More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0564 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0564  chaperonin Cpn10  100 
 
 
102 aa  201  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0160  chaperonin Cpn10  71.74 
 
 
94 aa  138  3e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2008  chaperonin Cpn10  66.3 
 
 
94 aa  129  1.0000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.377969  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3373  chaperonin Cpn10  66.3 
 
 
94 aa  128  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2874  chaperonin Cpn10  63.04 
 
 
94 aa  124  6e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000282007  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0958  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 
96 aa  120  6e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2927  chaperonin Cpn10  61.54 
 
 
96 aa  120  7e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1088  chaperonin Cpn10  61.86 
 
 
98 aa  120  8e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000000466109  normal  0.037414 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1231  chaperonin Cpn10  60.87 
 
 
96 aa  120  9e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0379  chaperonin Cpn10  59.78 
 
 
95 aa  119  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000945621  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1282  chaperonin Cpn10  60.22 
 
 
104 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.509292 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1212  chaperonin Cpn10  62.11 
 
 
101 aa  118  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.694559  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0288  co-chaperonin GroES  56.99 
 
 
94 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000514345  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0252  co-chaperonin GroES  56.99 
 
 
94 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000529101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0238  co-chaperonin GroES  56.99 
 
 
94 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.27511e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0239  co-chaperonin GroES  56.99 
 
 
94 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000442423  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0292  co-chaperonin GroES  56.99 
 
 
94 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0251  co-chaperonin GroES  56.99 
 
 
94 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000150313  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0266  co-chaperonin GroES  56.99 
 
 
94 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164514  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0316  co-chaperonin GroES  56.99 
 
 
94 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000403137  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5581  chaperonin Cpn10  60.87 
 
 
95 aa  117  6e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3678  chaperonin Cpn10  63.44 
 
 
100 aa  117  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00275768  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5027  co-chaperonin GroES  56.99 
 
 
94 aa  117  6e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000449913  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0358  chaperonin Cpn10  56.7 
 
 
98 aa  117  6e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0297  co-chaperonin GroES  56.99 
 
 
94 aa  117  6e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000149482  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1109  co-chaperonin GroES  59.78 
 
 
94 aa  117  6e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0489  chaperonin Cpn10  63.16 
 
 
100 aa  116  7.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000458511  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4130  chaperonin Cpn10  62.11 
 
 
101 aa  116  7.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00154355  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5811  chaperonin Cpn10  59.78 
 
 
97 aa  116  9e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.907137  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1076  chaperonin Cpn10  61.05 
 
 
98 aa  116  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.12184  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0245  co-chaperonin GroES  56.99 
 
 
94 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000139504  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0611  Chaperonin Cpn10  59.79 
 
 
98 aa  116  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.740191  normal  0.337946 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3195  co-chaperonin GroES  58.33 
 
 
98 aa  116  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7829  chaperonin Cpn10  59.14 
 
 
95 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1770  chaperonin Cpn10  58.7 
 
 
95 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0933044  normal  0.173989 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1332  co-chaperonin GroES  57.73 
 
 
98 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6083  co-chaperonin GroES  53.61 
 
 
98 aa  115  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0833  co-chaperonin GroES  57.45 
 
 
95 aa  115  3e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000406281  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0632  co-chaperonin GroES  56 
 
 
101 aa  114  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0409  co-chaperonin GroES  53.61 
 
 
98 aa  115  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0674  chaperonin Cpn10  58.7 
 
 
95 aa  114  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248436  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0438  co-chaperonin GroES  56.99 
 
 
96 aa  115  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000705596  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1737  co-chaperonin GroES  55.32 
 
 
95 aa  114  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.168742  hitchhiker  0.00175489 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1405  co-chaperonin GroES  57.45 
 
 
94 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000307277  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28700  Co-chaperonin GroES  59.57 
 
 
97 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.235736  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2573  co-chaperonin GroES  55.67 
 
 
98 aa  114  5e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.320362  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3842  chaperonin Cpn10  56 
 
 
102 aa  114  6e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3593  co-chaperonin GroES  56.52 
 
 
97 aa  114  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3734  co-chaperonin GroES  56.52 
 
 
97 aa  114  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.619596  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3660  co-chaperonin GroES  56.52 
 
 
97 aa  114  6e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0336408  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1672  co-chaperonin GroES  57.29 
 
 
98 aa  114  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.723246  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0619  chaperonin Cpn10  56.86 
 
 
104 aa  114  6e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143984  normal  0.40407 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0925  chaperonin Cpn10  59.14 
 
 
97 aa  113  6.9999999999999995e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000344509  hitchhiker  7.97374e-18 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3714  co-chaperonin GroES  56.52 
 
 
97 aa  114  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.31168 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1768  chaperonin Cpn10  58.06 
 
 
95 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.939398  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0497  co-chaperonin GroES  56.99 
 
 
95 aa  113  6.9999999999999995e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000741059  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4258  chaperonin Cpn10  53 
 
 
102 aa  113  7.999999999999999e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5848  chaperonin Cpn10  55.91 
 
 
104 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134005  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2340  chaperonin Cpn10  54.84 
 
 
96 aa  113  8.999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.4787  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5326  co-chaperonin GroES  57.61 
 
 
96 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.769005  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3647  co-chaperonin GroES  56.99 
 
 
97 aa  113  8.999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5284  co-chaperonin GroES  56.99 
 
 
104 aa  113  8.999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.262452 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5464  co-chaperonin GroES  58.06 
 
 
104 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.835161  normal  0.183317 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5250  co-chaperonin GroES  57.61 
 
 
96 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.584342  normal  0.464773 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0230  co-chaperonin GroES  56.99 
 
 
94 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000701184  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16550  Co-chaperonin GroES  55.91 
 
 
98 aa  112  1.0000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.639377  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0120  chaperonin Cpn10  55.91 
 
 
96 aa  112  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427234  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4783  co-chaperonin GroES  57.61 
 
 
96 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0265575  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6002  co-chaperonin GroES  56 
 
 
101 aa  112  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0711534 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5039  chaperonin Cpn10  56.99 
 
 
104 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747065  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0535  co-chaperonin GroES  57.61 
 
 
96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.235794  normal  0.722093 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1305  co-chaperonin GroES  55.91 
 
 
94 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000222526  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0679  co-chaperonin GroES  55.91 
 
 
95 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.221594 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4725  co-chaperonin GroES  56.25 
 
 
98 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0794  co-chaperonin GroES  54.84 
 
 
95 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0142401 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0425  co-chaperonin GroES  56.99 
 
 
96 aa  111  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.1607099999999999e-20  hitchhiker  0.002869 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4232  chaperonin Cpn10  57.14 
 
 
104 aa  111  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0774007 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0365  co-chaperonin GroES  58.06 
 
 
96 aa  111  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000241312  hitchhiker  0.00832872 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2610  10 kDa chaperonin (Cpn10), groES  54.35 
 
 
105 aa  111  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000523216  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4543  10 kDa chaperonin (Cpn10), groES  54.35 
 
 
105 aa  111  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000123576  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5829  10 KD chaperonin (protein CPN10)  54.64 
 
 
98 aa  111  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0158717  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1919  chaperonin Cpn10  57.45 
 
 
100 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0516  co-chaperonin GroES  52.58 
 
 
98 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.218545 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0034  chaperonin Cpn10  53.19 
 
 
95 aa  111  4.0000000000000004e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0295415  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5254  chaperonin Cpn10  54.35 
 
 
105 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.321205  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0471  co-chaperonin GroES  52.58 
 
 
98 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1937  co-chaperonin GroES  54.84 
 
 
95 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000542677  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0898  chaperonin Cpn10  52.04 
 
 
99 aa  110  5e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.520012  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2771  10 Kd chaperone GroES  55.91 
 
 
95 aa  110  5e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  8.05146e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0028  co-chaperonin GroES  57.61 
 
 
95 aa  110  5e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.32588e-17  normal  0.625386 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4126  co-chaperonin GroES  55.67 
 
 
98 aa  110  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.505672  normal  0.752904 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0362  chaperonin Cpn10  55 
 
 
102 aa  110  5e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.686615  normal  0.421985 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2130  chaperonin Cpn10  53.76 
 
 
95 aa  110  6e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000318883  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1837  co-chaperonin GroES  55.67 
 
 
98 aa  110  6e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.747297  normal  0.0192495 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0145  co-chaperonin GroES  53.12 
 
 
103 aa  110  7.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0706  co-chaperonin GroES  53.26 
 
 
96 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2589  Chaperonin Cpn10  56.38 
 
 
97 aa  110  8.000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.565547  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6726  chaperonin Cpn10  53.26 
 
 
105 aa  110  9e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04660  Co-chaperonin GroES  56.38 
 
 
97 aa  110  9e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00798314  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0020  co-chaperonin GroES  54.84 
 
 
95 aa  110  9e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.436916  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>