More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0782 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0782  co-chaperonin GroES  100 
 
 		 95 aa  188  2.9999999999999997e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000134232  normal  0.229637 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1937  co-chaperonin GroES  93.68 
 
 		 95 aa  178  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000542677  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0497  co-chaperonin GroES  92.63 
 
 		 95 aa  176  1e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000741059  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0833  co-chaperonin GroES  92.55 
 
 		 95 aa  175  1e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000406281  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0679  co-chaperonin GroES  90.53 
 
 		 95 aa  175  2e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.221594 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0541  co-chaperonin GroES  90.43 
 
 		 95 aa  169  7.999999999999999e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000000160733  normal  0.58747 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1305  co-chaperonin GroES  89.36 
 
 		 94 aa  169  9e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000222526  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1919  chaperonin Cpn10  61.05 
 
 		 100 aa  125  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2474  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 		 95 aa  123  7e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0230053  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2175  chaperonin Cpn10  60 
 
 		 96 aa  122  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.95289 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0160  chaperonin Cpn10  61.29 
 
 		 94 aa  122  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1195  co-chaperonin GroES  61.05 
 
 		 95 aa  122  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0507909  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2803  co-chaperonin GroES  60 
 
 		 95 aa  120  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000132343  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0985  chaperonin Cpn10  65.96 
 
 		 98 aa  120  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.844996  normal  0.719219 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3063  co-chaperonin GroES  60 
 
 		 95 aa  120  8e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428511 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6246  chaperonin Cpn10  65.96 
 
 		 93 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1547  co-chaperonin GroES  61.05 
 
 		 95 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.807216  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4306  co-chaperonin GroES  57.89 
 
 		 96 aa  118  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235031  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5464  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 		 104 aa  118  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.835161  normal  0.183317 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2928  chaperonin Cpn10  56.84 
 
 		 96 aa  118  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000296393  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0309  hypothetical protein  64.89 
 
 		 92 aa  117  3.9999999999999996e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7829  chaperonin Cpn10  57.45 
 
 		 95 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5848  chaperonin Cpn10  51.58 
 
 		 104 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1231  chaperonin Cpn10  58.95 
 
 		 96 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0794  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 		 95 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0142401 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2190  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 		 95 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3339  co-chaperonin GroES  53.68 
 
 		 95 aa  117  7e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.148697  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1768  chaperonin Cpn10  57.45 
 
 		 95 aa  117  7e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.939398  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3096  chaperonin Cpn10  55.79 
 
 		 104 aa  117  7e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0379  chaperonin Cpn10  58.06 
 
 		 95 aa  116  7.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000945621  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0984  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 		 95 aa  116  9e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2310  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 		 95 aa  116  9e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3033  co-chaperonin GroES  56.84 
 
 		 104 aa  116  9e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.960902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0409  co-chaperonin GroES  54.84 
 
 		 98 aa  116  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0028  co-chaperonin GroES  54.74 
 
 		 95 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.32588e-17  normal  0.625386 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0232  chaperonin Cpn10  58.95 
 
 		 96 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6083  co-chaperonin GroES  54.84 
 
 		 98 aa  116  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1165  chaperonin Cpn10  56.38 
 
 		 96 aa  116  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.731664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0674  chaperonin Cpn10  56.38 
 
 		 95 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248436  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2191  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 		 105 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2008  chaperonin Cpn10  54.84 
 
 		 94 aa  115  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.377969  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3359  co-chaperonin GroES  56.38 
 
 		 95 aa  115  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.755845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0471  co-chaperonin GroES  54.84 
 
 		 98 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0516  co-chaperonin GroES  54.84 
 
 		 98 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218545 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5039  chaperonin Cpn10  53.68 
 
 		 104 aa  114  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1737  co-chaperonin GroES  55.32 
 
 		 95 aa  115  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.168742  hitchhiker  0.00175489 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2733  chaperonin Cpn10  62.77 
 
 		 98 aa  114  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.958869 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3195  co-chaperonin GroES  56.38 
 
 		 98 aa  114  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0453  chaperonin Cpn10  56.38 
 
 		 95 aa  114  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2078  chaperonin Cpn10  56.84 
 
 		 104 aa  115  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.354886  normal  0.301492 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5581  chaperonin Cpn10  57.45 
 
 		 95 aa  115  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0248  chaperonin Cpn10  57.89 
 
 		 96 aa  114  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000171869  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3375  chaperonin Cpn10  57.45 
 
 		 95 aa  115  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0900877 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0183  chaperonin Cpn10  57.89 
 
 		 96 aa  114  3e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0958  co-chaperonin GroES  52.63 
 
 		 96 aa  115  3e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0291  Chaperonin Cpn10  57.89 
 
 		 96 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0587447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0449  chaperonin Cpn10  55.79 
 
 		 95 aa  114  5e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00196884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0358  chaperonin Cpn10  56.99 
 
 		 98 aa  114  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0120  chaperonin Cpn10  60 
 
 		 96 aa  114  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1770  chaperonin Cpn10  55.32 
 
 		 95 aa  114  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0933044  normal  0.173989 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4586  co-chaperonin GroES  56.38 
 
 		 95 aa  114  6e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.480478 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1282  chaperonin Cpn10  52.63 
 
 		 104 aa  113  6.9999999999999995e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.509292 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5326  co-chaperonin GroES  55.32 
 
 		 96 aa  113  7.999999999999999e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.769005  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0706  co-chaperonin GroES  54.74 
 
 		 96 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4783  co-chaperonin GroES  55.32 
 
 		 96 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0265575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5250  co-chaperonin GroES  55.32 
 
 		 96 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.584342  normal  0.464773 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0586  chaperonin Cpn10  55.32 
 
 		 95 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.515387  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5284  co-chaperonin GroES  56.38 
 
 		 104 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.262452 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0512  co-chaperonin GroES  58.95 
 
 		 94 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3027  chaperonin Cpn10  56.38 
 
 		 121 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2458  co-chaperonin GroES  55.32 
 
 		 104 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1405  co-chaperonin GroES  56.38 
 
 		 94 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000307277  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0535  co-chaperonin GroES  55.32 
 
 		 96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.235794  normal  0.722093 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1844  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 		 91 aa  112  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.986067  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3627  co-chaperonin GroES  58.06 
 
 		 103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.711938  normal  0.0667876 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1672  co-chaperonin GroES  58.06 
 
 		 98 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.723246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4151  co-chaperonin GroES  55.79 
 
 		 96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0190602  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5829  10 KD chaperonin (protein CPN10)  55.91 
 
 		 98 aa  112  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0158717  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2593  co-chaperonin GroES  57.45 
 
 		 105 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.458654  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0251  co-chaperonin GroES  54.35 
 
 		 94 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000150313  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0296  chaperonin Cpn10  57.45 
 
 		 97 aa  112  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.018883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0234  chaperonin GroS  59.57 
 
 		 97 aa  111  3e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5366  chaperonin Cpn10  53.68 
 
 		 95 aa  111  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.583884  normal  0.676466 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4265  chaperonin Cpn10  54.74 
 
 		 104 aa  111  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228969  normal  0.0528982 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3233  co-chaperonin GroES  54.26 
 
 		 105 aa  111  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.211647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4725  co-chaperonin GroES  54.84 
 
 		 98 aa  111  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2228  co-chaperonin GroES  54.26 
 
 		 105 aa  111  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.145562  normal  0.505926 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1173  co-chaperonin GroES  54.35 
 
 		 98 aa  112  3e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.749354  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0443  chaperonin Cpn10  55.91 
 
 		 97 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0545  chaperonin Cpn10  59.34 
 
 		 94 aa  111  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000554341  normal  0.812353 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1177  co-chaperonin GroES  55.32 
 
 		 105 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.510717  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0596  co-chaperonin GroES  56.38 
 
 		 95 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.474477  normal  0.0912075 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1827  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 		 92 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0862396 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2114  co-chaperonin GroES  52.63 
 
 		 104 aa  110  5e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3335  chaperonin Cpn10  52.13 
 
 		 96 aa  110  5e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2922  co-chaperonin GroES  55.79 
 
 		 96 aa  110  5e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000127335  n/a   
 
 
 
NC_011004  Rpal_1332  co-chaperonin GroES  54.26 
 
 		 98 aa  110  5e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3660  chaperonin Cpn10  52.13 
 
 		 96 aa  110  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.39196  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00675  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 		 91 aa  110  5e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3171  co-chaperonin GroES  54.26 
 
 		 105 aa  110  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.50399  normal  0.859314 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>