More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0934 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0934  co-chaperonin GroES  100 
 
 		 88 aa  169  1e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6246  chaperonin Cpn10  57.3 
 
 		 93 aa  102  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0309  hypothetical protein  56.18 
 
 		 92 aa  99.8  1e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1844  co-chaperonin GroES  50.56 
 
 		 91 aa  98.2  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.986067  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0765  co-chaperonin GroES  50 
 
 		 90 aa  94.7  3e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1919  chaperonin Cpn10  50 
 
 		 100 aa  94.4  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1547  co-chaperonin GroES  50.53 
 
 		 95 aa  94.7  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.807216  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1827  co-chaperonin GroES  51.72 
 
 		 92 aa  94  6e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0862396 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0316  chaperonin Cpn10  49.44 
 
 		 92 aa  93.2  9e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0011552  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0985  chaperonin Cpn10  53.93 
 
 		 98 aa  93.6  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.844996  normal  0.719219 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2803  co-chaperonin GroES  50.53 
 
 		 95 aa  93.2  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000132343  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1937  co-chaperonin GroES  47.37 
 
 		 95 aa  92.8  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000542677  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1195  co-chaperonin GroES  51.58 
 
 		 95 aa  93.2  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0507909  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2474  co-chaperonin GroES  50.53 
 
 		 95 aa  92  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0230053  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0833  co-chaperonin GroES  47.87 
 
 		 95 aa  91.7  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000406281  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3063  co-chaperonin GroES  50.53 
 
 		 95 aa  92  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428511 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0679  co-chaperonin GroES  45.26 
 
 		 95 aa  91.3  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.221594 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3339  co-chaperonin GroES  50.53 
 
 		 95 aa  90.9  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.148697  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00675  co-chaperonin GroES  49.44 
 
 		 91 aa  90.9  5e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1405  co-chaperonin GroES  53.76 
 
 		 94 aa  90.9  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000307277  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0521  co-chaperonin GroES  48.31 
 
 		 89 aa  90.9  6e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.125145 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0497  co-chaperonin GroES  46.32 
 
 		 95 aa  90.5  6e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000741059  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2733  chaperonin Cpn10  51.69 
 
 		 98 aa  90.5  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.958869 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0782  co-chaperonin GroES  46.32 
 
 		 95 aa  90.5  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000134232  normal  0.229637 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1305  co-chaperonin GroES  47.87 
 
 		 94 aa  89.4  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000222526  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0160  chaperonin Cpn10  49.46 
 
 		 94 aa  89.4  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0028  co-chaperonin GroES  50.53 
 
 		 95 aa  89  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.32588e-17  normal  0.625386 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2008  chaperonin Cpn10  46.24 
 
 		 94 aa  88.2  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.377969  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2130  chaperonin Cpn10  47.37 
 
 		 95 aa  88.6  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000318883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0225  chaperonin Cpn10  47.19 
 
 		 88 aa  87.8  4e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2295  chaperonin Cpn10  53.41 
 
 		 88 aa  87.8  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1789  co-chaperonin GroES  54.35 
 
 		 103 aa  87.4  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2855  co-chaperonin GroES  52.69 
 
 		 103 aa  87.4  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0958  co-chaperonin GroES  48.42 
 
 		 96 aa  87.4  5e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0512  co-chaperonin GroES  47.87 
 
 		 94 aa  87.8  5e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3241  co-chaperonin GroES  52.69 
 
 		 103 aa  87.4  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.257157  normal  0.413821 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4151  co-chaperonin GroES  51.58 
 
 		 96 aa  87  8e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0190602  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2928  chaperonin Cpn10  45.26 
 
 		 96 aa  86.7  9e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000296393  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4306  co-chaperonin GroES  47.37 
 
 		 96 aa  86.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235031  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0251  co-chaperonin GroES  44.57 
 
 		 94 aa  85.5  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000150313  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1180  chaperonin Cpn10  48.42 
 
 		 127 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0241756 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0541  co-chaperonin GroES  44.68 
 
 		 95 aa  85.5  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000000160733  normal  0.58747 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1109  co-chaperonin GroES  47.83 
 
 		 94 aa  85.9  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5366  chaperonin Cpn10  44.21 
 
 		 95 aa  85.5  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.583884  normal  0.676466 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1153  chaperonin Cpn10  48.42 
 
 		 127 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0362  chaperonin Cpn10  45.65 
 
 		 102 aa  85.9  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.686615  normal  0.421985 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1170  chaperonin Cpn10  48.42 
 
 		 127 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.480442 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3627  co-chaperonin GroES  50 
 
 		 103 aa  84.7  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.711938  normal  0.0667876 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0379  chaperonin Cpn10  48.39 
 
 		 95 aa  85.1  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000945621  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3678  chaperonin Cpn10  48.96 
 
 		 100 aa  84.7  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00275768  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4453  chaperonin Cpn10  46.32 
 
 		 102 aa  84.3  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5138  co-chaperonin GroES  50 
 
 		 103 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0230  co-chaperonin GroES  48.91 
 
 		 94 aa  84.7  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000701184  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1076  chaperonin Cpn10  46.88 
 
 		 98 aa  84.3  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.12184  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2927  chaperonin Cpn10  51.09 
 
 		 96 aa  84.3  5e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0586  chaperonin Cpn10  50 
 
 		 95 aa  84.3  5e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.515387  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0033  chaperonin Cpn10  56.32 
 
 		 89 aa  84.3  5e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1407  chaperonin Cpn10  48.91 
 
 		 96 aa  84.3  5e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.780371 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5027  co-chaperonin GroES  45.65 
 
 		 94 aa  84  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000449913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0297  co-chaperonin GroES  45.65 
 
 		 94 aa  84  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000149482  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4925  co-chaperonin GroES  48.42 
 
 		 100 aa  84  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2175  chaperonin Cpn10  48.42 
 
 		 96 aa  84  6e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.95289 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1494  co-chaperonin GroES  48.42 
 
 		 100 aa  84  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0449  chaperonin Cpn10  44.21 
 
 		 95 aa  84  6e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00196884  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0706  co-chaperonin GroES  44.21 
 
 		 96 aa  84  7e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1088  chaperonin Cpn10  50 
 
 		 98 aa  84  7e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000000466109  normal  0.037414 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5811  chaperonin Cpn10  47.37 
 
 		 97 aa  84  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.907137  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0443  chaperonin Cpn10  44.21 
 
 		 97 aa  84  7e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0288  co-chaperonin GroES  44.57 
 
 		 94 aa  83.6  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000514345  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0252  co-chaperonin GroES  44.57 
 
 		 94 aa  83.6  8e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000529101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0238  co-chaperonin GroES  44.57 
 
 		 94 aa  83.6  8e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.27511e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0239  co-chaperonin GroES  44.57 
 
 		 94 aa  83.6  8e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000442423  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0292  co-chaperonin GroES  44.57 
 
 		 94 aa  83.6  8e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0316  co-chaperonin GroES  44.57 
 
 		 94 aa  83.6  8e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000403137  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0266  co-chaperonin GroES  44.57 
 
 		 94 aa  83.6  8e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164514  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1530  co-chaperonin GroES  48.91 
 
 		 103 aa  83.6  8e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16271  co-chaperonin GroES  48.91 
 
 		 103 aa  83.6  8e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0611  Chaperonin Cpn10  51.09 
 
 		 98 aa  83.6  8e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.740191  normal  0.337946 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13452  co-chaperonin GroES  47.37 
 
 		 100 aa  83.6  8e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000956292  hitchhiker  0.00171205 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3373  chaperonin Cpn10  46.24 
 
 		 94 aa  83.6  8e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0564  chaperonin Cpn10  46.74 
 
 		 102 aa  83.6  8e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16391  co-chaperonin GroES  47.83 
 
 		 103 aa  83.6  9e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2891  co-chaperonin GroES  51.06 
 
 		 94 aa  83.6  9e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2885  chaperonin cpn10  47.83 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.478438  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1086  chaperonin Cpn10  47.31 
 
 		 98 aa  82.8  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.692359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3714  co-chaperonin GroES  45.74 
 
 		 97 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.31168 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3842  chaperonin Cpn10  47.31 
 
 		 102 aa  82.8  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0120  chaperonin Cpn10  48.42 
 
 		 96 aa  83.2  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18371  co-chaperonin GroES  50 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0969  co-chaperonin GroES  50 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.698543  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2625  chaperonin Cpn10  51.58 
 
 		 96 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0145  co-chaperonin GroES  44.09 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5326  co-chaperonin GroES  48.94 
 
 		 96 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.769005  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1595  Chaperonin Cpn10  51.76 
 
 		 88 aa  82.4  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000279872  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1231  chaperonin Cpn10  45.26 
 
 		 96 aa  82.4  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5250  co-chaperonin GroES  48.94 
 
 		 96 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.584342  normal  0.464773 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3096  chaperonin Cpn10  45.26 
 
 		 104 aa  82  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4783  co-chaperonin GroES  48.94 
 
 		 96 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0265575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4232  chaperonin Cpn10  46.24 
 
 		 104 aa  82.4  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0774007 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2340  chaperonin Cpn10  44.21 
 
 		 96 aa  82  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.4787  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>