More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4130 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4130  chaperonin Cpn10  100 
 
 
101 aa  200  5e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00154355  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1212  chaperonin Cpn10  98.02 
 
 
101 aa  197  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.694559  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0489  chaperonin Cpn10  89.9 
 
 
100 aa  176  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000458511  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3678  chaperonin Cpn10  69.39 
 
 
100 aa  150  8e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00275768  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1076  chaperonin Cpn10  70.1 
 
 
98 aa  140  9e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.12184  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0958  co-chaperonin GroES  64.95 
 
 
96 aa  130  9e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1056  chaperonin Cpn10  73.2 
 
 
97 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.900711  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1231  chaperonin Cpn10  63.92 
 
 
96 aa  125  1.0000000000000001e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3373  chaperonin Cpn10  62.77 
 
 
94 aa  121  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2778  chaperonin Cpn10  68.04 
 
 
98 aa  120  5e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0379  chaperonin Cpn10  62.77 
 
 
95 aa  120  7e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000945621  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1088  chaperonin Cpn10  59.6 
 
 
98 aa  120  8e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000000466109  normal  0.037414 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0611  Chaperonin Cpn10  59.6 
 
 
98 aa  119  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.740191  normal  0.337946 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2130  chaperonin Cpn10  57.29 
 
 
95 aa  117  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000318883  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0549  co-chaperonin GroES  61.46 
 
 
95 aa  117  6e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000019989  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0564  chaperonin Cpn10  62.11 
 
 
102 aa  116  7.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3714  co-chaperonin GroES  57.89 
 
 
97 aa  116  9e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.31168 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0160  chaperonin Cpn10  61.7 
 
 
94 aa  116  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3734  co-chaperonin GroES  57.89 
 
 
97 aa  114  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.619596  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4258  chaperonin Cpn10  53 
 
 
102 aa  114  5e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3593  co-chaperonin GroES  57.89 
 
 
97 aa  114  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3660  co-chaperonin GroES  57.89 
 
 
97 aa  114  5e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0336408  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1305  co-chaperonin GroES  56.84 
 
 
94 aa  113  7.999999999999999e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000222526  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0684  chaperonin Cpn10  59.14 
 
 
98 aa  112  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448895  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1919  chaperonin Cpn10  58.76 
 
 
100 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0362  chaperonin Cpn10  57.58 
 
 
102 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.686615  normal  0.421985 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0409  co-chaperonin GroES  58.76 
 
 
98 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6083  co-chaperonin GroES  58.76 
 
 
98 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1173  co-chaperonin GroES  54.64 
 
 
98 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.749354  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3647  co-chaperonin GroES  55.21 
 
 
97 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0586  chaperonin Cpn10  56.84 
 
 
95 aa  111  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.515387  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1165  chaperonin Cpn10  58.95 
 
 
96 aa  111  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.731664  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0674  chaperonin Cpn10  56.84 
 
 
95 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248436  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4306  co-chaperonin GroES  54.64 
 
 
96 aa  110  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235031  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5829  10 KD chaperonin (protein CPN10)  60.82 
 
 
98 aa  111  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0158717  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2008  chaperonin Cpn10  57.45 
 
 
94 aa  110  4.0000000000000004e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.377969  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2920  chaperonin 10 Kd subunit  60.22 
 
 
103 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.907264  normal  0.269903 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2874  chaperonin Cpn10  58.51 
 
 
94 aa  110  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000282007  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1109  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 
94 aa  110  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3058  co-chaperonin GroES  55.79 
 
 
98 aa  110  5e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.495905 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28700  Co-chaperonin GroES  58.95 
 
 
97 aa  110  5e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.235736  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0794  co-chaperonin GroES  58.95 
 
 
95 aa  110  5e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0142401 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1547  co-chaperonin GroES  55.79 
 
 
95 aa  110  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.807216  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08630  Co-chaperonin GroES  54.74 
 
 
98 aa  110  6e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0358  chaperonin Cpn10  59.79 
 
 
98 aa  110  6e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3842  chaperonin Cpn10  55 
 
 
102 aa  110  6e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4232  chaperonin Cpn10  55 
 
 
104 aa  110  8.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0774007 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4453  chaperonin Cpn10  53 
 
 
102 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1770  chaperonin Cpn10  56.84 
 
 
95 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0933044  normal  0.173989 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04660  Co-chaperonin GroES  57.29 
 
 
97 aa  109  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00798314  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0541  co-chaperonin GroES  54.74 
 
 
95 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000000160733  normal  0.58747 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2474  co-chaperonin GroES  57.29 
 
 
95 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0230053  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1737  co-chaperonin GroES  58.7 
 
 
95 aa  109  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.168742  hitchhiker  0.00175489 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0251  co-chaperonin GroES  56.99 
 
 
94 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000150313  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0471  co-chaperonin GroES  57.73 
 
 
98 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0196  co-chaperonin GroES  56.7 
 
 
98 aa  108  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2599  10 kD chaperone  54.46 
 
 
103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5581  chaperonin Cpn10  56.84 
 
 
95 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3033  co-chaperonin GroES  54.74 
 
 
104 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.960902  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0545  chaperonin Cpn10  61.96 
 
 
94 aa  108  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000554341  normal  0.812353 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1672  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 
98 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.723246  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1195  co-chaperonin GroES  55.21 
 
 
95 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0507909  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2625  chaperonin Cpn10  55.21 
 
 
96 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0516  co-chaperonin GroES  57.73 
 
 
98 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.218545 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0453  chaperonin Cpn10  57.89 
 
 
95 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1856  groes  56.7 
 
 
96 aa  108  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.70749  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7829  chaperonin Cpn10  57.61 
 
 
95 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0925  chaperonin Cpn10  54.64 
 
 
97 aa  108  3e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000344509  hitchhiker  7.97374e-18 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5464  co-chaperonin GroES  58.7 
 
 
104 aa  108  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.835161  normal  0.183317 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2175  chaperonin Cpn10  53.61 
 
 
96 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.95289 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3063  co-chaperonin GroES  54.17 
 
 
95 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428511 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2190  co-chaperonin GroES  56.99 
 
 
95 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1837  co-chaperonin GroES  57.89 
 
 
98 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.747297  normal  0.0192495 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1768  chaperonin Cpn10  56.52 
 
 
95 aa  107  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.939398  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1086  chaperonin Cpn10  54.74 
 
 
98 aa  107  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.692359  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4725  co-chaperonin GroES  57.14 
 
 
98 aa  107  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1719  chaperonin Cpn10  53.12 
 
 
99 aa  107  5e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2523  chaperonin Cpn10  54.74 
 
 
104 aa  107  5e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5366  chaperonin Cpn10  53.12 
 
 
95 aa  107  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.583884  normal  0.676466 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0833  co-chaperonin GroES  53.68 
 
 
95 aa  107  5e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000406281  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2928  chaperonin Cpn10  51.55 
 
 
96 aa  107  6e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000296393  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2504  co-chaperonin GroES  55.21 
 
 
104 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5284  co-chaperonin GroES  55.32 
 
 
104 aa  107  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.262452 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0288  co-chaperonin GroES  55.91 
 
 
94 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000514345  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0252  co-chaperonin GroES  55.91 
 
 
94 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000529101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0238  co-chaperonin GroES  55.91 
 
 
94 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.27511e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0239  co-chaperonin GroES  55.91 
 
 
94 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000442423  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0316  co-chaperonin GroES  55.91 
 
 
94 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000403137  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0266  co-chaperonin GroES  55.91 
 
 
94 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164514  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0292  co-chaperonin GroES  55.91 
 
 
94 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2458  co-chaperonin GroES  55.67 
 
 
104 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5027  co-chaperonin GroES  55.91 
 
 
94 aa  106  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000449913  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0297  co-chaperonin GroES  55.91 
 
 
94 aa  106  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000149482  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16550  Co-chaperonin GroES  51.04 
 
 
98 aa  106  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.639377  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3335  chaperonin Cpn10  58.7 
 
 
96 aa  106  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0984  co-chaperonin GroES  55.91 
 
 
95 aa  106  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2310  co-chaperonin GroES  55.91 
 
 
95 aa  106  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0535  co-chaperonin GroES  55.79 
 
 
96 aa  106  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.235794  normal  0.722093 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6590  chaperonin Cpn10  54.17 
 
 
96 aa  106  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.870394  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0605  chaperonin Cpn10  58.7 
 
 
95 aa  106  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.131818 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>