More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A0737 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A0645  co-chaperonin GroES  100 
 
 
96 aa  188  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0733336  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0737  co-chaperonin GroES  100 
 
 
96 aa  188  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.060744  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2029  co-chaperonin GroES  98.96 
 
 
96 aa  187  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.218748  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1939  co-chaperonin GroES  96.88 
 
 
96 aa  181  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1568  co-chaperonin GroES  90.43 
 
 
96 aa  176  8e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0136  co-chaperonin GroES  88.3 
 
 
96 aa  173  7e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0500096  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2615  co-chaperonin GroES  86.46 
 
 
96 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.983112 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3452  co-chaperonin GroES  86.46 
 
 
96 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.225017  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5272  co-chaperonin GroES  86.46 
 
 
96 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.834518 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3523  co-chaperonin GroES  85.42 
 
 
96 aa  169  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.85375  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3996  co-chaperonin GroES  84.38 
 
 
96 aa  167  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0806135 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3954  co-chaperonin GroES  81.25 
 
 
97 aa  159  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000645476  normal  0.0983553 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0863  co-chaperonin GroES  82.11 
 
 
96 aa  159  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000337259  normal  0.081408 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3816  co-chaperonin GroES  82.11 
 
 
96 aa  159  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125602  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2334  co-chaperonin GroES  82.11 
 
 
96 aa  158  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0638712  normal  0.0156201 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2529  co-chaperonin GroES  80.21 
 
 
97 aa  157  7e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0262789 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3118  co-chaperonin GroES  79.17 
 
 
97 aa  156  9e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.143414  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0911  co-chaperonin GroES  79.17 
 
 
97 aa  156  9e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.740154  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2002  co-chaperonin GroES  79.17 
 
 
97 aa  156  9e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2741  co-chaperonin GroES  79.17 
 
 
97 aa  156  9e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.260788  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3176  co-chaperonin GroES  79.17 
 
 
97 aa  156  9e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.521457  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1864  co-chaperonin GroES  79.17 
 
 
97 aa  156  9e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.563369  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1457  co-chaperonin GroES  79.17 
 
 
97 aa  156  9e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3154  co-chaperonin GroES  79.17 
 
 
97 aa  156  9e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0732  co-chaperonin GroES  79.17 
 
 
97 aa  156  9e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138377  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0749  co-chaperonin GroES  79.17 
 
 
97 aa  156  9e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0685029 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0830  co-chaperonin GroES  80.21 
 
 
97 aa  155  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000337917  decreased coverage  0.00000232712 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0377  co-chaperonin GroES  80.21 
 
 
97 aa  155  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00305942  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0859  co-chaperonin GroES  80.21 
 
 
97 aa  155  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00336057  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2657  co-chaperonin GroES  77.89 
 
 
96 aa  154  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0615  co-chaperonin GroES  77.89 
 
 
96 aa  154  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0242301 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1519  co-chaperonin GroES  76.84 
 
 
96 aa  152  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000013656  normal  0.699142 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0641  co-chaperonin GroES  78.72 
 
 
96 aa  152  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1806  co-chaperonin GroES  77.89 
 
 
96 aa  152  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265316  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0534  co-chaperonin GroES  77.89 
 
 
96 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0578  co-chaperonin GroES  78.72 
 
 
96 aa  151  4e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.196352  normal  0.456012 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0427  co-chaperonin GroES  74.74 
 
 
96 aa  147  4e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0874691  normal  0.929555 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0482  co-chaperonin GroES  76.6 
 
 
96 aa  146  7e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0092  co-chaperonin GroES  73.96 
 
 
96 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000241636  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0425  co-chaperonin GroES  73.4 
 
 
96 aa  144  6e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.1607099999999999e-20  hitchhiker  0.002869 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0658  co-chaperonin GroES  72.63 
 
 
96 aa  142  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.00000000933767  decreased coverage  0.00156326 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0365  co-chaperonin GroES  69.79 
 
 
96 aa  142  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000241312  hitchhiker  0.00832872 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0700  co-chaperonin GroES  68.42 
 
 
96 aa  140  7e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.210155  normal  0.0126966 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0678  co-chaperonin GroES  68.42 
 
 
96 aa  140  7e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.651132  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0760  co-chaperonin GroES  71.58 
 
 
96 aa  140  7e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000383794  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5660  co-chaperonin GroES  70.21 
 
 
96 aa  140  8e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00582828  hitchhiker  0.00523053 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1119  chaperonin Cpn10  71.58 
 
 
96 aa  138  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1132  co-chaperonin GroES  70.53 
 
 
96 aa  136  7.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000135765  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2566  co-chaperonin GroES  68.09 
 
 
96 aa  135  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000246528  normal  0.0576287 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0946  chaperonin Cpn10  68.42 
 
 
96 aa  135  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0150753  normal  0.737465 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3428  chaperonin Cpn10  66.67 
 
 
105 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3082  chaperonin Cpn10  66.67 
 
 
105 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2345  co-chaperonin GroES  70.53 
 
 
96 aa  133  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000000286758  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1419  chaperonin Cpn10  70.83 
 
 
96 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0269029  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5284  co-chaperonin GroES  64.89 
 
 
104 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.262452 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3233  co-chaperonin GroES  65.96 
 
 
105 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.211647  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2228  co-chaperonin GroES  65.96 
 
 
105 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.145562  normal  0.505926 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6393  chaperonin Cpn10  67.71 
 
 
105 aa  131  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.673453  normal  0.108093 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6097  chaperonin Cpn10  67.71 
 
 
105 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2458  co-chaperonin GroES  64.89 
 
 
104 aa  130  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2610  10 kDa chaperonin (Cpn10), groES  66.67 
 
 
105 aa  130  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000523216  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4543  10 kDa chaperonin (Cpn10), groES  66.67 
 
 
105 aa  130  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000123576  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5254  chaperonin Cpn10  66.32 
 
 
105 aa  130  6e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.321205  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1672  co-chaperonin GroES  66.3 
 
 
98 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.723246  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1837  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 
98 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.747297  normal  0.0192495 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6726  chaperonin Cpn10  63.16 
 
 
105 aa  126  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1332  co-chaperonin GroES  61.7 
 
 
98 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1737  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 
95 aa  125  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.168742  hitchhiker  0.00175489 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3391  chaperonin, 10 kDa  63.54 
 
 
105 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.974932  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2191  co-chaperonin GroES  61.7 
 
 
105 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3429  chaperonin, 10 kDa  63.54 
 
 
105 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000999948  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3171  co-chaperonin GroES  61.7 
 
 
105 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.50399  normal  0.859314 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1581  chaperonin Cpn10  62.11 
 
 
105 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3425  chaperonin, 10 kDa  63.54 
 
 
105 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6250  chaperonin Cpn10  62.11 
 
 
105 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.646299 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3339  co-chaperonin GroES  58.95 
 
 
95 aa  124  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.148697  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2573  co-chaperonin GroES  63.04 
 
 
98 aa  124  3e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.320362  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4126  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 
98 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.505672  normal  0.752904 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2928  chaperonin Cpn10  59.38 
 
 
96 aa  124  5e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000296393  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1165  chaperonin Cpn10  60.64 
 
 
96 aa  124  5e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.731664  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0794  co-chaperonin GroES  61.7 
 
 
95 aa  124  6e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0142401 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1177  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 
105 aa  123  8.000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.510717  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0674  chaperonin Cpn10  60.64 
 
 
95 aa  122  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248436  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4265  chaperonin Cpn10  58.33 
 
 
104 aa  122  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228969  normal  0.0528982 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4725  co-chaperonin GroES  59.14 
 
 
98 aa  122  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2593  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 
105 aa  123  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.458654  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2803  co-chaperonin GroES  60 
 
 
95 aa  123  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000132343  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2504  co-chaperonin GroES  56.84 
 
 
104 aa  122  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0344  chaperonin, 10 kDa  61.46 
 
 
105 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.272822  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2431  chaperonin, 10 kDa  61.46 
 
 
105 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.564469  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4783  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 
96 aa  122  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0265575  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2616  chaperonin, 10 kDa  61.46 
 
 
105 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.804052  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7829  chaperonin Cpn10  59.57 
 
 
95 aa  122  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5250  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 
96 aa  122  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.584342  normal  0.464773 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1205  chaperonin, 10 kDa  61.46 
 
 
105 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5326  co-chaperonin GroES  59.38 
 
 
96 aa  122  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.769005  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2175  chaperonin Cpn10  58.95 
 
 
96 aa  121  3e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.95289 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1770  chaperonin Cpn10  59.57 
 
 
95 aa  121  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0933044  normal  0.173989 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2078  chaperonin Cpn10  55.79 
 
 
104 aa  121  4e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.354886  normal  0.301492 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5366  chaperonin Cpn10  57.45 
 
 
95 aa  121  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.583884  normal  0.676466 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>