More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_07560 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_07560  Co-chaperonin GroES  100 
 
 
98 aa  193  7e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.371401  normal  0.691399 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4026  Chaperonin Cpn10  69.47 
 
 
103 aa  148  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08630  Co-chaperonin GroES  74.47 
 
 
98 aa  148  3e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4925  co-chaperonin GroES  71.88 
 
 
100 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1494  co-chaperonin GroES  71.88 
 
 
100 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13452  co-chaperonin GroES  70.83 
 
 
100 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000956292  hitchhiker  0.00171205 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3058  co-chaperonin GroES  73.96 
 
 
98 aa  145  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.495905 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1153  chaperonin Cpn10  70.53 
 
 
127 aa  144  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1180  chaperonin Cpn10  70.53 
 
 
127 aa  144  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0241756 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1170  chaperonin Cpn10  70.53 
 
 
127 aa  144  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.480442 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2589  Chaperonin Cpn10  73.4 
 
 
97 aa  143  8.000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.565547  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2599  10 kD chaperone  67.37 
 
 
103 aa  143  9e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3647  co-chaperonin GroES  73.4 
 
 
97 aa  143  9e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0684  chaperonin Cpn10  74.19 
 
 
98 aa  142  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448895  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1154  co-chaperonin GroES  69.47 
 
 
103 aa  142  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28700  Co-chaperonin GroES  74.47 
 
 
97 aa  142  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.235736  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0735  co-chaperonin GroES  70.83 
 
 
98 aa  139  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.224017  normal  0.240552 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4453  chaperonin Cpn10  69.79 
 
 
102 aa  139  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0619  chaperonin Cpn10  67.37 
 
 
104 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143984  normal  0.40407 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0362  chaperonin Cpn10  73.4 
 
 
102 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.686615  normal  0.421985 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0635  chaperonin Cpn10  72.34 
 
 
97 aa  138  1.9999999999999998e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4258  chaperonin Cpn10  68.42 
 
 
102 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3842  chaperonin Cpn10  71.58 
 
 
102 aa  137  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04660  Co-chaperonin GroES  70.53 
 
 
97 aa  137  3.9999999999999997e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00798314  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2887  co-chaperonin GroES  74.47 
 
 
97 aa  137  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0300428  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4232  chaperonin Cpn10  70.53 
 
 
104 aa  137  6e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0774007 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2595  co-chaperonin GroES  73.4 
 
 
97 aa  136  7.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000536943 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0632  co-chaperonin GroES  72.63 
 
 
101 aa  136  8.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6544  chaperonin Cpn10  69.47 
 
 
97 aa  136  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.303398  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6002  co-chaperonin GroES  71.58 
 
 
101 aa  135  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0711534 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16550  Co-chaperonin GroES  68.75 
 
 
98 aa  134  3.0000000000000003e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.639377  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1719  chaperonin Cpn10  74.47 
 
 
99 aa  134  4e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1086  chaperonin Cpn10  68.42 
 
 
98 aa  132  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.692359  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1007  chaperonin Cpn10  67 
 
 
98 aa  132  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.103756 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5811  chaperonin Cpn10  62.77 
 
 
97 aa  129  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.907137  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1207  chaperonin Cpn10  63.54 
 
 
99 aa  128  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.867572  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1677  co-chaperonin GroES  63.44 
 
 
97 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0898  chaperonin Cpn10  64.21 
 
 
99 aa  123  9e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.520012  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0379  chaperonin Cpn10  60 
 
 
95 aa  123  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000945621  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0234  chaperonin GroS  60.22 
 
 
97 aa  122  2e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0443  chaperonin Cpn10  61.96 
 
 
97 aa  121  3e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1856  groes  63.83 
 
 
96 aa  121  3e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.70749  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1231  chaperonin Cpn10  60 
 
 
96 aa  120  6e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1405  co-chaperonin GroES  61.7 
 
 
94 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000307277  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2130  chaperonin Cpn10  55.79 
 
 
95 aa  116  9e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000318883  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0160  chaperonin Cpn10  58.51 
 
 
94 aa  114  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2874  chaperonin Cpn10  58.51 
 
 
94 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000282007  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0251  co-chaperonin GroES  59.14 
 
 
94 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000150313  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0145  co-chaperonin GroES  52.58 
 
 
103 aa  114  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1109  co-chaperonin GroES  59.14 
 
 
94 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1165  chaperonin Cpn10  55.21 
 
 
96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.731664  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0292  co-chaperonin GroES  58.06 
 
 
94 aa  111  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0288  co-chaperonin GroES  58.06 
 
 
94 aa  111  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000514345  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0252  co-chaperonin GroES  58.06 
 
 
94 aa  111  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000529101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0238  co-chaperonin GroES  58.06 
 
 
94 aa  111  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.27511e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0239  co-chaperonin GroES  58.06 
 
 
94 aa  111  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000442423  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0266  co-chaperonin GroES  58.06 
 
 
94 aa  111  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164514  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0316  co-chaperonin GroES  58.06 
 
 
94 aa  111  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000403137  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3373  chaperonin Cpn10  59.57 
 
 
94 aa  111  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0297  co-chaperonin GroES  56.99 
 
 
94 aa  110  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000149482  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5027  co-chaperonin GroES  56.99 
 
 
94 aa  110  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000449913  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4265  chaperonin Cpn10  53.19 
 
 
104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228969  normal  0.0528982 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0969  co-chaperonin GroES  53.12 
 
 
103 aa  109  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.698543  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2114  co-chaperonin GroES  49.47 
 
 
104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0245  co-chaperonin GroES  55.91 
 
 
94 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000139504  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18371  co-chaperonin GroES  53.12 
 
 
103 aa  109  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0230  co-chaperonin GroES  56.99 
 
 
94 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000701184  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2928  chaperonin Cpn10  54.74 
 
 
96 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000296393  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05031  hypothetical protein  50.52 
 
 
166 aa  108  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5284  co-chaperonin GroES  52.13 
 
 
104 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.262452 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3714  co-chaperonin GroES  54.64 
 
 
97 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.31168 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0358  chaperonin Cpn10  52.13 
 
 
98 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0958  co-chaperonin GroES  55.32 
 
 
96 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0425  co-chaperonin GroES  52.13 
 
 
96 aa  107  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.1607099999999999e-20  hitchhiker  0.002869 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5254  chaperonin Cpn10  53.19 
 
 
105 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.321205  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7829  chaperonin Cpn10  50 
 
 
95 aa  107  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0505  co-chaperonin GroES  50 
 
 
103 aa  107  5e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.31516  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16161  co-chaperonin GroES  50 
 
 
103 aa  107  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.5001  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15561  co-chaperonin GroES  52.08 
 
 
103 aa  107  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16391  co-chaperonin GroES  50 
 
 
103 aa  107  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1768  chaperonin Cpn10  50 
 
 
95 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.939398  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2170  co-chaperonin GroES  50.52 
 
 
103 aa  106  8.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.100099 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2885  chaperonin cpn10  51.04 
 
 
103 aa  106  8.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.478438  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3171  co-chaperonin GroES  49.46 
 
 
105 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.50399  normal  0.859314 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3734  co-chaperonin GroES  52.58 
 
 
97 aa  105  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.619596  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2314  co-chaperonin GroES  47.92 
 
 
103 aa  106  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1173  co-chaperonin GroES  49.46 
 
 
98 aa  106  1e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.749354  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3593  co-chaperonin GroES  52.58 
 
 
97 aa  105  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1837  co-chaperonin GroES  51.06 
 
 
98 aa  105  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.747297  normal  0.0192495 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2625  chaperonin Cpn10  53.19 
 
 
96 aa  106  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1282  chaperonin Cpn10  51.58 
 
 
104 aa  106  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.509292 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3660  co-chaperonin GroES  52.58 
 
 
97 aa  105  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0336408  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3195  co-chaperonin GroES  53.19 
 
 
98 aa  105  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2078  chaperonin Cpn10  51.58 
 
 
104 aa  106  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.354886  normal  0.301492 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1737  co-chaperonin GroES  48.94 
 
 
95 aa  106  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.168742  hitchhiker  0.00175489 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1789  co-chaperonin GroES  51.06 
 
 
103 aa  105  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5464  co-chaperonin GroES  50 
 
 
104 aa  106  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.835161  normal  0.183317 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2504  co-chaperonin GroES  51.06 
 
 
104 aa  105  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16271  co-chaperonin GroES  48.45 
 
 
103 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2610  10 kDa chaperonin (Cpn10), groES  53.19 
 
 
105 aa  105  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000523216  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>