More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2053 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2053  chaperonin Cpn10  100 
 
 
98 aa  188  2e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0549  co-chaperonin GroES  61.05 
 
 
95 aa  122  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000019989  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3714  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 
97 aa  121  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.31168 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3734  co-chaperonin GroES  63.16 
 
 
97 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.619596  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3660  co-chaperonin GroES  63.16 
 
 
97 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0336408  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3593  co-chaperonin GroES  63.16 
 
 
97 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0453  chaperonin Cpn10  56.38 
 
 
95 aa  114  5e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2803  co-chaperonin GroES  55.79 
 
 
95 aa  114  5e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000132343  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0028  co-chaperonin GroES  55.79 
 
 
95 aa  114  6e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.32588e-17  normal  0.625386 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3339  co-chaperonin GroES  54.74 
 
 
95 aa  113  6.9999999999999995e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.148697  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4306  co-chaperonin GroES  54.74 
 
 
96 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235031  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0248  chaperonin Cpn10  52.63 
 
 
96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000171869  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1407  chaperonin Cpn10  58.76 
 
 
96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.780371 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1332  co-chaperonin GroES  54.64 
 
 
98 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6083  co-chaperonin GroES  51.55 
 
 
98 aa  111  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0409  co-chaperonin GroES  51.55 
 
 
98 aa  111  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1098  chaperonin Cpn10/GroES  51.58 
 
 
101 aa  111  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000000000347589  hitchhiker  0.000183313 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2928  chaperonin Cpn10  52.63 
 
 
96 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000296393  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0232  chaperonin Cpn10  51.58 
 
 
96 aa  110  6e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3375  chaperonin Cpn10  54.26 
 
 
95 aa  110  6e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0900877 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2771  10 Kd chaperone GroES  56.84 
 
 
95 aa  110  7.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  8.05146e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5581  chaperonin Cpn10  55.32 
 
 
95 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0358  chaperonin Cpn10  52.58 
 
 
98 aa  110  8.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5366  chaperonin Cpn10  55.79 
 
 
95 aa  110  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.583884  normal  0.676466 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2573  co-chaperonin GroES  51.55 
 
 
98 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.320362  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1770  chaperonin Cpn10  53.19 
 
 
95 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0933044  normal  0.173989 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1672  co-chaperonin GroES  53.61 
 
 
98 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.723246  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0958  co-chaperonin GroES  53.68 
 
 
96 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6590  chaperonin Cpn10  52.63 
 
 
96 aa  108  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.870394  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0586  chaperonin Cpn10  51.06 
 
 
95 aa  108  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.515387  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2078  chaperonin Cpn10  54.74 
 
 
104 aa  107  5e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.354886  normal  0.301492 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1837  co-chaperonin GroES  51.55 
 
 
98 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.747297  normal  0.0192495 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4725  co-chaperonin GroES  50 
 
 
98 aa  106  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4126  co-chaperonin GroES  51.55 
 
 
98 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.505672  normal  0.752904 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0489  chaperonin Cpn10  48.48 
 
 
100 aa  106  9.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000458511  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0196  co-chaperonin GroES  50.52 
 
 
98 aa  106  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0471  co-chaperonin GroES  48.45 
 
 
98 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4783  co-chaperonin GroES  52.13 
 
 
96 aa  106  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0265575  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5326  co-chaperonin GroES  52.13 
 
 
96 aa  106  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.769005  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0512  co-chaperonin GroES  56.84 
 
 
94 aa  106  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0034  chaperonin Cpn10  53.19 
 
 
95 aa  106  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0295415  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0516  co-chaperonin GroES  48.45 
 
 
98 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.218545 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0286  co-chaperonin GroES  54.17 
 
 
127 aa  106  1e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000313463  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5250  co-chaperonin GroES  52.13 
 
 
96 aa  106  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.584342  normal  0.464773 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1165  chaperonin Cpn10  54.26 
 
 
96 aa  106  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.731664  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0160  chaperonin Cpn10  53.76 
 
 
94 aa  105  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1282  chaperonin Cpn10  48.42 
 
 
104 aa  105  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.509292 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3063  co-chaperonin GroES  53.68 
 
 
95 aa  105  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428511 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5848  chaperonin Cpn10  46.32 
 
 
104 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134005  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0535  co-chaperonin GroES  52.13 
 
 
96 aa  105  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.235794  normal  0.722093 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0674  chaperonin Cpn10  51.06 
 
 
95 aa  105  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248436  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3033  co-chaperonin GroES  50.53 
 
 
104 aa  105  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.960902  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3335  chaperonin Cpn10  52.13 
 
 
96 aa  105  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2625  chaperonin Cpn10  53.68 
 
 
96 aa  104  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2474  co-chaperonin GroES  53.68 
 
 
95 aa  104  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0230053  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3660  chaperonin Cpn10  52.13 
 
 
96 aa  105  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.39196  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3195  co-chaperonin GroES  48.98 
 
 
98 aa  105  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2874  chaperonin Cpn10  51.61 
 
 
94 aa  104  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000282007  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2520  chaperone Hsp10, part of GroE chaperone system  53.19 
 
 
95 aa  104  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.691961  normal  0.971453 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0925  chaperonin Cpn10  53.06 
 
 
97 aa  104  4e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000344509  hitchhiker  7.97374e-18 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0742  co-chaperonin GroES  55.79 
 
 
96 aa  103  5e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0723  co-chaperonin GroES  55.79 
 
 
96 aa  103  5e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0161  chaperonin Cpn10  53.68 
 
 
104 aa  103  5e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327073  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7829  chaperonin Cpn10  50 
 
 
95 aa  104  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2891  co-chaperonin GroES  54.74 
 
 
94 aa  103  6e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1737  co-chaperonin GroES  51.06 
 
 
95 aa  103  6e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.168742  hitchhiker  0.00175489 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0178  co-chaperonin GroES  49.48 
 
 
98 aa  103  6e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000749715  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4151  co-chaperonin GroES  48.42 
 
 
96 aa  103  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0190602  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0794  co-chaperonin GroES  51.06 
 
 
95 aa  103  6e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0142401 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1705  chaperonin, 10 kDa subunit  53.68 
 
 
96 aa  103  7e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1768  chaperonin Cpn10  50 
 
 
95 aa  103  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.939398  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2340  chaperonin Cpn10  52.63 
 
 
96 aa  103  8e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.4787  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0611  Chaperonin Cpn10  51.09 
 
 
98 aa  103  8e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.740191  normal  0.337946 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1195  co-chaperonin GroES  50.53 
 
 
95 aa  103  8e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0507909  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5284  co-chaperonin GroES  51.06 
 
 
104 aa  103  9e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.262452 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0230  co-chaperonin GroES  53.26 
 
 
94 aa  103  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000701184  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2175  chaperonin Cpn10  51.58 
 
 
96 aa  103  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.95289 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0251  co-chaperonin GroES  52.17 
 
 
94 aa  103  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000150313  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1231  chaperonin Cpn10  47.37 
 
 
96 aa  103  1e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3027  chaperonin Cpn10  48.45 
 
 
121 aa  103  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0859  chaperonin Cpn10  54.17 
 
 
96 aa  102  1e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000206391  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5464  co-chaperonin GroES  50 
 
 
104 aa  103  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.835161  normal  0.183317 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0605  chaperonin Cpn10  52.13 
 
 
95 aa  102  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.131818 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1909  co-chaperonin GroES  53.68 
 
 
96 aa  103  1e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.815751  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5829  10 KD chaperonin (protein CPN10)  50.52 
 
 
98 aa  102  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0158717  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0145  co-chaperonin GroES  47.31 
 
 
103 aa  102  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3233  co-chaperonin GroES  51.06 
 
 
105 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.211647  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1547  co-chaperonin GroES  51.58 
 
 
95 aa  102  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.807216  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0391  co-chaperonin GroES  53.68 
 
 
94 aa  102  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2228  co-chaperonin GroES  51.06 
 
 
105 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.145562  normal  0.505926 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1109  co-chaperonin GroES  51.09 
 
 
94 aa  102  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2574  co-chaperonin GroES  52.63 
 
 
94 aa  102  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2346  chaperonin Cpn10  49.47 
 
 
95 aa  102  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00216658  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1088  chaperonin Cpn10  50 
 
 
98 aa  101  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000000466109  normal  0.037414 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3627  co-chaperonin GroES  53.26 
 
 
103 aa  101  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.711938  normal  0.0667876 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1173  co-chaperonin GroES  47.42 
 
 
98 aa  102  3e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.749354  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2230  co-chaperonin GroES  55.32 
 
 
95 aa  101  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2276  co-chaperonin GroES  52.63 
 
 
94 aa  101  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0379  chaperonin Cpn10  52.69 
 
 
95 aa  101  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000945621  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3373  chaperonin Cpn10  50.54 
 
 
94 aa  101  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>