More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2625 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2625  chaperonin Cpn10  100 
 
 		 96 aa  185  1e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2175  chaperonin Cpn10  81.05 
 
 		 96 aa  160  4.0000000000000004e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.95289 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0699  co-chaperonin GroES  71.58 
 
 		 96 aa  144  5e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000000127096  unclonable  0.0000000000292135 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0543  co-chaperonin GroES  71.58 
 
 		 96 aa  144  5e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00172283  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1195  co-chaperonin GroES  73.68 
 
 		 95 aa  142  1e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0507909  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3063  co-chaperonin GroES  72.63 
 
 		 95 aa  140  8e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428511 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0619  chaperonin Cpn10  68.75 
 
 		 96 aa  139  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2474  co-chaperonin GroES  69.47 
 
 		 95 aa  138  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0230053  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2803  co-chaperonin GroES  69.47 
 
 		 95 aa  138  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000132343  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0028  co-chaperonin GroES  71.58 
 
 		 95 aa  137  7e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.32588e-17  normal  0.625386 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0549  co-chaperonin GroES  69.47 
 
 		 95 aa  137  7e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000019989  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0120  chaperonin Cpn10  71.58 
 
 		 96 aa  137  7e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2928  chaperonin Cpn10  69.47 
 
 		 96 aa  136  7.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000296393  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3714  co-chaperonin GroES  71.58 
 
 		 97 aa  135  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.31168 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0020  co-chaperonin GroES  63.16 
 
 		 95 aa  135  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.436916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3593  co-chaperonin GroES  70.53 
 
 		 97 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3660  co-chaperonin GroES  70.53 
 
 		 97 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0336408  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3734  co-chaperonin GroES  70.53 
 
 		 97 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.619596  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0706  co-chaperonin GroES  62.5 
 
 		 96 aa  133  7.000000000000001e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5366  chaperonin Cpn10  69.47 
 
 		 95 aa  133  7.000000000000001e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.583884  normal  0.676466 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3339  co-chaperonin GroES  70.53 
 
 		 95 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.148697  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1705  chaperonin, 10 kDa subunit  65.62 
 
 		 96 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1547  co-chaperonin GroES  65.26 
 
 		 95 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.807216  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1419  chaperonin Cpn10  65.62 
 
 		 96 aa  131  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0269029  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4306  co-chaperonin GroES  67.37 
 
 		 96 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235031  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0291  Chaperonin Cpn10  61.46 
 
 		 96 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0587447  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0742  co-chaperonin GroES  61.05 
 
 		 96 aa  129  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0723  co-chaperonin GroES  61.05 
 
 		 96 aa  129  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0438  co-chaperonin GroES  59.38 
 
 		 96 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000705596  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0453  chaperonin Cpn10  63.83 
 
 		 95 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0286  co-chaperonin GroES  61.05 
 
 		 127 aa  128  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000313463  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2922  co-chaperonin GroES  59.38 
 
 		 96 aa  128  3e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000127335  n/a   
 
 
 
NC_010581  Bind_1737  co-chaperonin GroES  64.89 
 
 		 95 aa  128  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.168742  hitchhiker  0.00175489 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1909  co-chaperonin GroES  61.05 
 
 		 96 aa  127  3e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.815751  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0365  co-chaperonin GroES  61.46 
 
 		 96 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000241312  hitchhiker  0.00832872 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2346  chaperonin Cpn10  61.05 
 
 		 95 aa  127  4.0000000000000003e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00216658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2340  chaperonin Cpn10  59.38 
 
 		 96 aa  127  5.0000000000000004e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.4787  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0794  co-chaperonin GroES  64.89 
 
 		 95 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0142401 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1672  co-chaperonin GroES  64.52 
 
 		 98 aa  126  8.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.723246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3033  co-chaperonin GroES  60.42 
 
 		 104 aa  126  9.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.960902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2345  co-chaperonin GroES  61.46 
 
 		 96 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000000286758  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0586  chaperonin Cpn10  61.7 
 
 		 95 aa  125  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.515387  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1132  co-chaperonin GroES  62.11 
 
 		 96 aa  125  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000135765  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0760  co-chaperonin GroES  62.11 
 
 		 96 aa  126  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000383794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3375  chaperonin Cpn10  62.77 
 
 		 95 aa  125  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0900877 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1231  chaperonin Cpn10  57.89 
 
 		 96 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0427  co-chaperonin GroES  61.05 
 
 		 96 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0874691  normal  0.929555 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2114  co-chaperonin GroES  60 
 
 		 104 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7829  chaperonin Cpn10  60.64 
 
 		 95 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0674  chaperonin Cpn10  60.64 
 
 		 95 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248436  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1282  chaperonin Cpn10  60.42 
 
 		 104 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.509292 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0232  chaperonin Cpn10  63.16 
 
 		 96 aa  125  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0700  co-chaperonin GroES  58.95 
 
 		 96 aa  124  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.210155  normal  0.0126966 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0425  co-chaperonin GroES  60.42 
 
 		 96 aa  124  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.1607099999999999e-20  hitchhiker  0.002869 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0678  co-chaperonin GroES  58.95 
 
 		 96 aa  124  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.651132  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0605  chaperonin Cpn10  62.77 
 
 		 95 aa  124  3e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.131818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6590  chaperonin Cpn10  63.16 
 
 		 96 aa  124  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.870394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2504  co-chaperonin GroES  58.95 
 
 		 104 aa  124  4.0000000000000003e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3660  chaperonin Cpn10  61.46 
 
 		 96 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.39196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2573  co-chaperonin GroES  64.52 
 
 		 98 aa  124  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.320362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0160  chaperonin Cpn10  62.37 
 
 		 94 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3335  chaperonin Cpn10  61.46 
 
 		 96 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5284  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 		 104 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.262452 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1806  co-chaperonin GroES  60 
 
 		 96 aa  124  4.0000000000000003e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265316  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4725  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 		 98 aa  124  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1770  chaperonin Cpn10  60.64 
 
 		 95 aa  124  6e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0933044  normal  0.173989 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3954  co-chaperonin GroES  60.42 
 
 		 97 aa  123  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000645476  normal  0.0983553 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1837  co-chaperonin GroES  63.83 
 
 		 98 aa  123  7e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.747297  normal  0.0192495 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0863  co-chaperonin GroES  58.95 
 
 		 96 aa  123  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000337259  normal  0.081408 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3816  co-chaperonin GroES  58.95 
 
 		 96 aa  123  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1098  chaperonin Cpn10/GroES  60.64 
 
 		 101 aa  123  7e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000000000347589  hitchhiker  0.000183313 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0248  chaperonin Cpn10  62.11 
 
 		 96 aa  123  8.000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000171869  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2228  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 		 105 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.145562  normal  0.505926 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0958  co-chaperonin GroES  60 
 
 		 96 aa  123  8.000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3233  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 		 105 aa  123  9e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.211647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1165  chaperonin Cpn10  62.77 
 
 		 96 aa  123  9e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.731664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1768  chaperonin Cpn10  59.57 
 
 		 95 aa  123  9e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.939398  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4265  chaperonin Cpn10  62.11 
 
 		 104 aa  123  9e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228969  normal  0.0528982 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0092  co-chaperonin GroES  60 
 
 		 96 aa  122  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000241636  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2771  10 Kd chaperone GroES  65.26 
 
 		 95 aa  122  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  8.05146e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0161  chaperonin Cpn10  62.11 
 
 		 104 aa  122  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327073  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5581  chaperonin Cpn10  59.57 
 
 		 95 aa  123  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0482  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 		 96 aa  122  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2529  co-chaperonin GroES  60.42 
 
 		 97 aa  122  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0262789 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5254  chaperonin Cpn10  54.74 
 
 		 105 aa  123  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.321205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4151  co-chaperonin GroES  60.42 
 
 		 96 aa  122  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0190602  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2002  co-chaperonin GroES  60.42 
 
 		 97 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1864  co-chaperonin GroES  60.42 
 
 		 97 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.563369  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3118  co-chaperonin GroES  60.42 
 
 		 97 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.143414  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3176  co-chaperonin GroES  60.42 
 
 		 97 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.521457  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2334  co-chaperonin GroES  60 
 
 		 96 aa  122  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0638712  normal  0.0156201 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3154  co-chaperonin GroES  60.42 
 
 		 97 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2741  co-chaperonin GroES  60.42 
 
 		 97 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.260788  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1457  co-chaperonin GroES  60.42 
 
 		 97 aa  122  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0658  co-chaperonin GroES  60 
 
 		 96 aa  122  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.00000000933767  decreased coverage  0.00156326 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0587  chaperonin Cpn10  63.16 
 
 		 98 aa  122  2e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0674011  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0749  co-chaperonin GroES  60.42 
 
 		 97 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0685029 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0732  co-chaperonin GroES  60.42 
 
 		 97 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138377  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2458  co-chaperonin GroES  61.7 
 
 		 104 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0911  co-chaperonin GroES  60.42 
 
 		 97 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.740154  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>