More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3339 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3339  co-chaperonin GroES  100 
 
 		 95 aa  184  3e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.148697  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0028  co-chaperonin GroES  92.63 
 
 		 95 aa  172  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.32588e-17  normal  0.625386 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4306  co-chaperonin GroES  83.16 
 
 		 96 aa  164  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235031  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2803  co-chaperonin GroES  78.95 
 
 		 95 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000132343  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0248  chaperonin Cpn10  78.95 
 
 		 96 aa  160  6e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000171869  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0232  chaperonin Cpn10  77.89 
 
 		 96 aa  159  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2928  chaperonin Cpn10  71.58 
 
 		 96 aa  148  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000296393  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0120  chaperonin Cpn10  75.79 
 
 		 96 aa  144  4.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5366  chaperonin Cpn10  68.42 
 
 		 95 aa  141  4e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.583884  normal  0.676466 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0549  co-chaperonin GroES  70.53 
 
 		 95 aa  141  4e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000019989  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0543  co-chaperonin GroES  70.53 
 
 		 96 aa  140  6e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00172283  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2771  10 Kd chaperone GroES  71.58 
 
 		 95 aa  140  6e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  8.05146e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0699  co-chaperonin GroES  70.53 
 
 		 96 aa  140  6e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000000127096  unclonable  0.0000000000292135 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3375  chaperonin Cpn10  65.96 
 
 		 95 aa  138  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0900877 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2458  co-chaperonin GroES  70.21 
 
 		 104 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3233  co-chaperonin GroES  69.15 
 
 		 105 aa  138  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.211647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3714  co-chaperonin GroES  71.28 
 
 		 97 aa  137  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.31168 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2228  co-chaperonin GroES  69.15 
 
 		 105 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.145562  normal  0.505926 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0453  chaperonin Cpn10  65.96 
 
 		 95 aa  137  3.9999999999999997e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3063  co-chaperonin GroES  69.47 
 
 		 95 aa  137  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428511 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1195  co-chaperonin GroES  67.37 
 
 		 95 aa  137  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0507909  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1165  chaperonin Cpn10  67.02 
 
 		 96 aa  137  4.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.731664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0365  co-chaperonin GroES  67.37 
 
 		 96 aa  137  6e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000241312  hitchhiker  0.00832872 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2191  co-chaperonin GroES  68.09 
 
 		 105 aa  136  7.999999999999999e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0092  co-chaperonin GroES  67.37 
 
 		 96 aa  135  1e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000241636  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2474  co-chaperonin GroES  65.26 
 
 		 95 aa  135  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0230053  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1837  co-chaperonin GroES  65.96 
 
 		 98 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.747297  normal  0.0192495 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0438  co-chaperonin GroES  66.32 
 
 		 96 aa  135  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000705596  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2922  co-chaperonin GroES  65.26 
 
 		 96 aa  134  4e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000127335  n/a   
 
 
 
NC_011145  AnaeK_3660  co-chaperonin GroES  68.09 
 
 		 97 aa  134  5e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0336408  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3593  co-chaperonin GroES  68.09 
 
 		 97 aa  134  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3734  co-chaperonin GroES  68.09 
 
 		 97 aa  134  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.619596  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0409  co-chaperonin GroES  64.52 
 
 		 98 aa  134  6.0000000000000005e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6083  co-chaperonin GroES  64.52 
 
 		 98 aa  134  6.0000000000000005e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5284  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 		 104 aa  133  7.000000000000001e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.262452 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0358  chaperonin Cpn10  62.37 
 
 		 98 aa  133  7.000000000000001e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0291  Chaperonin Cpn10  65.26 
 
 		 96 aa  133  9e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0587447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1770  chaperonin Cpn10  65.96 
 
 		 95 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0933044  normal  0.173989 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0674  chaperonin Cpn10  64.89 
 
 		 95 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248436  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1177  co-chaperonin GroES  64.89 
 
 		 105 aa  132  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.510717  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1737  co-chaperonin GroES  64.89 
 
 		 95 aa  132  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.168742  hitchhiker  0.00175489 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0586  chaperonin Cpn10  62.77 
 
 		 95 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.515387  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2175  chaperonin Cpn10  67.37 
 
 		 96 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.95289 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2078  chaperonin Cpn10  63.16 
 
 		 104 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.354886  normal  0.301492 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2625  chaperonin Cpn10  70.53 
 
 		 96 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0020  co-chaperonin GroES  61.05 
 
 		 95 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.436916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1282  chaperonin Cpn10  62.11 
 
 		 104 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.509292 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0471  co-chaperonin GroES  62.37 
 
 		 98 aa  131  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2114  co-chaperonin GroES  62.11 
 
 		 104 aa  131  3e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7829  chaperonin Cpn10  63.83 
 
 		 95 aa  131  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0639  co-chaperonin GroES  63.16 
 
 		 96 aa  131  3e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00560672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3171  co-chaperonin GroES  63.83 
 
 		 105 aa  131  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.50399  normal  0.859314 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1419  chaperonin Cpn10  65.26 
 
 		 96 aa  131  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0269029  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4265  chaperonin Cpn10  63.16 
 
 		 104 aa  131  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228969  normal  0.0528982 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0516  co-chaperonin GroES  62.37 
 
 		 98 aa  131  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218545 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1806  co-chaperonin GroES  61.05 
 
 		 96 aa  130  3.9999999999999996e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265316  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4126  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 		 98 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.505672  normal  0.752904 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1332  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 		 98 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4725  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 		 98 aa  130  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0794  co-chaperonin GroES  64.89 
 
 		 95 aa  130  6e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0142401 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2345  co-chaperonin GroES  64.21 
 
 		 96 aa  130  6e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000000286758  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2593  co-chaperonin GroES  64.89 
 
 		 105 aa  130  6.999999999999999e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.458654  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5581  chaperonin Cpn10  61.7 
 
 		 95 aa  129  9e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0706  co-chaperonin GroES  62.11 
 
 		 96 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0196  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 		 98 aa  129  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4151  co-chaperonin GroES  60 
 
 		 96 aa  129  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0190602  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2573  co-chaperonin GroES  65.59 
 
 		 98 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.320362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4783  co-chaperonin GroES  64.89 
 
 		 96 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0265575  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0534  co-chaperonin GroES  62.11 
 
 		 96 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1768  chaperonin Cpn10  62.77 
 
 		 95 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.939398  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5250  co-chaperonin GroES  64.89 
 
 		 96 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.584342  normal  0.464773 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0605  chaperonin Cpn10  62.77 
 
 		 95 aa  129  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.131818 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0286  co-chaperonin GroES  60 
 
 		 127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000313463  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5326  co-chaperonin GroES  64.89 
 
 		 96 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.769005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3033  co-chaperonin GroES  61.05 
 
 		 104 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.960902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0578  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 		 96 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.196352  normal  0.456012 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5464  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 		 104 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.835161  normal  0.183317 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1909  co-chaperonin GroES  60 
 
 		 96 aa  129  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.815751  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2520  chaperone Hsp10, part of GroE chaperone system  60.64 
 
 		 95 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.691961  normal  0.971453 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5848  chaperonin Cpn10  57.89 
 
 		 104 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1672  co-chaperonin GroES  62.37 
 
 		 98 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.723246  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0742  co-chaperonin GroES  63.16 
 
 		 96 aa  128  3e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0723  co-chaperonin GroES  63.16 
 
 		 96 aa  128  3e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0552  co-chaperonin GroES  60 
 
 		 96 aa  128  3e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2529  co-chaperonin GroES  61.7 
 
 		 97 aa  128  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0262789 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0161  chaperonin Cpn10  65.26 
 
 		 104 aa  128  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327073  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3027  chaperonin Cpn10  62.77 
 
 		 121 aa  128  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0540  co-chaperonin GroES  60 
 
 		 96 aa  128  3e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0263712 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3154  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 		 97 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0641  co-chaperonin GroES  61.7 
 
 		 96 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2002  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 		 97 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3425  chaperonin, 10 kDa  60 
 
 		 105 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3176  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 		 97 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.521457  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3429  chaperonin, 10 kDa  60 
 
 		 105 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000999948  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3118  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 		 97 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.143414  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2504  co-chaperonin GroES  58.95 
 
 		 104 aa  127  4.0000000000000003e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0749  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 		 97 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0685029 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1457  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 		 97 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3391  chaperonin, 10 kDa  60 
 
 		 105 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.974932  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0732  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 		 97 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138377  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>