1332  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 
98 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5284  co-chaperonin GroES  63.83 
 
 
104 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.262452 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6726  chaperonin Cpn10  64.21 
 
 
105 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5829  10 KD chaperonin (protein CPN10)  65.59 
 
 
98 aa  129  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0158717  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4151  co-chaperonin GroES  64.21 
 
 
96 aa  129  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0190602  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2458  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 
104 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3429  chaperonin, 10 kDa  62.11 
 
 
105 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000999948  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3425  chaperonin, 10 kDa  62.11 
 
 
105 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3096  chaperonin Cpn10  58.33 
 
 
104 aa  128  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3391  chaperonin, 10 kDa  62.11 
 
 
105 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.974932  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0706  co-chaperonin GroES  65.26 
 
 
96 aa  127  3e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4783  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 
96 aa  128  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0265575  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5250  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 
96 aa  128  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.584342  normal  0.464773 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2504  co-chaperonin GroES  60 
 
 
104 aa  128  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5326  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 
96 aa  128  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.769005  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1581  chaperonin Cpn10  63.16 
 
 
105 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6250  chaperonin Cpn10  63.16 
 
 
105 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.646299 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1909  co-chaperonin GroES  61.46 
 
 
96 aa  127  5.0000000000000004e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.815751  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0286  co-chaperonin GroES  61.46 
 
 
127 aa  127  5.0000000000000004e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000313463  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0535  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 
96 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.235794  normal  0.722093 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4377  chaperonin, 10 kDa  65.62 
 
 
97 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4073  co-chaperonin GroES  65.62 
 
 
97 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.105969  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1837  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 
98 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.747297  normal  0.0192495 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5039  chaperonin Cpn10  56.84 
 
 
104 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747065  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0742  co-chaperonin GroES  64.58 
 
 
96 aa  126  8.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0723  co-chaperonin GroES  64.58 
 
 
96 aa  126  8.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1282  chaperonin Cpn10  55.79 
 
 
104 aa  125  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.509292 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1165  chaperonin Cpn10  60.42 
 
 
96 aa  125  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.731664  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0967  co-chaperonin GroES  65.62 
 
 
97 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387654  normal  0.774499 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13470  co-chaperonin GroES  65.62 
 
 
97 aa  126  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>